山东文章 环状DNA

长度分布与来源探索eccDNA是环状结构，这样一种分子的长度分布如何？测序结果显示99%的eccDNA长度小于25Kb，其中only有占比约1%的分子大于25Kb。在这99%当中，在0.1Kb以及5Kb处有富集峰，这表明该区段的eccDNA占绝大多数。经典的知识体系告诉我们重复序列以及5sRNA部分best容易成环，事实上测序结果也充分证明这一点，SINE（3.1%）、LINE（3.5%），中心粒（2.0%），以及sRNA（8.1%）部分是best经典的成环结构，大量的环能够匹配到这些区域。富集后，通过NGS测序高通量地检测细胞中所有的环状DNA分子。山东文章 环状DNA

染色体外环状DNA(EccDNA)是指起源于染色体的环状DNA，但一旦产生，这些DNA很可能独li于染色体DNA。1964年Alix Bassel和Yasuo Hoota首先发现了位于细胞核内的eccDNA，被称为双分钟(Dms)。Eccdnabest初是通过核型鉴定为独li于染色体存在于ai细胞中的dna，但由于技术的进步，特别是下一代测序和生物信息学的进步，eccna已经成为一种新的分子，其众多的特征和功能被发现。 EccDNA的长度足以容纳它们自己的复制起点，能够编码氨基酸，并且已经在tumour组织中观察到，在ai症医治中，它们best常含有ai基因或与耐药相关的基因。EccDNA的其他功能，如在衰老和异质性中的功能，以及可能的作用，包括剂量补偿，已经逐渐被发现。已知ai细胞内的基因型多样性和基因组可塑性受到基因组不稳定和基因组改变的影响。EccDNA可以通过其多样性（包括结构，功能和数量多样性）快速重塑基因组，从而有效地推动ai症和生命的进化。浙江文章 环状DNA游离于染色体基因组之外的DNA 被发现常常以环状的形式存在，这种形式的DNA被称为环状DNA 。

云序eccDNA测序优势一站式服务客户只需提供细胞、组织或基因组DNA，云序生物为您完成从eccDNA富集，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。eccDNA检出率高采用多种方法高效地富集eccDNA，eccDNA检出率高。专业的生物信息学分析专业的生物信息学团队，开发了高效识别分析eccDNA的算法，满足客户的各类深入数据分析需求。样本要求样品类型：细胞、组织、基因组DNA。其它类型样品请详询。样品量：a）细胞2×107b）组织100mgc）DNA：每个样品总量不少于10ug，溶于无菌水或TE（PH=8）（OD260/280值应在1.7～2.0之间；RNA应该去除干净；不得有其它个体或其它物种的DNA污染）。样品运输及保存：样品运输：样品置于1.5mLEppendorf管中，封口膜封好，干冰运输，DNA可用冰袋运输。样品保存：细胞样品或新鲜组织块切块，液氮冻存后-80℃保存；DNA样品短期内可-20℃，避免反复冻融。

长期以来困扰eccDNA研究者的一大障碍，就是eccDNA的分离纯化的有效性问题。以往的eccDNA分离纯化技术，往往单纯依赖于对非环状DNA的去除，然而外切酶对线性DNA无法做到完全消化，经电镜观察检验，仍有大量线性DNA残留，导致分离纯化的eccDNA不纯。除此以外，传统eccDNA提取方法中所使用的细胞裂解液当中含有的NaOH也对DNA的环状结构具有不可逆的破坏作用，导致部分eccDNA的丢失；对分离纯化后的eccDNA所进行的滚环扩增，也可能造成不同大小环状DNA之间扩增倍数的差异。为了改善以上种种不足，张毅教授团队的研究者们设计了一种高效的eccDNA纯化新技术。专业的生物信息学团队，通过优化的算法能够高效识别染色体外环状DNA。

样品类型：组织、细胞、血清血浆或DNA样品。样品量：a）细胞：2×107b）组织：200mgc）血清血浆：5mLd）DNA：>=10µg，溶于无菌水或TE（PH=8）（OD260/280值应在1.7～2.0之间；RNA应该去除干净；不得有其它个体或其它物种的DNA污染）。样品运输及保存：样品运输：样品置于1.5mLEppendorf管中，封口膜封好，干冰运输，DNA可用冰袋运输。样品保存：细胞样品或新鲜组织块切块，液氮冻存后-80℃保存；DNA样品短期内可-20℃，避免反复冻融。环状DNA促进染色质的开放和促ai基因的表达。天津文章 环状DNA

目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA, 而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。山东文章 环状DNA

人血浆中细胞游离的DNA（cfDNA）的片段化模式是引起人们普遍研究的领域。在怀孕期间，观察到胎儿血浆DNA（主要是胎盘来源）是线性DNA的片段，比母体来源（主要是造血来源）DNA短。有研究报道了人和鼠血浆中存在染色体外环状DNA（eccDNA）。但是，尚无有关孕妇血浆中eccDNA的公开数据。2020年1月3日，香港大学卢煜明团队在PNAS 在线发表题为“Identification and characterization of extrachromosomal circular DNA in maternal plasma”的研究论文。山东文章 环状DNA

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