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研究背景:造血干细胞(HSC)自我更新和分化之间的平衡打破将导致骨髓衰竭及恶性血液tumour发生。然而,HSCs如何维持其静止状态并避免I型干扰素(IFN)介导能量耗竭、细胞凋亡仍未可知。本文一种名为cia-cGAS的环状RNA,它在长效(LT)-HSCs细胞核中高度表达。小鼠Cia-cGAS缺陷将导致I型IFN在骨髓中高表达并伴随静息LT-HSC数量明显减少。在稳态条件下,cia-cGAS在细胞核中通过结合DNA传感器cGAS以阻断其合酶活性,由此保护静息LT-HSC免于被cGAS介导耗尽凋亡。此外,cia-cGAS与线性cGAS相比,与cGAS结合亲和力更强,由此抑制cGAS介导LT-HSCs中I型IFN产生。本文揭示了一个新型环状RNA——cia-cGAS可结合DNA敏感的cGAMP合酶cGAS并抑制其活性,调控长效造血干细胞(LT-HSC)静息状态。环状 RNA 可以起到 microRNA 海绵的作用。湖北m6a环状

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研究指出,环状RNA能够调控来源基因的表达。为了进一步了解小麦差异表达环状RNA的功能,研究人员对它们的来源基因进行GO(GeneOntology)分析。结果显示在脱水作用下,差异表达的环状RNA的来源基因可能在不同的生物进程和分子功能方面发挥作用。2013年两篇Nature文章揭示环状RNA具有miRNA海绵的功能,它可以吸附miRNA来调节基因的表达。研究人员对不同样本之间差异表达的62种环状RNA进行靶miRNA的结合预测。发现其中6种环状RNA具有潜在的miRNA结合位点。随后,研究人员对这些miRNA下游靶基因进行功能预测,分析结果显示靶基因参与的信号通路都与脱水应激反应相关,暗示着这7种差异表达的环状RNA可能通过miRNA海绵机制发挥作用。云序生物作为业内成熟的测序公司,能为不同的客户提供个性化的服务。四川甲基化环状circRNA分子呈封闭环状结构,不易被核酸外切酶RNaseR降解,比线性RNA更稳定。

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鸡白血病病毒亚群(ALV-J)是一类逆转录病毒,该病毒会引起一种重要的感ran性疾病。患病的家禽会导致产蛋率的下降,大面积影响到家禽养殖产业。感ranALV-J的鸡免疫系统会受到严重的抑制并引起多种tumour疾病从而产生很高的死亡率,目前还不能通过接种疫苗的方式来防御这种疾病。来自华南农业大学广东省重点实验室的研究团队通过环状RNA测序的方式研究了病毒抗性与病毒易感的鸡肝脏组织当中环状RNA的表达,发现了32个差异表达的环状分子,其中12个在ALV-J抗性样本中表达量明显升高,而20个在易感样本中表达量更高,而生信预测表明这些环状RNA分子能够调控免疫分子通路的信息传递从而改变生物体的抵抗力。

2020年6月18日云序用户山大二院在Frontiers in Oncology (IF=4.85)上发表了一篇题目RNA-Seq Profiling of Serum Exosomal Circular RNAs Reveals Circ-PNN as a Potential Biomarker for Human Colorectal Cancer的文章,该文章通过运用了云序生物外泌体全转录组测序探究了环状RNA作为结肠ai分子标志物的可能性。 结肠ai(CRC)是第三大常见恶性tumour,早期CRC患者存活率远高于晚期患者,tumour的早期诊断对改善预后至关重要。近年来有许多研究发现,外泌体作为普遍存在于体液中的一种微囊泡,含有大量DNA、RNA和蛋白等分子,可以反应他们来源细胞的信息。许多ai细胞来源的外泌体内的分子具有成为cancer分子标志物的潜力。这其中,环状RNA由于其稳定性高,被作为多种cancer的分子标志物研究过。在这篇文章中,作者通过对50个患者和50和健康人血清中外泌体环状RNA的研究,提出了其中circ-PNN作为CRC诊断分子标志物的可能。云序生物环状RNA测序服务,采用Cloudseq CircRNA Enrichment Kit。

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ac4CRNA乙酰化是在RNAac4C修饰酶的作用下,使N4位乙酰胞嘧啶发生乙酰化的一种保守的化学修饰(N4-acetylcytidine)。早期研究发现该修饰存在于真核生物中丝氨酸及亮氨酸tRNA和18SrRNA上,导致Watson-Crick碱基热稳定性增加,调控蛋白合成中的编码准确性;近期研究发现ac4C分布在人类转录组中,大多数位点出现在编码序列(CDS)内,并且通过改善的mRNA稳定性和翻译促进靶基因表达。目前,ac4CRNA乙酰化修饰作为一类新型RNA修饰,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”!m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰。陕西RIP环状rna

与mRNA相比,m6A甲基化修饰在环状RNA上更普遍。湖北m6a环状

样本要求 样品类型: 组织、细胞、体液或总RNA样品。其它类型样品请咨询工作人员。 样品量: a)细胞:2×106 b)组织:50 mg c)体液:全血、血清、血浆 2-3 ml 脑脊液:5 ml 尿液:50 ml d)总RNA:2 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5 无明显降解,电泳检测样品特征性条带完整清晰,无明显弥散或拖尾 ) 样品运输及保存: 样品运输:样品置于1.5mL管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;血液样品应使用EDTA抗凝,不可用肝素;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。湖北m6a环状

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