烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台,针对庞大的单细胞测序数据,能够实现细胞类型鉴定的快、精、准:一键导入gene list构建个性化基因列表;轻松一点即可展示Marker基因的Feature plot;任意修改Cluster的颜色和名称助力高效鉴定细胞类型;一键获得t-SNE图、Heatmap和Violin图:轻松获得并下载基因表达的t-SNE图、Heatmap、Violin图,还可以通过调节宽、高和系数比例来调节美观。平台上线300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,帮助烈冰生信分析团队和自主分析用户实现分析工具和模板的快速调用和一站式全流程自动化分析,节省工作时间并提升整体工作效率。烈冰生物为您提供多平台一站式全流程单细胞测序服务。长沙高通量测序单细胞测序技术支持
单细胞测序实验再样本细胞上机分选签,需要对细胞数量、细胞活性进准判断,这对Single Cell分选标记、建库、下机数据的质量都具有着决定性的作用。如若细胞计数偏高,将会影响建库的成功率;计数偏低,则会提高双细胞的比例;而细胞活率过低,就会使测序数据的利用率大打折扣,因此把好单细胞悬液质量这一关尤为重要。而在铺板过程中,由于不同操作人员手法具有不可避免的差异,不同的液体流速将直接影响单细胞的入孔效果。因此烈冰生物BD Rhapsody单细胞分选平台配套了专门定制的电动移液器,其具有Prime Treat、Cell Load、Bead Load、Wash、Lysis、Retrieval多种操作模式,来对应各种不同的操作。通过已经设定的程序来控制液体的流速,大幅度降低人为操作习惯带来的差异,保证实验操作的一致性。合肥10X单细胞测序烈冰斥巨资引进Novaseq6000,开启更大通量测序新纪元。
高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(“Next-generation” sequencing),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。高通量测序技术是对传统测序一次颠覆性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的 分析成为可能,所以又被称为深度测序(deep sequencing)。而烈冰科技具有专业生物背景和十二年科研服务经验,已助力Nature,immunity等在内的300+篇CNS文章发表。
为什么需要单细胞分辨率? 生物学就像宇宙一样。它非常复杂,有许多独特的单体,也就是细胞。这些细胞相互作用并扮演不同的角色,在更大的体系中构建并驱动多个过程。就像伽利略探索宇宙的努力一样,发现和定义这些细胞也需要高分辨率的工具,才能解开促成生物学复杂性的基因表达异质性。单细胞测序能够在以一个细胞为功能单位中开展生物学研究,阐明具体细节,构建出一幅更大、更精细的图谱,说明导致产生某种外在表型的不同类型的分子和细胞之间是如何相互作用的:患者为什么会复发?是什么让这种疫苗能够有效防止传染等等诸多问题。搭建多种测序数据的生物信息分析平台,5000+项目检验,真实可信赖。
烈冰生物成立于2010年,与时俱进,坚持为科研学者提供国际前沿的高通量测序实验和深度的生物信息数据分析服务,已逐步发展为单细胞多组学检测服务****。专注于“单细胞测序系列技术服务”的专精领域,在上海、北京、广州、西安和江西等地拥有数千平办公场所,并布局多中心产品研发生产基地和营销、运营中心。2016年起连续被评为上海市****,60+项自主知识产权,转化率近80%。产品覆盖从单细胞测序,核测序,单细胞多组学,空间转录组测序等多组学联合的实验+数据分析全流程服务平台。为600+国内高校和医院、5000+深度合作学者用户、10000+生命科学探索的重要科研项目在医药开发、科学研究、医学及临床研究,疾病分子标志物筛选、生命和神经发育研究等提供多层次、多组学检测服务和解决方案,助力300+CNS国际学术期刊文章发表,30+篇单细胞技术联合(助力)发文,IF 10+文章占比>65%。测序可准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学重要问题。武汉高通量测序单细胞测序服务公司
全线搭建10x Genomics单细胞测序平台。长沙高通量测序单细胞测序技术支持
针对单细胞测序的细胞数量判断环节:主要是对细胞数量、基因表达量、测序质量进行整体描述。过滤标准:由于细胞破碎后游离RNA会释放到环境或孔中,并且测序中也会存在一些死细胞,导致数据存在background值。因此,我们需要设定一定的标准来过滤掉假细胞或死细胞。以10× Genomics为例,细胞数量判断主要通过分析UMI Counts-Barcode曲线斜率拐点,当存在多个斜率拐点的时候,结合预期UMI=500时的细胞数量进行过滤。当斜率拐点低于UMI=500的时候,选择UMI=500作为细胞的判断的标准;否则,选择和预期细胞数量接近的拐点作为细胞判断的位置。这样我们能够有效获得真实的并且在基因数量上可以分析的数据。长沙高通量测序单细胞测序技术支持
上海烈冰生物医药科技有限公司是一家服务型类企业,积极探索行业发展,努力实现产品创新。公司致力于为客户提供安全、质量有保证的良好产品及服务,是一家有限责任公司(自然)企业。公司拥有专业的技术团队,具有单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序等多项业务。烈冰生物自成立以来,一直坚持走正规化、专业化路线,得到了广大客户及社会各界的普遍认可与大力支持。