反转录酶的注意事项,随机引物:适合各种RNA的RT,尤其适合模板丰度很低的情况(比如某个gene表达量很低)。选择随机引物时,首先链cDNA合成反应中就是以所有的RNA为模板,然后进行PCR反应时设计引物进行特异性扩增。同时要注意随机引物的量和总RNA量之间的关系,一般建议每5μg总RNA的随机引物的用量为50ng,如果每5μg总RNA的随机引物的用量超过250ng,可能会导致小片段产物(<500bp)的增加和长片断、全长产物产物的降低。酵母菌逆转录酶是逆转录酶家族中的一个重要表示,逆转录在研究RNA表达调控等领域有普遍的应用前景。HIV病毒复制的一个重要步骤就是逆转录。苏州加尾法反转录测序
逆转录实验过程中要注意RNA样品的保存、纯化、处理和转录酶的选择,逆转录实验前要对反应体系进行无RNA和无反转录酶的对照。多逆转录酶都具有多种酶活性,主要包括以下几种活性。①RNA指导的DNA聚合酶活性;以RNA为模板,催化dNTP聚合成DNA的过程。此酶需要RNA为引物,多为色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反转录酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此没有校正功能,所以由反转录酶催化合成的DNA出错率比较高。②RNaseH活性;由反转录酶催化合成的cDNA与模板RNA形成的杂交分子,将由RNaseH从RNA5′端水解掉RNA分子。苏州加尾法反转录测序逆转录引物的设计需要考虑反向引物的特性。
逆转录过程是病毒的复制形式之一,如RNA病毒中的逆转录病毒,DNA病毒中的拟逆转录病毒的复制均需要经过逆转录。逆转录过程在真核细胞中也同样存在,例如逆转座子和端粒DNA的延长均存在逆转录过程,需逆转录酶的催化,端粒酶即为真核细胞中的逆转录酶。逆转录过程的揭示是分子生物学研究中的重大发现,是对中心法则的重要修正和补充。人们通过体外模拟该过程,以样本中提取的mRNA为模板,在逆转录酶的作用下,合成出互补的cDNA,构建cDNA文库,并从中筛选特异的目的基因。该方法已成为基因工程技术中较常用的获得目的基因的策略之一。
反转录酶(reversetranscriptase,也可写成逆转录酶)又称为依赖RNA的DNA聚合酶。1970年Temin等在致死RNA病毒中发现了一种特殊的DNA聚合酶,该酶以RNA为模板,以dNTP为底物,tRNA(主要是色氨酸tRNA)为引物,在tRNA3'-OH末端上,根据碱基配对的原则,按5'-3'方向合成一条与RNA模板互补的DNA单链,这条DNA单链叫做互补DNA(complementaryDNA,CDNA)。反转录酶(Reversetranscriptase)是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA(cDNA)的酶。哺乳类C型病毒的反转录酶和鼠类B型病毒的反转录酶都是一条多肽链。鸟类RNA病毒的反转录酶则由两上亚基结构。真核生物中也都分离出具有不同结构的反转录酶。逆转录是一种将RNA反转录为DNA的生物化学过程。
逆转录过程由逆转录酶催化,此酶也称依赖RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA为模板催化DNA链的合成。合成的DNA链称为与RNA互补DNA(complementaryDNA,cDNA)。逆转录酶在生物界存在于逆转录病毒以及真核细胞(如端粒酶)中,拟逆转录病毒没有单独的逆转录酶,其DNA聚合酶带有逆转录酶的活性,可能与病毒的恶性转化有关。人类免疫缺陷病毒(HIV)就是一种逆转录病毒,含有逆转录酶。在小鼠及人的正常细胞和胚胎细胞中也有逆转录酶,例如端粒酶就是一种逆转录酶,推测可能与细胞分化和胚胎发育有关。高效的逆转录体系可提高反应效率和检测灵敏度。苏州加尾法反转录测序
逆转录是以RNA为模板合成DNA的过程,即RNA指导下的DNA合成。苏州加尾法反转录测序
逆转录的发现有重要的理论意义和实践意义。对分子生物学的中心法则进行了修正和补充。经典的中心法则认为:DNA的功能兼有遗传信息的传递和表达,因此,DNA处于生命活动的中心位置。逆转录现象说明:至少在某些生物中,RNA同样兼有遗传信息传递和表达功能。修正后的中心法则表示为:是指遗传信息从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质,即完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给DNA,即完成DNA的复制过程。这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。某些病毒中的RNA自我复制和在某些病毒中能以RNA为模板逆转录成DNA的过程(某些致死病毒)。有些亚病毒例如朊病毒,这种亚病毒没有核酸,是一种因错误折叠而形成的结构异常的蛋白质,以蛋白质直接形成蛋白质,可促使与自身具有相同氨基酸序列的蛋白质发生同样的折叠错误,从而导致大量结构异常的蛋白质的形成。当然,一般不认为亚病毒属于生物。苏州加尾法反转录测序