作者首先从 TCGA 的公开数据中发现,肺腺ai组织中的 FTO 表达水平低于邻近的正常组织,然后对 FTO 的 mRNA 进行 qPCR 实验,验证了这种表达差异的存在。免疫组化染色实验也证实 FTO 的的表达水平在肺腺ai组织中要低于邻近的正常组织。Kaplan-Meier 分析显示,低 FTO 表达水平的病患拥有较低的总生存率。 在人类肺腺ai细胞系中对 FTO 的 mRNA 的敲降实验发现,FTO 表达的降低可明显增强细胞的增殖以及非锚定依赖性生长(Anchorage-independed growth)的能力,细胞周期的速度也更快,细胞迁移和侵入性也更强。在体内实验方面,若将 FTO 敲降的细胞系注入无胸腺裸鼠的尾静脉内,相比于注入未敲降细胞的对照组,FTO 敲降的实验组中的tumour细胞有明显地向肺部转移。上述发现都指向一个结论:FTO 在肺腺ai细胞中的下调促进了tumour的生长和转移。发表10分以上文章较多的m6A RNA甲基化测序服务平台。闵行区m6Apri-miRNA测序
继前面介绍中国医学科学院tumour医院赫捷院士团队2021年6月21日在Nature Communications(IF=14.919)上发表“METTL3 promotes tumour developmentby decreasing APC expression mediated by APC mRNA N6-methyladenosine-dependent YTHDF binding”的食管鳞ai m6A机制文章后,本期我们继续为大家介绍赫捷院士团队 2021 年 5 月 8 日在 Nature 旗下期刊 Cell Death & Disease(IF=8.47)上发表的题为 “WNT/β-catenin-suppressed FTO expression increases m6A of c-Myc mRNA to promote tumor cell glycolysis and tumorigenesis” 的肺腺ai m6A机制文章。该研究揭示了一种 Wnt/β-catenin 介导的 FTO 下调的关键机制,并凸显了 MYC mRNA 的 m6A 修饰在调节tumour细胞糖酵解和生长中的作用。云序生物有幸参与了两次研究当中的m6A MeRIP-seq和RNA-seq的测序服务以及生信分析。福州m6A结果LC-MS/MS检测整体RNA修饰水平。
测序技术近年来的发展衍生了高灵敏度技术,可用于在各种模型系统和细胞类型的转录组中定位 m6A。通过对 m6A 转录组范围内定位的了解,发现这项技术有着多项功能。显然,还有很多内容有待研究发现,尽管如此,我们现在对这种表观遗传标志物的生物学和调控作用已有了更深刻的理解。测序方法和技术的共同进步也使得我们能够确定负责 m6A 的功能、甲基化和去甲基化的读码器、编码器和消码器。在这张通路图中,我们介绍了负责 RNA 上 m6A 的添加和敲除的必不可少的蛋白质,并将进一步详细介绍 m6A 的一些重要读码器及其表观遗传学功能。
近来关于m6A甲基化的研究,热度持续不减。早在2015年就已经在《Nature》和《Cell》上发表了相关研究。那么下面我们就来了解一下这期的主角——m6A甲基化。已知RNA存在超过100种修饰。在真核生物中,5’端的Cap以及3’的ployA修饰在转录调控中起到了十分重要的作用,而mRNA的内部修饰则用于维持mRNA的稳定性。mRNA较常见的内部修饰包括N6-腺苷酸甲基化(m6A)、N1-腺苷酸甲基化(m1A)、胞嘧啶羟基化(m5C)等。对于大热的m6A,截至2017年,全球的科学家已经鉴定了参与m6A的许多酶,包括去甲基化酶、甲基化酶和甲基化识别酶等。芝加哥大学的何川教授对此贡献巨大。来自中科院北京基因组研究所的杨运桂研究员也是这方面的大牛。国自然热点—m6A等热门RNA修饰研究技术漫谈。
METTL3还能作为一个潜在的m6A读取器,在Figure 2B中,我们可以看到,在肺ai细胞中,METTL3此时并没有发挥催化作用,而是在细胞质中锚定到了3'UTR上,促进了一个报告mRNA的翻译。进一步的研究表明,METTL3是通过eIF3h相互作用来促进翻译的。METTL3蛋白自身会通过PTM或与其它蛋白质相互作用来发挥调控功能,例如人类的METTL14能够诱导METTL3的丝氨酸399磷酸化。人类的METTL3会出现SUMOylation修饰,导致METTL3/14的活性降低。但这些现象的机制还不清楚。云序可提供mRNA和多种非编码RNA的m6A测序。徐汇区m6A全转录组测序
农口方向3个月内搞定5分文章秘籍——m6A热点错不了。闵行区m6Apri-miRNA测序
商务服务属于现代服务业的范畴,是指为企业提供服务的行业划分。商务服务行业门类较多,新产业不断涌现,给产业的界定和使用造成很多混乱。在文创产品方面,服务型企业是蕴含着传统文化基因的礼物是文化服务,是中国及世界精神文明的象征。所以对于行业内的无数企业来说,这不但是一个巨大商机,更是一个发展前景。严格来说,无论是欣赏人文还是享受山水之乐,都离不开良好的私营有限责任公司服务,好的私营有限责任公司服务总能让人身心愉悦,更好地融入当地生活,创造出旅游记忆。古人云“读万卷书,行万里路”,美丽的风景和精彩的人生都是在路上。销售的不断发展,才能让人更好地感知世界、认识自己。拥抱多彩的人类文明、多元的民族智慧、瑰丽的自然景观,人生的阅历和视野则辽阔宽广。闵行区m6Apri-miRNA测序
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