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近年来,科学家们发现了一种可逆的RNA甲基化—m6A,即RNA分子腺嘌呤第6位氮原子上发生甲基化修饰(N6-methyladenosine,m6A)。研究发现,m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰,m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译,以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。种种研究迹象表明m6A 存在于很多物种中,占到了 RNA甲基化修饰的80%。m6A除了分布在 mRNA 中,也出现在很多非编码 RNA中 ,如:环状RNA 、LncRNA等。Nature正刊发表文章,证实发生m6A RNA甲基化修饰可以调控mRNA稳定性。而随后Cell Research也发表文章,证实环状RNA也会被m6A甲基化修饰,并会促进环状RNA编码蛋白这一有趣的结论。ctDNA 的 5mC 甲基化修饰研究仍然是一个未被充分探索的领域。内蒙古m7G+m3C RNA甲基化

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案例1:哺乳动物mRNA内m7G甲基化转录组图谱 期刊:Molecular Cell 影响因子:14.25 由于全部种类的反转录酶均无法将RNA m7G位点逆转录成对应发生碱基突变的cDNA,为了准确的探究RNA内m7G甲基化情况,何川团队利用m7G自带正电荷的特征,开发了新的m7G单碱基深度测序方法。该方法能够将RNA内含m7G位点转化为另一种可产生反转录碱基变异的新位点,并依据碱基变异率估计m7G位点的甲基化水平。此方法随后也被证实可检测18S rRNA中的1639位内含m7G位点以及可揭示人类细胞tRNA中的22个46位内含m7G位点。并观测到其在mRNA分布、富集的共有序列及其它统计特征与m7G-MeRIP-seq数据基本保持一致。该文章不仅揭示了m7G甲基化在人类细胞中的分布特征,同时还发现METTL1是一种甲基转移酶,它在mRNA中催化了m7G甲基化修饰,并表明m7G的内部甲基化可以影响mRNA的翻译。河北甲基化差异ctDNA 的甲基化检测,同时结合了 ctDNA 测序于 DNA 甲基化测序的优势。

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样品要求 样品类型 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 样品量 a)细胞:≥2×107 b)组织:500mg - 1g c) RNA:30μg - 300μg d) 超微量满足500ng - 30μg 样品运输与保存 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。

案例1:m6Am测序揭示了人类转录组中m6Am甲基化的动态性原文:m6Am-seqrevealsthedynamicm6Ammethylationinthehumantranscriptome期刊:NatureCommunication影响因子:13.78北京大学的研究人员开辟了一种新型的m6Am修饰RNA的测序方法,使用抗体拉取5’帽子片段富集m6Am修饰的RNA区域,再在特定生化环境条件下使用FTO酶来区分m6Am与m6A修饰,进而可达到精细至单碱基水平的m6AmRNA测序。使用该方法对人类转录组测序的结果显示,m6Am修饰的分布主要局限于mRNA5’帽子下游的翻译起始位点,并且多数具有BCA的序列motif特征(B=C/U/G)。对细胞施予热激、低氧等应激性刺激时,细胞转录组的m6Am水平有明显上升,说明RNA的m6Am动态修饰可能参与了细胞应激性反应。针对低氧环境刺激的进一步GO分析显示,m6Am水平升高的基因与内质网应激调节的生物学过程有关。目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术。

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云序优势单碱基分辨可对2’-O-RNA甲基化修饰进行单碱基定位。高通量检测可对全转录组范围内的2’-O-RNA位点进行高通量地平行检测。全分子覆盖可较全地对mRNA、LncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的2’-O-RNA甲基化位点进行检测。一站式服务客户需提供组织或细胞,云序生物一站式完成RNA抽提,样品预处理,建库,测序,数据分析全套流程。专业的生物信息学分析专业的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求。m7G RNA甲基化修饰能够调节mRNA的转录。dna 羟甲基化水平

除了拟南芥,在其他植物中如番茄、小麦、玉米以及高粱等均发现了RNA m6A甲基化修饰。内蒙古m7G+m3C RNA甲基化

案例2:2’-O-RNA甲基化酶FTSJ3协助HIV病毒逃避宿主细胞免疫识别机制原文:FTSJ3isanRNA2’-O-methyltransferaserecruitedbyHIVtoavoidinnateimmunesensing期刊:Nature影响因子:41.6外国研究人员首先借助蛋白互作实验证实TRBP蛋白能够在不依赖于DICER酶的作用下与FTSJ3结合,形成复合物,因此推测,FTSJ3是一种2-O-甲基化转移酶。接着,体外和体内实验表明FTSJ3就是一种通过TRBP被招募到HIVRNA上的2-O-甲基化转移酶。通过优化的2’-O-RNA甲基化测序手段,证实在HIV病毒遗传信息的特定位置上存在依赖于FTSJ3的2-O-甲基化修饰。综上,该研究证实TRBP-FTSJ3复合物通过招募到HIV病毒RNA发生2-O-甲基化从而解释了HIV病毒逃避宿主细胞先天免疫识别的机制。内蒙古m7G+m3C RNA甲基化

上海云序生物科技有限公司办公设施齐全,办公环境优越,为员工打造良好的办公环境。致力于创造***的产品与服务,以诚信、敬业、进取为宗旨,以建高通量测序,测序合成,科研,技术服务产品为目标,努力打造成为同行业中具有影响力的企业。公司以用心服务为重点价值,希望通过我们的专业水平和不懈努力,将上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。等业务进行到底。上海云序生物科技有限公司主营业务涵盖RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体,坚持“质量保证、良好服务、顾客满意”的质量方针,赢得广大客户的支持和信赖。

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