单细胞测序数据的背景噪声大。单个细胞 RNA 含量很少,扩增和捕获效率的微小变化,就可能在细胞间产生与生物学无关的巨大差异。批次效应处理是单细胞数据分析中必须考虑的因素之一。在不同日期制备的相似样本,可能会因为纯粹的技术原因而不尽相同,矫正和过矫正也仍是数据处理中非常棘手的一件事情。动辄几万的成本在一定程度上限制了单细胞技术的应用。当前主流的技术还是以国外技术为主,不过随着国内单细胞仪器公司的研发推进,在不久的将来,单细胞测序的价格一定会有大幅的下降,会让更多的科研工作者使用到单细胞技术,推动生命科学研究。3.更高效地满足客户的不同科研需求,在更大规模、更高分辨率上开展单细胞研究和单细胞测序。...
对核酸分子(如DNA或RNA)进行测序,可以得到有关其核苷酸(腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鸟嘌呤)顺序的信息,这些核苷酸提供了生命所需的遗传指令。测序技术的发展源于WalterFiers、FrederickSanger和RayWu在1970年代的开创性工作[1]。在几十年间,**初用于核酸测序的方法和技术经历了一个迅猛的发展:从读取单个RNA分子开始,对整个生物体的基因组进行测序成为可能[2]。***个人类基因组草案于2001年在人类基因组计划内公布[3],并与两年后完成。商业DNA测序仪***生产于20世纪90年代末,它们被命名为第二代或第二代测序仪,以区别于***批实验性测序仪,...
欧易单细胞测序继续发力!近日,欧易生物合作客户广州中医药大学一附属医院鲁路团队在Cardiovascular Research(IF 10.787)期刊发表的关于主动脉缩窄模型小鼠心脏巨噬细胞异质性及CD72阳性促炎巨噬细胞功能研究的相关成果,这项研究作者旨在通过单细胞测序研究主动脉缩窄(TAC)小鼠中与心脏损伤相关的巨噬细胞,并进一步验证其来源和在疾病进展中的功能,为未来HF***提供潜在的靶点。欧易生物提供了该项目单细胞转录组测序相关工作。材料:5只主动脉缩窄模型小鼠和5只对照小鼠CD45+免疫细胞; 期刊:Cardiovascular Research 发表时间:2021年6月8日 方法...
单细胞悬液制备难于标准化。 基于酶学的样本处理方法,大都会存在一定程度的解离偏好性,即不同的酶处理不同的组织往往会有不太一样的「效果」,而这种效果不仅*反应在细胞得率,细胞活性和细胞碎片等参数上,往往也会在**终细胞类型有所反映,比如可能会导致部分稀有细胞的丢失,细胞比例的失真等,从而偏离组织的真实状态。另外,细胞悬液的制备过程较长,通常需要3-5小时,这个过程会导致细胞处于「应激状态」中,转录的过程可能已经发生变化,偏离临床实验的终点设计,会对结果的判断造成一定的影响。针对如上问题,欧易团队从已发表的高影响力的文献中,汇总出针对不同类型组织的处理方法,确保实验结果与文献并轨(同频)...
单细胞测序技术可以测量不同类型的遗传物质,单细胞的基因组、转录组或甲基组。本部分内容解释了样品制备的主要差异(图2)和这三种测序亚型的**相关应用。、单细胞基因组测序通过确定单细胞的基因组,scDNA-seq可以对细胞群的基因组异质性进行研究[17]。因此,它主要用于研究微生物组和**。微生物组是单细胞生物的社区,scDNA-seq测量其微生物成分的基因组,而不需要先分离和培养它们。然后,测序数据可用于研究微生物组的组成,从而研究其生态学、进化和改变[18,19]。在**研究中,scDNA-seq被用来研究**内的遗传异质性或识别新型致*突变[20,21]。由于这些创新能力,scD...
肝*是全球**相关死亡的第四大原因,肝细胞*(HCC)是肝*的主要形式。目前对于肝*的***手段通常是手术切除,但较高的术后复发率降低了患者的生存率,尤其是术后 2 年内的早期复发占整体 HCC 复发病例的 70%。本研究中作者通过单细胞转录组测序对原发及早期复发性 HCC 患者的**微环境进行深入探索,试图发现更有效的***策略。 材料:原发及早期复发性肝细胞***及配对*旁组织 期刊:Cell 方法:MIRALCS, 10x Genomics 影响因子:38.635 研究目的:描述原发及早期复发性 HCC **微环境特征。除了能够进行常规的scRNA-seq,还能够进行冻存样本的snRNA...
(4)分析的个性化与标准化伴随越来越多的科研人员开始使用单细胞测序的实验方法,处理数据分析仍然具有挑战性。如何定义质控标准、细胞类型判断,去除技术层面的假象和解释结果的指导方针有限。而且,随着单细胞成本的降低,实验规模的扩大,数据分析的负担也随之增加。市面上很多公司的标准化分析往往满足不了客户的需求,客户需求的是个性化分析。长时间、高频的与客户互动,不断调整参数尝试,势必会对公司后台带来了很大的压力,但售后过程也能体现公司的服务水平和服务能力。单细胞技术光明的前景也催生了国内诸多科技创新型企业角逐单细胞市场。重庆介绍单细胞测序服务电话 目前已在动物组织单细胞测序中有所应用,那么能不能把转录抑...
单细胞测序并非**对一个细胞进行测序,而是对单一细胞的转录组进行捕获和检测,可以理解为单细胞水平上的测序,能同时测序成千上万个细胞。单细胞测序技术的出现和应用,能够完全反映组织里不同细胞群体的异质性信息,帮助获得许多崭新的科研见解,带领生物学研究进入了一个新次元!国内从事单细胞技术开发的团队还有很多,相信不久的将来,单细胞市场不再是以欧美的技术为主导,真正实现技术国产化,大幅降低成本,惠及更多科科学研究,加速科研向临床的转化,让单细胞技术为生命健康服务。随着单细胞测序技术的发展,原核细胞的scRNA-seq技术也将得到越来越多的应用。广东介绍单细胞测序欢迎来电单细胞生物学**近几年是非常热门的...
单细胞测序并非**对一个细胞进行测序,而是对单一细胞的转录组进行捕获和检测,可以理解为单细胞水平上的测序,能同时测序成千上万个细胞。单细胞测序技术的出现和应用,能够完全反映组织里不同细胞群体的异质性信息,帮助获得许多崭新的科研见解,带领生物学研究进入了一个新次元!国内从事单细胞技术开发的团队还有很多,相信不久的将来,单细胞市场不再是以欧美的技术为主导,真正实现技术国产化,大幅降低成本,惠及更多科科学研究,加速科研向临床的转化,让单细胞技术为生命健康服务。10.目前认知下的制备单细胞悬液需要将组织置于37℃保温,以便蛋白酶发挥作用。吉林介绍单细胞测序欢迎来电(4)分析的个性化与标准化伴随越来越多...
(2)基因检出率低当前主流的单细胞平台对基因的捕获效率较低,常见的临床标本,可检测到的基因中位值在1-5k不等,占总基因数的10-20%。低丰度的基因往往捕获不到。 (3)测序数据的高背景单细胞测序数据的背景噪声大。单个细胞RNA含量很少,扩增和捕获效率的微小变化,就可能在细胞间产生与生物学无关的巨大差异。批次效应处理是单细胞数据分析中必须考虑的因素之一。在不同日期制备的相似样本,可能会因为纯粹的技术原因而不尽相同,矫正和过矫正也仍是数据处理中非常棘手的一件事情。 真正实现技术国产化,大幅降低成本,加速科研向临床的转化,让单细胞技术为生命健康服务。海南项目单细胞测序欧易生物单细胞测序...
2021年12月,南京农业大学动物医学学院杨倩教授及生命科学学院林建副教授,于Cell&Bioscience(IF:7.133) 在线发表了IBDV ***鸡法氏囊的单细胞测序的***研究成果。研究工作内容的主要承担者为Abid Ullah Shah博士。欧易生物提供高通量单细胞转录组测序(10x Genoimics单细胞转录组测序)技术支持。该研究从鸡传染性法氏囊病毒的鼻腔***入手,一方面***阐述了IBDV 通过鸡鼻腔传播至法氏囊的传播途径及病毒***主要靶细胞;另一方面,研究初步阐明家禽细胞应用RNAi抵抗IBDV的分子机制,为高效防控家禽RNA病毒奠定理论基础。利用单细胞测序技术全球...
在这个飞速发展的测序时代,DNA和RNA测序已经逐渐成为“实验室中的家常菜”。若要评选出目前很受欢迎的一道菜,那恐怕非单细胞RNA测序莫属。以往,研究人员通常利用RNA测序(RNA-seq)来检测样本中的所有RNA转录本,以发现新型RNA,或开展基因表达分析。不过,测序的对象往往是组织样本或细胞群,这使得细胞之间的差异有可能被平均值所掩盖。自2013年被《Nature Methods》评为年度技术以来,这项技术正被迅速地采用,发表文献的数量也在逐年递增。随着单细胞测序技术的发展,原核细胞的scRNA-seq技术也将得到越来越多的应用。浙江推荐单细胞测序欧易生物单细胞测序近期高分文章不断。本篇文...
在这个飞速发展的测序时代,DNA和RNA测序已经逐渐成为“实验室中的家常菜”。若要评选出目前很受欢迎的一道菜,那恐怕非单细胞RNA测序莫属。以往,研究人员通常利用RNA测序(RNA-seq)来检测样本中的所有RNA转录本,以发现新型RNA,或开展基因表达分析。不过,测序的对象往往是组织样本或细胞群,这使得细胞之间的差异有可能被平均值所掩盖。自2013年被《Nature Methods》评为年度技术以来,这项技术正被迅速地采用,发表文献的数量也在逐年递增。除了能够进行常规的scRNA-seq,还能够进行冻存样本的snRNA-seq,为各种类型生物样本提供解决方案。江苏按需求单细胞测序2021 年...
过去 5 年里,单细胞测序技术的快速发展极大地加速了生物医学领域的相关研究,让科研人员以更广的维度来研究生命的本质。随着 2013 年单细胞测序技术被 Nature Methods 杂志评选为年度技术;2019 年单细胞多组学技术再次被 Nature Methods 杂志评选为年度技术。进一步说明单细胞测序未来在基础科研乃至医学、农学等各个应用研究领域具有无限的潜力,将是未来科学发展的重要方向。国内从事单细胞技术开发的团队还有很多,相信不久的将来,单细胞市场不再是以欧美的技术为主导,真正实现技术国产化,大幅降低成本,惠及更多科科学研究,加速科研向临床的转化,让单细胞技术为生命健康服务。目前,通...
欧易生物是国内**早开展单细胞测序分析的公司之一。目前拥有10x Genomics及BD Rhapsody两个单细胞测序平台,以及完整、系统的生物信息学分析技术和流程。除了能够进行常规的scRNA-seq(single-cell RNA sequencing),还能够进行冻存样本的snRNA-seq(single-nucleus RNA sequencing),为各种类型生物样本进行单细胞测序提供了系统、完整的解决方案。竭诚为广大制药行业客户提供高质量的单细胞测序服务,助力您加快药物研发进程、降低临床试验风险、节约研发成本。经单细胞测序及生信分析显示,对照组较实验组的应激基因表达有明显的升高。...
2021年第四季度,欧易生物单细胞测序客户文章持续井喷,据不完全统计,第四季度目前已经接受了10+篇客户文章。在这些客户文章中,***为大家带来的这篇尤为特殊,该研究使用了单细胞RNA与单细胞ATAC双平台深度解析了小鼠胸腺、脾脏和淋巴结γ δ T细胞的异质性图谱特征。该研究是由暨南大学医学部生物医学转化研究院/珠海市人民医院尹芝南教授课题组(李振华博士后、杨全利博士后和唐欣博士后为论文***作者,尹芝南教授和曹广超副研究员为论文共同通讯作者)在Science Bulletin上在线发表的题为“Single-cell RNA-seq and chromatin accessibility pr...
欧易生物单细胞测序近期高分文章不断,在接下来的几篇单细胞文献解读软文里,我们将为大家持续送上近期合作发表的单细胞文献解读。本篇文章为大家解读今年5月由上海交通大学附属上海市第一人民医院刘堃团队在Diabetes(IF9.461)期刊发表的关于2型糖尿病小鼠视网膜组织的分子图谱和异质性的相关成果。 材料:3只2型糖尿病模型小鼠(db/db);3只对照小鼠(db/m)的视网膜组织 期刊:Diabetes 发表时间:2021年5月 方法:欧易生物10xGenomicsscRNA-seq 胰腺样本制备单细胞悬液的难度较大,同时不同状态的胰腺样本处理方法也不相同。山西质量单细...
欧易生物是国内早期开展单细胞测序分析的公司之一。目前拥有10x Genomics及BD Rhapsody两个单细胞测序平台,以及完整、系统的生物信息学分析技术和流程。除了能够进行常规的scRNA-seq(single-cell RNA sequencing),还能够进行冻存样本的snRNA-seq(single-nucleus RNA sequencing),为各种类型生物样本进行单细胞测序提供了系统、完整的解决方案。竭诚为广大制药行业客户提供高质量的单细胞测序服务,助力您加快药物研发进程、降低临床试验风险、节约研发成本。欢迎有意向开展单细胞测序研究的老师们向我们咨询沟通单细胞相关问题 。目前...
单细胞技术就是以单个细胞为单位,研究单个细胞的基因组或转录组,提供细胞间变异的高分辨视图。探索复杂组织中单个细胞的不同生物学特性,了解细胞亚群对环境因素的反应,有助于研究细胞功能,细胞分化,增殖和**发生的机制。正式由于其在生命科学研究中的发挥了重要作用,目前已成为生命科学研究的热点。2013 年单细胞技术被 Nature Methods 评为年度技术。同年 Science 杂志将单细胞测序列为年度值得关注的六大领域之一,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。2015 年单细胞测序技术再次登上了 Science 封面。随着空间转录组技术的出现,获得了组织空间维度的表达图谱,完成了组织空间...
单细胞测序的作用:一、在传统的研究方法中,我们往往根据标记基因和细胞形态来区分不同细胞类型,而这种方法无可厚非的存在很多争议。而单细胞测序技术可以更精细无偏倚的来对细胞进行分群。尤其是对免疫学,**学,遗传学的研究将会带来巨大影响。二、分析稀有的细胞,特别是特定时空环境下的细胞。比如从环境中取样的微生物等。三、临床上,对体外受精胚胎进行植入前的筛查。 单细胞在许多领域都占有一席之地,对于**早期的诊断、追踪以及个体化***具有重要意义。目前大家关注较多的是单细胞转录组学,单细胞层面多组学。四川介绍单细胞测序多少钱过去 5 年里,单细胞测序技术的快速发展极大地加速了生物医学领域的相关研究,让科研...
欧易生物单细胞测序近期高分文章不断,在接下来的几篇单细胞文献解读软文里,我们将为大家持续送上近期合作发表的单细胞文献解读。本篇文章为大家解读今年5月由上海交通大学附属上海市第一人民医院刘堃团队在Diabetes(IF9.461)期刊发表的关于2型糖尿病小鼠视网膜组织的分子图谱和异质性的相关成果。 材料:3只2型糖尿病模型小鼠(db/db);3只对照小鼠(db/m)的视网膜组织 期刊:Diabetes 发表时间:2021年5月 方法:欧易生物10xGenomicsscRNA-seq 高通量单细胞Chromium X仪器系列的投入使用,势必给单细胞测序技术的发展注入新动...
作为国内首批引入Chromium X平台的公司,欧易生物的百万级细胞研究Chromium X 仪器正式落地。更高效地满足客户的不同科研需求,在更大规模、更高分辨率上开展单细胞研究。更高效地满足客户的不同科研需求,在更大规模、更高分辨率上开展单细胞研究和单细胞测序。高通量单细胞Chromium X仪器系列的投入使用,势必给单细胞技术的发展注入新动力,提速了科研工作者的研究进程。新的发现,新的成果层出不穷,高分文章发发发不停!欧易生物单细胞事业部致力于为广大科研工作者提供周到、贴心、专业的技术服务,专注于以客户的口碑铸就品牌形象。目前已在动物组织单细胞测序中有所应用,那么能不能把转录抑制剂也应用于...
由于每个单细胞都是独特的,不可能开展重复实验并评估噪音。因此,必须采取一些质量控制手段,以确保数据的可靠性。**建议,向每个细胞裂解液中加入已知序列和数量的合成mRNA,如外源RNA对照联盟(ERCC)开发的加标RNA。这些RNA的读数将提供样本间差异的信息。总的来说,单细胞水平的转录组分析可以揭示细胞群体中的细胞异质性,强调了个别细胞的与众不同。此外,同时分析多种分子(如DNA、RNA和蛋白质)的方法也不断被开发出来。这种更***的单细胞组图有望进一步加深我们对生物学过程的了解,对未来的科研及临床研究大有裨益。目前的单细胞测序市场与二代测序初期有点类似,测序价格非常昂贵,能利用二代测序技术的...
由于细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。DNA研究主要涉及的是测序单细胞微生物相对简单的基因组;而更大更复杂的人类细胞基因组则是一个更大的挑战。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。单细胞在许多领域都占有一席之地,对于**早期的诊断、追踪以及个体化***具有重要意义。欧易生物单细胞事业部致力于为广大科研工作者提供周到、贴心、专业的技术服务,专注于以客户的口碑铸就品牌形象。国内从事单细胞技术开发的团队还有很多,相信不久的将来,单细胞市场不再是以欧美的技术为主导。河南单细胞测序单价 欧易生物单细胞测...
2021年第四季度,欧易生物单细胞测序客户文章持续井喷,据不完全统计,第四季度目前已经接受了10+篇客户文章。在这些客户文章中,***为大家带来的这篇尤为特殊,该研究使用了单细胞RNA与单细胞ATAC双平台深度解析了小鼠胸腺、脾脏和淋巴结γ δ T细胞的异质性图谱特征。该研究是由暨南大学医学部生物医学转化研究院/珠海市人民医院尹芝南教授课题组(李振华博士后、杨全利博士后和唐欣博士后为论文***作者,尹芝南教授和曹广超副研究员为论文共同通讯作者)在Science Bulletin上在线发表的题为“Single-cell RNA-seq and chromatin accessibility pr...
欧易单细胞测序助力解析阿兹海默症B细胞分子标志物!2021年12月8日,四川大学华西医院王廷华课题组与遵义医科大学附属医院神经内科余昌胤课题组协作,利用单细胞测序在Experimental&MolecularMedicine发表了AD分子标志物相关成果,欧易生物提供了该篇文章的测序和分析服务。单细胞在许多领域都占有一席之地,对于**早期的诊断、追踪以及个体化***具有重要意义。 文章题目:Single-cellRNAsequencingrevealsBcell–relatedmolecularbiomarkersforAlzheimer’sdisease发表期刊:Experiment...
(5)成本高动辄几万的成本在一定程度上限制了单细胞技术的应用。当前主流的技术还是以国外技术为主,不过随着国内单细胞仪器公司的研发推进,在不久的将来,单细胞测序的价格一定会有大幅的下降,会让更多的科研工作者使用到单细胞技术,推动生命科学研究。国内从事单细胞技术开发的团队还有很多,相信不久的将来,单细胞市场不再是以欧美的技术为主导,真正实现技术国产化,大幅降低成本,惠及更多科科学研究,加速科研向临床的转化,让单细胞技术为生命健康服务。研究对象的“基本属性”决定了单细胞高通量技术是目前我们解析各种生命现象、揭示生物学机制的技术手段。福建介绍单细胞测序服务电话本研究为通过单细胞测序技术进行精细***提...
inferCNV 是一款 R 包,用来探索**单细胞转录组数据中体细胞大规模染色体拷贝数变异,例如整个染色体或大片段染色体的扩增(gain)或缺失(loss)。通过与一组参考的“正常”细胞比较,探索**基因组不同位置的基因表达强度来实现。通过热图显示每条染色体上的相对表达强度,在以正常细胞作为参考的情况下可以直观地判断**基因组上的哪些区域是过表达和低表达。为了提高推断结果的可靠性,inferCNV 采用几种 residual expression 过滤方法减少数据中噪声信号,从而发现真正的 CNV 的信号。单细胞蛋白组和代谢组受制于质谱仪器的灵敏度,目前还存在一定的难度。福建项目单细胞测序...
2021年3月30日,暨南大学生物医学转化研究院举行了“单细胞联合实验室”的签约仪式。签约仪式由暨南大学生物医学转化研究院院长尹芝南教授主持,生物医学转化研究院郝健磊副研究员、上海欧易生物医学科技有限公司营销副总经理董栋先生和单细胞事业部总经理张志明先生等人出席签约仪式。由上海欧易生物医学科技有限公司、暨南大学生物医学转化研究院携手成立的单细胞联合实验室,旨在促进单细胞技术在科研领域的深入应用,惠及更多的研究工作者,加强产学研合作,推动科技成果产业化批次效应处理是单细胞数据分析中必须考虑的因素之一。江苏介绍单细胞测序产品单细胞转录组测序(Single-cell RNA-sequencing, ...
单细胞转录组测序(Single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq) 是在单个细胞水平对mRNA 进行高通量测序的一项新技术,其原理是将多细胞生物分离的单个细胞中微量的转录组mRNA 通过高效扩增后再进行高通量测序。单细胞转录组测序能够有效解决组织样本无法**的细胞异质性难题以及常规RNA-seq 被掩盖的细胞群内的转录组异质性难题,有助于发现新的稀有细胞类型,并深入了解发育过程中的表达调控机制。近年来,已有多种单细胞测序技术及平台应用而生。其中,基于微流控技术的平台通量有限,基于板型技术的平台有耗时的荧光***细胞分选过程,近来基于液滴技术的平台的10xGenomi...