上海修饰测序RNA甲基化

LC-MS/MS检测核酸修饰水平实验原理：云序生物建立了一种基于LC-MS/MS平台的核酸修饰分析方法，定量4类DNA修饰（5-mdC、5-hmdC、5-fodC、6-mdA）和9类RNA修饰（m5C、m6A、Am、Gm、Cm、Um、m1A、m7G、ac4C），为表观遗传研究提供理想的技术平台。液相色谱串联质谱（LC-MS/MS）能够很好的检测到极性高、稳定性差的化合物，并能够对物质进行精确的定量。LC-MS/MS法是目前所有总体甲基化水平分析方法中能够对含量极低的修饰碱基进行准确定性定量的方法；而将LCMS/MS法与一定的样品前处理方法相结合，能够更好地对各类生物样品中的DNA/RNA修饰进行检测。云序生物提供了成熟的 RNA O8G氧化MeRIP-Seq技术服务。上海修饰测序RNA甲基化

技术简介针对血清血浆微量样品，云序生物参考卢煜明教授团队开发的方法，酶切去除线性DNA后，利用Tn5转座酶，打开环状DNA环状结构并同时在DNA的片段两端加上接头，进行建库及测序。Tn5转座酶法效率高，损耗低，实现血液循环系统中微量的环状DNA的检测。并且本产品能保留环状DNA的原始表达量，使得不同环状DNA间的表达量的比较更为准确。并通过严谨的环状DNA生信流程，实现了对环状DNA准确的识别和详细的基因注释。目前，环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物，还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。云南测序结果环状RNA的表达具有组织和疾病特异性，与组织发育、疾病的发生和发展密切相关。

云序生物率先推出ctDNA甲基化测序服务，低需1ng ctDNA既可进行测序。客户只需提供血浆，血清或体液样本，云序生物为您完成从ctDNA提取，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。 云序生物率先推出两种ctDNA甲基化测序服务。（1）免疫共沉淀测序（MeDIP-Seq）：通过5mC抗体特异性抓取基因组上发生甲基化的ctDNA的片段，并结合高通量测序技术，高性价比检测ctDNA甲基区域；（2）单碱基测序（Bis-Seq）：采用经典重亚硫 酸盐处理的方式，未发生甲基化的C碱基会转换成U，发生甲基化的C碱基还是C，并结合高通量测序技术，可对ctDNA甲基化进行单碱基精确定位。

案例2: m5C RNA甲基化基因组分布图谱 原文：Distinct 5-methylcytosine profiles in poly(A) RNA from mouse embryonic stem cells and brain 期刊：Genome Biology 影响因子：13.21 近期刊登了解析RNA m5C在不同组织细胞的分布图谱相关文章。研究人员选取小鼠胚胎干细胞（ESC）和脑组织（n=3）作为实验样本，利用m5C RNA甲基化测序技术对两组样本中的总RNA和胞核RNA进行检测。结果表明，ESC中总RNA 5mC的分布频率比脑组织的分布频率更高。研究人员将m5C位点和不同的基因组区域（CDS, 5’-UTR, 3’-UTR等）进行了关联分析。结果表明，总RNA中m5C位点更倾向于分布在转录起始位点。脑组织和ESC中，3’-UTR区m5C的分布区别很大，这暗示着3’-UTR区的RNA m5C修饰可能与细胞功能和细胞类型密切相关。云序生物拥有受行业认可的BD Rhapsody™单细胞测序平台。

2-o-甲基化样本要求样品类型细胞、组织或RNA，其他样本类型请电询。样品量a)细胞：1×108b)组织：500mg-5gc)RNA：100μg-300μg(OD260/280：1.6-2.3;RNA无明显降解)样品运输及保存样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。样品保存：细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后-80℃保存；RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，避免反复冻融。目前，环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物，还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。云序采用多种方法高效地富集环状DNA，环状DNA检出率高。山西测序lncRNA

云序生物拥有BD Rhapsody™单细胞免疫组测序平台。上海修饰测序RNA甲基化

样本要求样品类型细胞、组织或RNA，其他样本类型请电询。样品量a)细胞：1×108b)组织：500mg-5gc)RNA：100μg-300μg(OD260/280：1.6-2.3;RNA无明显降解)样品运输及保存样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。样品保存：细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后-80℃保存；RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，避免反复冻融。目前，环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物，还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。上海修饰测序RNA甲基化

上海云序生物科技有限公司是一家有着先进的发展理念，先进的管理经验，在发展过程中不断完善自己，要求自己，不断创新，时刻准备着迎接更多挑战的活力公司，在上海市等地区的商务服务中汇聚了大量的人脉以及客户资源，在业界也收获了很多良好的评价，这些都源自于自身的努力和大家共同进步的结果，这些评价对我们而言是最好的前进动力，也促使我们在以后的道路上保持奋发图强、一往无前的进取创新精神，努力把公司发展战略推向一个新高度，在全体员工共同努力之下，全力拼搏将共同云序供和您一起携手走向更好的未来，创造更有价值的产品，我们将以更好的状态，更认真的态度，更饱满的精力去创造，去拼搏，去努力，让我们一起更好更快的成长！