反转录酶的选择：反转录酶（Reversetranscriptase）又称逆转录酶。是以RNA为模板指导dNTP合成互补DNA（cDNA）的酶。一部分反转录酶具有RNA酶活性，能够在转录后降解RNA-DNA杂交链中的RNA链。如果反转录酶没有Rnase酶活性，可加入RNaseH来获得更高的qPCR效率。常用的酶包括Money鼠白血病病毒（MMLV）反转录酶和禽成髓细胞瘤病毒（AMV）反转录酶。依据RT-PCR，理想的状态下是选择具有较高热稳定性的反转录酶，cDNA的合成才能在较高的温度下进行，确保成功转录具有较高二级结构的RNA，并确保在整个反应过程中的全部活性，从而得到质量更高的cDNA。逆转录也可作为RNA表达谱的分析方法。北京快速逆转录试剂价格
逆转录引物：加尾法逆转录引物的结构并不是想象中那么简单的oligodT，其包含三个关键结构：①为了与PolyA序列互补配对，OligodT序列必不可少。②在OligodT序列的5端，存在一段通用序列，用于qPCR过程中反向引物与cDNA的结合。③OligodT序列的3端存在一个或两个锚定碱基，V或者VN。(兼并碱基，V表示A、G或C，N表示ATCG中的任意一种)。如果没有锚定碱基，逆转录引物中的OligodT就会随机结合到PolyA的任意位置，这样会造成同一miRNA的逆转录产物长度不一，给较后的熔解曲线检测带来麻烦。因此，锚定碱基的作用就是特异性地结合到miRNA上，从而让逆转录引物结合到紧挨着miRNA的那段PolyA序列上。只有这样，才能够保证同一miRNA的逆转录产物大小相同。深圳快速逆转录公司逆转录是一种将RNA反转录为DNA的生物化学过程。
RT-PCR逆转录引物设计原则：1.上下游引物要保守：扩增子长度需选择一段保守片段（100-200bp）进行PCR扩增，选择片段需跨越内含子，因内含子的基因组DNA序列不会被扩增，也可减少从污染的基因组DNA中扩增得到的假阳性风险。引物选取同样需要保守。2.引物长度和Tm值：引物设计长度为18-25bp，Tm值在50-65℃之间，引物中GC含量在40-60%。设计引物时尽量避免出现4个或超过4个G碱基。RT-PCR实验阴性对照：反转录阴性对照应包括在所有的RT-PCR的实验中，用来检测DNA是否污染（如基因组DNA或PCR产物）。该对照所指不加反转录酶，通过反转录过程得到cDNA在进行荧光定量PCR检测。如检测到扩增，则样本中可能含有基因组DNA污染。
miRNA逆转录茎环法：首先需要进行RNA样品制备，可选的方法有：离心柱法抽提（不必去除gDNA）；传统Trizol法抽提（需要去除gDNA）。miRNA正向引物：需要分别设计。是否采用通用引物视情况而定，正向引物与通用反向引物不会形成二聚体时才能用。取200ul的PCR管，根据所得每组RNA的浓度C，每孔加入1000ng总RNA，按公式1000ng/C计算出所需RNA的体积x。然后按建议的20μL反应体系说明，依次向200μL的PCR管内加入下列试剂：加样结束后，移液器吹打混匀，低速离心数秒。将逆转录PCR管放入PCR扩增仪内，调整参数：37℃15min（反转录反应），85℃5s（反转录酶的失活反应），4℃∞。反应结束后根据实验需要进行荧光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。说明：此处可以选择U6下游引物作为U6的逆转录引物，注意相应地调整无酶水的体积和反应温度。逆转录实验过程中避免光照，防止RNA样品和试剂受光降解或刺激。
逆转录实验步骤：引物浓度计算方法：（新合成的引物的稀释）假如终浓度为XuM（pmol/ul）加DEPC水体积（ul）=（OD×33×1000000）/（分子量×X）。用AMV逆转录酶进行RT（10ul体积）1、准备0.65mlEP管。2、加入4.5ulDEPC水，1ul引物，1ul模板RNA。3、稍离心，100℃沸水裕1min。4、加入0.5uldNTP，2ul5×Buffer，1ulAMV逆转录酶。5、稍离心，封口膜封口，42℃水浴90℃作RT。6、100℃沸水裕3min灭活AMV。7、立即PCR或－20℃保存。逆转录实验时注意事项：为避免RNA酶污染，在RT中仍要佩戴一次性手套和口罩。逆转录技术应用于人类基因组的研究。南京彩色逆转录混合测序
逆转录实验完成反应后要及时保存和处理PCR产物，并记录实验数据和结果等。北京快速逆转录试剂价格
逆转录酶的合成步骤：1、使用前每个组份轻轻混匀，然后2000rpm离心20s；2、取灭过菌且无核酸酶的0.2ml离心管，依次加入2～5μgRNAnμL；3、65℃保温5min，然后冰浴5min；4、往3步骤中的0.2ml离心管依次加入下列组份：RNase抑制剂（40u/μL）0.5μL、10×M-MLVReactionBuffer2μL、DTT（200mM）1μL、逆转录酶（M-MLV）1μL；5、轻轻混匀后，然后2000rpm离心20s；6、先在37℃保温1hr，然后70℃保温15min；7、上述产物可立即进行下一步的PCR反应或-20℃保存。逆转录酶的质量控制：物理纯度：在SDS－PAGE上>90%纯。储存缓冲液：20mMTris-HClpH7.5；200mMNaCl；0.1mMEDTA；1mMDTT；0.01%NP-40(一种去垢剂)和50%甘油。反应缓冲液：250mMTris-HClpH8.3；375mMKCl；15mMMgCl2；50mMDTT(以Part#M531A供应)。北京快速逆转录试剂价格
