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逆转录基本参数
  • 品牌
  • 苏州英泽生物医药科技有限公司
  • 型号
  • 型号齐全
逆转录企业商机

RNA逆转录实验注意事项:去除基因组DNA污染:残留的基因组DNA(gDNA)会对荧光定量结果造成很大的干扰,为了使结果更加的真实、可重复,我们需要去除gDNA干扰。我们可以在引物设计时避免gDNA的扩增,比如将上下游引物分别设在不同的外显子上;或者在提取RNA后使用DNaseI处理以除去gDNA。较后,我们还有非常法宝,选择一款具有gDNA去除功能的逆转录试剂盒,一步到位去除gDNA,省心省力max。RNA逆转录实验注意事项:逆转录酶热稳定性:逆转录酶在整个反转录体系中具有关键性影响。除了活性以外,逆转录酶的热稳定性同样很重要,在较高温度下进行逆转录,能够减少RNA的二级结构,增加逆转录的效率。野生型的M-MLV逆转录酶很“怕热”,高于37℃时,稳定性大幅下降。逆转录过程由逆转录酶催化,此酶也称依赖RNA的DNA聚合酶,即以RNA为模板催化DNA链的合成。苏州彩色逆转录混合公司

逆转录酶还有DNA内切酶活性,这可能与病毒基因整合到宿主细胞染色体DNA中有关。逆转录酶的发现对于遗传工程技术起了很大的推动作用,它已成为一种重要的工具酶。用组织细胞提取mRNA并以它为模板,在逆转录酶的作用下,合成出互补的cDNA,由此可构建出cDNA文库(cDNAlibrary),从中筛选特异的目的基因,这是在基因工程技术中较常用的获得目的基因的方法。简要过程表示:逆转录酶的作用是以dNTP为底物,以RNA为模板,tRNA(主要是色氨酸tRNA)为引物,在tRNA3'-末端上,按5'→3'方向,合成一条与RNA模板互补的cDNA单链,它与RNA模板形成RNA-cDNA杂交体。随后又在反转录酶的作用下,水解掉RNA链,再以cDNA为模板合成第二条DNA链。至此,完成由RNA指导的DNA合成过程。病毒复制方式:逆转录病毒(属于RNA病毒):RNA→DNA→RNA。拟逆转录病毒(属于DNA病毒):DNA→RNA→DNA。苏州彩色逆转录混合公司逆转录实验避免RNA样品的过冻、过热处理,影响逆转录反应的效果。

逆转录时试剂没混匀会怎么样?会出现起泡现象。RT-PCR的试剂都应在冰上融化,等完全融化后再取;用过的试剂应瞬间离心后放回-20℃保存;试剂应按顺序加,加完后再混匀离心。使用ReverTra-Ace、RNase-Inhibitor等酶类时,没有混匀,会出现起泡现象;由于酶保存液中含有50%的甘油,粘度高,分取时应慢慢吸取。miRNA的RT-PCR:1)引物稀释:miRNARTPrimer储存液浓度:10μM。miRNARTPrimer工作液浓度:2μM。RTPrimer工作液配置:5μLRT-primer储存液+45μLDEPC水。miRNA前后引物的工作液(10μM)用储存液(100μM)稀释后分装,放入-20℃冰箱保存,避免反复冻融。

逆转录酶的合成步骤:1、使用前每个组份轻轻混匀,然后2000rpm离心20s;2、取灭过菌且无核酸酶的0.2ml离心管,依次加入2~5μgRNAnμL;3、65℃保温5min,然后冰浴5min;4、往3步骤中的0.2ml离心管依次加入下列组份:RNase抑制剂(40u/μL)0.5μL、10×M-MLVReactionBuffer2μL、DTT(200mM)1μL、逆转录酶(M-MLV)1μL;5、轻轻混匀后,然后2000rpm离心20s;6、先在37℃保温1hr,然后70℃保温15min;7、上述产物可立即进行下一步的PCR反应或-20℃保存。逆转录酶的质量控制:物理纯度:在SDS-PAGE上>90%纯。储存缓冲液:20mMTris-HClpH7.5;200mMNaCl;0.1mMEDTA;1mMDTT;0.01%NP-40(一种去垢剂)和50%甘油。反应缓冲液:250mMTris-HClpH8.3;375mMKCl;15mMMgCl2;50mMDTT(以Part#M531A供应)。逆转录可用于新型病毒的检测。

miRNA的加尾法逆转录和qPCR,miRNA与mRNA不同,成熟的miRNA的长度只有20nt左右,非常短,通常正向引物就足以覆盖其全长甚至有余,反向引物就无处安放了。那么如何实现miRNA的qPCR扩增呢?解决方案就是在逆转录的时候设法增加逆转录产物长度。普遍的方法有两种,加尾法和茎环法。经过加尾法或茎环法这种特殊的逆转录形式处理之后,得到的cDNA长度从原始的20nt增加到80nt以上,这样就能够实现miRNA的qPCR扩增了。RNA逆转录实验注意事项:选择合适的引物:但其对RNA的完整度和二级结构的要求较高,而且不适用于原核生物。随机引物可以根据碱基情况结合到几乎所有的RNA上,包括mRNA、tRNA和rRNA。逆转录活性可以RNA为模板,合成与其序列互补的DNA链,生成DNA-RNA杂合双链。苏州彩色逆转录混合公司

逆转录在病毒学、免疫学等领域有普遍的应用。苏州彩色逆转录混合公司

反转录酶的注意事项,引物的选择,OligodT:选择OligodT时,要求RNA必须有PolyA,所以真核生物的mRNA都适用。适合长链甚至全长mRNA的RT,所以对RNA样品的质量要求较高,较好不要有明显的DNA污染、RNA降解和RNA断裂。假如想探索新的mRNA进行RT反应,建议推荐使用OligodT引物。使用OligodT引物要比随机引物和特异性引物的稳定性要好。特异性引物:特异性引物只能用你设计引物时的下游引物做RT,引物设计质量影响RT的结果,而且不同引物退火温度本来就不相同,所以按照说明书按照一个温度做不是较佳选择,一般不推荐。苏州彩色逆转录混合公司

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