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代谢组学基本参数
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  • 欧易生物
  • 公司名称
  • 上海欧易生物医学科技有限公司
  • 行业类型
  • 技术服务,科研服务,产品检测
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代谢组学企业商机

GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法,2021年11月,上海交通大学医学院附属新华医院冯丽萍教授课题组在Science of the Total Environment期刊发表了题为“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of  Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法,发现了BPF暴露的肠道毒性的特征,探究了可能的发病机理。中文标题:转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象:人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影响因子:7.963发表时间:2021年11月合作单位:上海交通大学附属新华医院运用生物技术:GC-MS非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、转录组学、qRT-PCR读懂代谢组学 代谢组学的研究范畴。北京代谢组学是什么

通过转录组学和代谢组学(GC-MS非靶向代谢组学)对BPF暴露和对照组的细胞进行分析,筛选到差异的基因和代谢物。分别通过富集分析,找到差异基因或代谢物参与的条目或通路。***通过差异转录本、代谢物和促炎细胞因子的综合分析,揭露了它们之间的关系。本文通过多组学分析和体外模型的方式,发现了BPF暴露后肠上皮细胞转录组和代谢组谱的改变,揭露了BPF可能在肠道炎症发病机制的作用。中文标题:转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象:人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影响因子:7.963发表时间:2021年11月合作单位:上海交通大学附属新华医院运用生物技术:GC-MS非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、转录组学、qRT-PCR上海靶向代谢组学氨基酸代谢组学,胆汁酸代谢,脂肪酸代谢,神经递质代谢,花生四烯酸代谢。

GC-MS代谢组学结果:通过GC-MS代谢组学观察到 92种化合物,其中,49种与数据库中可用的化合物相匹配,包括重要的发酵代谢物,如葡萄糖、**酸、琥珀酸和几种 (n=10) 初级氨基酸。NMR也观察到了七种已鉴定的化合物。通过 GC-MS 测量,表面(15 厘米)SOM 中的糖和氨基酸浓度随温度处理而变化,随着温度的升高,通常趋向于更高的糖浓度和更低的游离氨基酸浓度(图 3)。谷氨酰胺在氨基酸中是一个明显的例外,在浓度与温度处理中观察到了积极的趋势(图 3)。此外,与植物应激反应相关的化合物(油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羟基-3-甲氧基苯甲酸)随温度升高而增加(SI 附录,图 S5)。

代谢组学研究:浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展,作者:杨桂玲,王彦华,李健,王豆,鲍志伟,王强(通讯作者),靳远详(共同通讯作者),在Journal of Hazardous Materials期刊发表了题为“Health risks of chlorothalonil, carbendazim, prochloraz, their binary and ternary mixtures on embryonic and larval zebrafish based on metabolomics analysis”的研究成果,通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发育阶段的复杂病理生理和毒性通路。代谢组学一个样本多少钱?代谢组学可信耐服务公司。

尿液代谢组学研究案例,空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析,其中GC-MS检测102种代谢物,LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性,结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明,Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异,LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物,体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物,使用综合分析获得候选差异代谢物,其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短期PM暴露相关标志物,确定了33种与短期暴露于空气污染相关的差异代谢物,包括8种脂质、6种核酸、7种氨基酸及其衍生物、3种葡萄糖和9种其他代谢物。KEGG通路分析表明,***富集到5种代谢通路,与免疫、炎症、人类的环境压力、缺血和缺氧有关。非靶向代谢组学,靶向代谢组学研究经验。上海靶向代谢组学

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非靶向代谢组学研究:利用番茄的自然变异确定番茄复合体中果实多酚的途径结构和代谢调控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究对象:番茄组织发表期刊:MolecularPlant影响因子:13.164组学技术:LC-MS靶向代谢组学、GC-MS非靶代谢组(双平台代谢组学),本研究通过表征构成八种不同番茄多酚代谢网络的潜在生物合成和修饰反应,阐明了八种番茄复合体多酚生物合成的整个生物合成框架,并对相关代谢物和结构基因进行了详细注释,并运用LC-MS/GC-MS双平台代谢组学方法为辅助育种提供帮助。此外,番茄果实成熟过程中的代谢变化为今后基于遗传的代谢工程设计提供了研究方向,并为研究其他重要植物物种中特定的代谢物的功能提供了理论依据。北京代谢组学是什么

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