空间转录组数据分析的重要是根据每个芯片上每个spot的基因表达信息进行聚类，然后将spot根据坐标位置序列放回到组织的图像上，同时可以对每个gene在组织上表达的空间位置进行定位。获得测序数据后，首先利用Space Ranger 软件可以自动化的对图像进行处理、数据比对和Barcode处理。另外一个软件Loupe Cell Browser是一个适用于Windows和MacOS的桌面应用程序，它可以快速、轻松地可视化和分析10X Visium数据。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。10x Genomics公司宣布了新一代FFPE空间转录组商业化解决方案。技术空间转录组做什么
和单细胞转录组一样，空间转录组也可以进行细胞间通讯分析，区别在于空间位置信息可以同时用于识别潜在的细胞间相互作用。通常通过了解配体受体（LR）对并测试 LR 对是否更有可能在邻近细胞或 spot 中表达来完成。还有很多其他类型的分析可用于空间转录组学数据，包括基因模式的识别，空间区域的转录组定义， 基因间的相互作用推断，转录本的亚细胞定位以及基于H＆E图像的基因表达估算等。1. 欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。宣传空间转录组应用早期空间转录组学的另一条发展路线是基因捕获和增强子捕获筛选。
空间转录组技术原理是什么？当组织冷冻切片附在空间转录组载片上时，条形码引物结合并从组织中捕获邻近的mRNA。被捕获的mRNA开始逆转录，得到的cDNA中包含了空间条形码。分析Illumina测序结果中空间条形码的序列，可以将每个mRNA转录的序列映射回组织切片中的起始位置。空间转录组的条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着，空间转录组使得在mRNA样品处理和后续测序过程中位置信息的编码和获取成为可能。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验，致力通过质量的服务，助力各位科研工作者取得新的突破。
转录本的空间位置信息可以通过在原位阵列上捕获的组织切片中的转录本来获取，目前已有多种技术策略被开发报道，如空间转录组技术（SpatialTranscriptomics，ST）和Visium技术，通过将包含空间位置信息的条形码、UMI标签、poly-dT的探针固定在商用微阵列载玻片上，来捕获包含poly(A)尾巴的转录本，**终获取全转录组水平的基因表达及位置信息。在Slide-Seq中，探针通过微液滴将混合组合标签、UMI标签和poly-dT置于单层载玻片上，而在HDST中，探针被置于载玻片上蚀刻的孔中。在DBiT-seq中，则通过微流体通道生成空间阵列，微通道用于在一个方向上提供一种类型的标签，然后在垂直方向上提供另一种类型的标签，形成正交连接通道，以便可以通过***的成对组合标签识别每个斑点位置。 许多当前时代空间转录组技术的基础都是在自七十年代以来的几十年间建立的。
转录组技术的发展主要经历了三个重要的阶段：一个阶段是对大量混合细胞进行转录组测序，该方法获得的是大量细胞的基因平均表达水平，虽然推进了对细胞群体的特性认识，但无法获知群体内特定细胞的基因表达情况；第二个阶段是单细胞转录组测序，该技术对细胞基因表达的认识推进到单细胞的层面，目前已在新细胞类型的发现，揭示细胞异质性等方面展现出优势。但由于单细胞悬液的获得需要对组织进行酶解，悬液中的单细胞失去了组织空间位置信息，导致有些单细胞在酶解过程中或离开特定微环境后，基因表达谱会发生变化，且某些特殊形态的细胞，如大脑中结构复杂的神经元和神经胶质细胞，难以通过组织酶解获取；而空间转录组测序可以同时获得细胞的空间位置信息和基因表达数据，且不需要制备细胞悬液，进一步推进了对组织原位细胞真实基因表达的研究，为组织细胞功能、微环境互作、发育过程谱系追踪、疾病病理学等多个领域提供了重要的研究手段。 10x Genomics空间转录组用于文库构建的每张载玻片上有四个捕获区域，每个捕获区域的大小为6.5x6.5mm。山西欧易生物空间转录组有什么用
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单细胞转录组测序技术的如火如荼，伴随着空间转录组测序技术的蓬勃发展，可以看到，在现有的高通量检测技术领域，这两种技术已为科学研究的发展提供了前所未有的技术支撑。从2019年单细胞多组学被评为《Nature Methods》年度技术进展，到2020年空间转录组技术也被评为年度技术进展，相信在接下来的时间里，单细胞转录组和空间转录组将为生命科学的发展做出极其重要的贡献。单细胞转录组测序技术的特点在于提供详实的每个细胞的转录表达信息，但是缺失了来源组织的空间组成信息。现有商用空间转录组测序技术的特点在于提供了完整的组织空间位置信息，但是每个捕获spot的信息无法达到单细胞分辨率（10个左右细胞）。因此，这两个技术的存在是天然互补的，而将两者的结合也是水到渠成，完美结合。技术空间转录组做什么
上海欧易生物医学科技有限公司是一家集研发、制造、销售为一体的高新技术企业，公司位于联航路1188号25幢，成立于2009-03-10。公司秉承着技术研发、客户优先的原则，为国内{主营产品或行业}的产品发展添砖加瓦。在孜孜不倦的奋斗下，公司产品业务越来越广。目前主要经营有科研服务，科研检测，学术研究，技术咨询等产品，并多次以医药健康行业标准、客户需求定制多款多元化的产品。上海欧易生物医学科技有限公司研发团队不断紧跟科研服务，科研检测，学术研究，技术咨询行业发展趋势，研发与改进新的产品，从而保证公司在新技术研发方面不断提升，确保公司产品符合行业标准和要求。上海欧易生物医学科技有限公司严格规范科研服务，科研检测，学术研究，技术咨询产品管理流程，确保公司产品质量的可控可靠。公司拥有销售/售后服务团队，分工明细，服务贴心，为广大用户提供满意的服务。
