本文为中国科学院海岸带研究所赵建民课题组在ScienceoftheTotalEnvironment期刊发表了的文章，通过iTRAQ标记定量蛋白质组学研究弧菌***加剧了海洋酸化造成的牡蛎免疫抑制效应。海洋酸化可能增加海洋软体动物疾病加剧的风险。从而将产生重大的经济和生态影响，因此本研究结果具有重要的指导意义。在本研究中，研究者将太平洋牡蛎暴露于酸化海水（约2000ppm）中28天，然后用金氏弧菌进行***处理，以此研究海洋酸化是否会影响牡蛎对病原菌***的免疫反应。此外，利用基于iTRAQ的定量蛋白质组学方法，对牡蛎鳃这一潜在的造血部位进行了研究，以分析对OA和金氏弧菌共同作用较敏感的生理过程。质谱技术,生物信息学方法,提供蛋白质组学 。北京蛋白组学可以检测磷酸化
蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学研究案例：2021年12月30日复旦大学附属中山医院樊嘉院士、中国科学院上海药物研究所周虎研究员、中国科学院分子细胞科学***创新中心高大明研究员、复旦大学附属中山医院**教授课题组合作在Cancer Cell上发表题为“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究论文，通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、微生物组学研究方法对262例肝内胆管*（iCCA）患者的配对**和*旁组织进行了分析，通过绘制肝内胆管*的多维分子图谱为进一步鉴定iCCA的分子发病机制、分子分型、预后等提供了宝贵的资源。福建蛋白组学 微生物修饰蛋白质组试-蛋白质组学 解决方案。
label-free蛋白定量策略进行蛋白组学的***分析。肺腺*(lungadenocarcinoma，LUAD)是肺*的一种，属于非小细胞*，早期一般没有明显的临床症状，且易发生转移。肺腺*(LUAD)的基因组研究提高了对该**生物学的理解，加速了靶向***的进程。中国科学家选取了103例未经***的中国肺腺*患者的原位肺腺*组织及其相应的*旁组织（NAT）（样本策略），利用基于质谱的label-free蛋白定量策略进行蛋白组学的***分析。从多维度揭示疾病重要分子特征对蛋白质组、磷酸化蛋白质组、转录组和全外显子组测序数据的综合分析揭示了**相关特征，如**相关蛋白变异、特有的蛋白质组特征以及早期患者或EGFR和TP53突变患者的临床结果。
3篇经典的蛋白组学和代谢组学在水产动物中的研究。水产动物的研究不仅是保障我国海水养殖业的健康可持续发展，同时可为良种创制、海洋环境研究、生态研究等提供重要理论基础和技术支撑~因此在水产生物研究方面蛋白组学、代谢组学在其中起到什么作用呢？期望这3篇经典文章能给您思路~中文标题：CO2诱导的海洋酸化损害了太平洋牡蛎对金氏弧菌的免疫功能:细胞和蛋白质组学的综合研究研究对象：牡蛎发表期刊：ScienceoftheTotalEnvironment影响因子：6.551合作单位：中国科学院海岸带研究所运用欧易/鹿明生物技术：iTRAQ标记定量蛋白质组学（由鹿明生物提供技术支持）蛋白质组学的特点蛋白质组和蛋白质组学的概念。
为了确定TMT AD蛋白网络模块是否也存在于其他的队列和大脑区域，使用 TMT标记定量蛋白质组学多个队列的所有组织，为每个队列生成蛋白质共表达网络，并评估了 AD 网络模块是否保留在每个队列和大脑区域中。发现几乎所有的 TMT AD 网络模块都保留在队列和大脑区域（图2b）。阿尔茨海默病(AD)是一种神经系统退行性疾病，其病因至今尚不清楚。本文从蛋白组学方向出发，建立蛋白共表达网络，综合转录组学结果，解析疾病相关的蛋白组学模块或能为AD提供可靠的生物标志物，并为治疗带来希望。蛋白组学研究必看的经典综述。北京蛋白组学可以检测磷酸化
蛋白组学翻译后修饰筛选,检测,鉴定,定性,定量。北京蛋白组学可以检测磷酸化
蛋白质组数据分析鉴定出了几种参与肝葡萄糖脂代谢的蛋白质（ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK）。此外，AC显示出抑制脂肪生成酶（ACC，FASN和SCD1）表达的趋势，同时***上调了GLUT2。与对照组相比，AC***增加了PEPCK的表达，两种化学物质对G6Pase均无***影响（图4A）。PRM蛋白靶向验证测定结果与蛋白质组变化相一致，这进一步证实了蛋白质组学数据中蛋白质的表达（图4B）。转录组学和蛋白质组学联合分析结果显示AC和AL***改善了线粒体功能。GSEA分析显示，处理组的氧化磷酸化（OXPHOS）通路***上调，AC组和AL组的富集得分分别为0.826和0.535。北京蛋白组学可以检测磷酸化
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