河北测序全转录组

LC-MS/MS检测核酸修饰水平实验原理：云序生物建立了一种基于LC-MS/MS平台的核酸修饰分析方法，定量4类DNA修饰（5-mdC、5-hmdC、5-fodC、6-mdA）和9类RNA修饰（m5C、m6A、Am、Gm、Cm、Um、m1A、m7G、ac4C），为表观遗传研究提供理想的技术平台。液相色谱串联质谱（LC-MS/MS）能够很好的检测到极性高、稳定性差的化合物，并能够对物质进行精确的定量。LC-MS/MS法是目前所有总体甲基化水平分析方法中能够对含量极低的修饰碱基进行准确定性定量的方法；而将LCMS/MS法与一定的样品前处理方法相结合，能够更好地对各类生物样品中的DNA/RNA修饰进行检测。云序拥有专业的生物信息学团队，开发了高效识别分析环状DNA的算法。河北测序全转录组

ac4c样品要求样品类型细胞、组织或RNA，其他样本类型请电询。样品量a）细胞：≥2×107b）组织：500mg-1gc)RNA：30μg-300μgd)超微量满足500ng-30μg样品运输与保存样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。样品保存：细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后-80℃保存；RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，避免反复冻融。目前，环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物，还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。中国台湾测序RNA甲基化适用于任何物种：可以检测几乎任何动植物的环状RNA。

技术简介针对血清血浆微量样品，云序生物参考卢煜明教授团队开发的方法，酶切去除线性DNA后，利用Tn5转座酶，打开环状DNA环状结构并同时在DNA的片段两端加上接头，进行建库及测序。Tn5转座酶法效率高，损耗低，实现血液循环系统中微量的环状DNA的检测。并且本产品能保留环状DNA的原始表达量，使得不同环状DNA间的表达量的比较更为准确。并通过严谨的环状DNA生信流程，实现了对环状DNA准确的识别和详细的基因注释。目前，环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物，还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。

样本要求 样品类型： 细胞、组织、基因组DNA。其它类型样品请详询。 样品量： a）细胞 2×107 b）组织 200 mg c）DNA：>=10 µg，溶于无菌水或 TE（PH = 8）（OD 260/280值应在1.7～2.0 之间；RNA 应该去除干净；不得有其它个体或其它物种的DNA污染）。 样品运输及保存： 样品运输：样品置于1.5mL Eppendorf管中，封口膜封好，干冰运输，DNA可用冰袋运输。 样品保存：细胞样品或新鲜组织块切块，液氮冻存后-80℃保存；DNA样品短期内可-20℃，避免反复冻融。m6A环状RNA测序，云序生物提供成熟m6A RNA甲基化MeRIP-seq服务。

m6A修饰就是真核生物mRNA中较常见存在的一种修饰形式，得到了常见的关注和研究。除此之外，还存在着一种分子结构上非常相似的RNA修饰形式：m6Am——在m6A修饰的基础上，同一个腺苷酸残基的核糖的2’羟基也被甲基化，产生2’甲氧基结构（2’-O-CH3）。与m6A的常见分布所不同的是，m6Am修饰的分布主要局限于mRNA5’帽子结构下游的较早核苷酸残基上发生。该位点的m6Am修饰在进化上高度保守，无论是在斑马鱼、小鼠还是人类细胞中均有发现。每个样品组做一个Input，以去除基因组背景，降低假阳性率 。中国台湾测序RNA甲基化

云序生物利用启动子区(TSS-2000-TSS+2000)差异富集峰对应的基因进行GO功能分析。河北测序全转录组

样本要求：样品类型：细胞、组织或RNA，其他样本类型请电询。样品量：a)细胞：2×107b)组织：100mg-1gc)RNA：30-300μg（OD260/280：1.6-2.3；RNA无明显降解28S:18S>1.5或RIN>7）样品运输及保存：样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。样品保存：细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，避免反复冻融。目前，环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物，还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。河北测序全转录组

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