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单细胞测序基本参数
  • 品牌
  • 欧易生物
  • 公司名称
  • 上海欧易生物医学科技有限公司
  • 行业类型
  • 生物医学行业
  • 安全质量检测类型
  • 单细胞测序
  • 服务内容
  • 技术服务
  • 所在地
  • 上海,北京,广州,成都,深圳,杭州,南京,天津,武汉,重庆,安徽,福建,甘肃,广东,广西,贵州,海南,宁夏,辽宁,江西,江苏,吉林,湖南,湖北,河南,河北,山东,山西,陕西,四川,青海,云南,浙江,黑龙江,内蒙古
  • 检测类型
  • 技术服务
单细胞测序企业商机

欧易生物单细胞测序近期高分文章不断,在接下来的几篇单细胞文献解读软文里,我们将为大家持续送上近期合作发表的单细胞文献解读。本篇文章为大家解读今年5月由上海交通大学附属上海市第一人民医院刘堃团队在Diabetes(IF9.461)期刊发表的关于2型糖尿病小鼠视网膜组织的分子图谱和异质性的相关成果。

材料:3只2型糖尿病模型小鼠(db/db);3只对照小鼠(db/m)的视网膜组织

期刊:Diabetes

发表时间:2021年5月

方法:欧易生物10xGenomicsscRNA-seq 高通量单细胞Chromium X仪器系列的投入使用,势必给单细胞测序技术的发展注入新动力,提速了科研研究进程。包含什么单细胞测序

单细胞测序数据的背景噪声大。单个细胞 RNA 含量很少,扩增和捕获效率的微小变化,就可能在细胞间产生与生物学无关的巨大差异。批次效应处理是单细胞数据分析中必须考虑的因素之一。在不同日期制备的相似样本,可能会因为纯粹的技术原因而不尽相同,矫正和过矫正也仍是数据处理中非常棘手的一件事情。动辄几万的成本在一定程度上限制了单细胞技术的应用。当前主流的技术还是以国外技术为主,不过随着国内单细胞仪器公司的研发推进,在不久的将来,单细胞测序的价格一定会有大幅的下降,会让更多的科研工作者使用到单细胞技术,推动生命科学研究。浙江单细胞测序服务费欧易生物也在单细胞研发上投入精力,目前在研的多组合标签技术,力争让单细胞降至千元级别。

由于每个单细胞都是独特的,不可能开展重复实验并评估噪音。因此,必须采取一些质量控制手段,以确保数据的可靠性。**建议,向每个细胞裂解液中加入已知序列和数量的合成mRNA,如外源RNA对照联盟(ERCC)开发的加标RNA。这些RNA的读数将提供样本间差异的信息。总的来说,单细胞水平的转录组分析可以揭示细胞群体中的细胞异质性,强调了个别细胞的与众不同。此外,同时分析多种分子(如DNA、RNA和蛋白质)的方法也不断被开发出来。这种更***的单细胞组图有望进一步加深我们对生物学过程的了解,对未来的科研及临床研究大有裨益。

单细胞全基因组测序技术是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是将分离的单个细胞的微量全基因组DNA进行扩增,获得高覆盖率的完整的基因组之后通过外显子捕获进而高通量测序用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系。全基因组扩增技术主要分为两种类型:一是基于热循环以PCR为基础的扩增技术,如简并寡核苷酸引物PCR (DOP-PCR)、连接反应介导的PCR (LM-PCR)、扩增前引物延伸反应 (PEP)等;一是基于等温反应不以PCR为基础的扩增技术,如多重置换扩增 (MDA) 和基于引物酶的全基因组扩增 (pWGA)。Adam等人通过使用具有低温活性的蛋白酶,对小鼠肾脏组织进行单细胞测序,结果证明了在6℃条件下进行解离。

单细胞RNA-seq能够**地提供每个细胞的RNA表达谱,并鉴定异质细胞群中的稀有细胞。尽管**异质性可归因于累积突变,但即使是遗传上相同的细胞在相同环境下也可能表现出基因和蛋白表达水平的差异,从而导致耐药性的产生。单细胞RNA-seq就能够发现这些稀有个体。当然,单细胞RNA-seq的开展绝非易事,需要用到一系列前列技术。大家首先要高效分离单细胞,然后进行RNA提取、逆转录、文库制备和测序,***再通过生物信息学软件进行数据分析。经单细胞测序及生信分析显示,对照组较实验组的应激基因表达有明显的升高。介绍单细胞测序单价

欧易生物依托于旗下鹿明生物已经开展单细胞蛋白组和空间代谢组的检测,这是单细胞转录组研究的重要补充。包含什么单细胞测序

欧易生物单细胞事业部建立于2018年,已成为欧易生物的**部门之一。先后引入多套10x Genomics和 BD RhapsodyTM,流式细胞仪等主流的高通量单细胞分选平台,已获得10x Genomics公司授权的单细胞基因表达和空间转录组双平台服务提供商认证,并与北京、广州等地协同科研院所分别成立联合实验室。团队成员50余人,博士学历5人,硕士及以上学历人员比例达40%以上;拥有300m2**实验室,可完成样本处理、细胞分选、文库构建和空间转录等的实验。单细胞事业部成立至今,已完成1000+个项目、6000+例样本的单细胞解离与测序,参与或协助客户发表近50篇高水平文章。欧易生物单细胞事业部致力于为广大科研工作者提供周到、贴心、专业的技术服务,专注于以客户的口碑铸就品牌形象。包含什么单细胞测序

上海欧易生物医学科技有限公司是以提供科研服务,科研检测,学术研究,技术咨询为主的私营合伙企业,公司始建于2009-03-10,在全国各个地区建立了良好的商贸渠道和技术协作关系。欧易生物以科研服务,科研检测,学术研究,技术咨询为主业,服务于医药健康等领域,为全国客户提供先进科研服务,科研检测,学术研究,技术咨询。欧易生物将以精良的技术、优异的产品性能和完善的售后服务,满足国内外广大客户的需求。

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