蛋白组学研究实用案例：东南大学医学院院长刘必成教授领导的肾脏病研究所在Science advances期刊发表了题为“Extracellular vesicle–encapsulated IL-10 as novel nanotherapeutics against ischemic AKI"的研究成果，通过蛋白组学+多层组学研究方法，建立IL-10细胞囊泡高表达模型的构建，提出并验证了IL-10细胞外囊泡的靶向缺血性肾损伤的假说，探究了IL-10细胞外囊泡作为新型纳米药物的机理。中文标题：细胞外囊泡包裹的IL-10作为抗缺血性急性肾损伤的新型纳米疗法研究方向：新药研发及其机制研究发表期刊：Scienceadvances影响因子：14.136发表单位：中国南京东南大学附属中大医院肾内科运用生物技术：LC-MS/MS蛋白组学（由鹿明生物提供技术支持）传统的蛋白组学是针对组织或者大量细胞样本进行分析，获得的是均质化后的结果，掩盖了单细胞的个体差异。江苏蛋白组学质谱
2021年10月，中国科学院上海营养与健康研究所武爱波研究员课题组在《Ecotoxicology and Environmental Safety》（IF:6.291）发表了题为“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果，通过转录组学和蛋白质组学研究方法，探究了脱氧雪腐镰刀菌烯醇（简称：DON，俗称呕吐***）对成肌细胞分化的影响，发现了DON处理使得细胞骨架蛋白和细胞外基质蛋白表达下调，并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路的机理，为食品和饲料污染的防治提供了理论依据。其中转录组学和蛋白组学由欧易/鹿明生物提供技术支持。广东蛋白组学质谱蛋白质组学可以克服核酸水平预测的不确定性、反映核酸翻译后修饰情况。
综上所述，本研究应用RNA-seq转录组分析结合iTRAQ蛋白质组学技术，探讨油茶种子不同成熟期储量积累的动态变化。此外，作者还探讨了黄酮类化合物和脂肪酸的生物合成和代谢可能的调控机制。许多功能转录本(16530)和蛋白质物种(1228)的模式发生了***变化，其中317个DAPs被转录组结果覆盖。结合结构基因(蛋白)或转录因子的表达谱及相应化合物的含量，对重要代谢产物的调控网络进行了探讨。结果表明，黄酮类化合物的合成能力在种子成熟过程中逐渐减弱，而脂肪酸的合成能力则先升高后下降。
iTRAQ标记定量蛋白组学技术研究方法：2021年7月，海南大学园艺园林学院吴友根教授课题组等在《Horticulture Research》期刊发表了题为“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果，通过RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学技术研究方法，发现了油茶种子成熟过程中与油质相关关键代谢产物的积累模式特征，探究了不同成熟度油茶转录组和蛋白质组谱机理，描绘了海南油茶种子成熟过程的动态变化图谱。为该树种的遗传改良提供了理论依据。蛋白组学-请咨询上海欧易生物医学科技有限公司。
4D蛋白质组学分析发现，不同的病因和疾病的严重程度中蛋白表达存在差异。严重的疾病同急性期的蛋白的增加，补体系统蛋白及功能相关的蛋白相关；通过COVID-19和健康组对比，发现了49%的差异分析物；和脓毒症相比，G-CSF，IL-8等在严重的COVID-19患者中含量更低；蛋白和临床相关性分析则发现临床特征和某些蛋白呈强相关性。本研究通过4D蛋白组学技术结合其他组学技术及免疫技术，确定了COVID-19免疫特征和宿主反应等相关因素，并为进一步COVID-19的***打下了良好的基础。质谱技术,生物信息学方法,提供蛋白质组学 。广东tmt定量蛋白组学价格
靶向蛋白质组学，信号通路蛋白靶点高通量分析。江苏蛋白组学质谱
本研究采用串联质量标签（TMT）标记的蛋白质组学和平行反应监测（PRM）技术，对莲子脱水过程中的生理调控网络进行了深入研究表明，碳水化合物代谢（包括糖酵解/糖异成、半乳糖代谢、淀粉和蔗糖代谢、磷酸戊糖途径和细胞壁组织）、ER中的蛋白质加工、DNA修复和抗氧化事件对莲种胎脱水有积极的反应。在莲种胚脱水过程中，非酶促抗氧化剂和戊糖磷酸和维生素E作为主要的抗氧化剂，在脱水过程中维持荷花胚胎的REDOX平衡。这些结果为揭示荷花胚胎脱水保护机制的生理学调控网络提供了酶途径在抗氧化保护中起着主要作用。应激生理学检测表明，H2O2是诱发氧化应激损伤的主要活性氧（ROS）成分，谷胱甘肽新的见解。江苏蛋白组学质谱
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