在生物工艺流程中，需要使用核酸酶去除终产品中的核酸污染，而核酸酶作为外源成份，也需要在生产流程中去除。核酸酶去除工艺包括热灭活法、酶抑制剂、离子交换和亲合层析法等。AAV衣壳亚种之间因表面电荷的差异导致不同的的等电点，——空衣壳pI在6.3左右，包装了完整基因组DNA后的病毒颗粒pI大致为5.9。而来自于S.marcescens的全能核酸酶pI 6.85左右，SAN HQ高盐核酸酶pI 9.6左右。因此，在同样的条件下，从AAV溶液中去除SAN HQ高盐核酸酶比去除Benzonase全能核酸酶更容易、更彻底。SAN HQ高盐核酸酶在盐浓度400-650mM条件下活性达到峰值。福建高盐核酸酶70921-160
三种AAV载体的生产体系（三质粒瞬转体系、杆状病毒表达载体体系以及包装细胞体系） 中都会出现三种衣壳：完整衣壳（full capsid）、部分衣壳（partial capsid），和空衣壳（empty capsid）。其中完整衣壳包含正确的DNA序列，是人们所期待的产品；部分衣壳和空衣壳包含部分不包含目的基因，属于生产中的杂质，约占细胞生产的总AAV颗粒的50%-90%。空衣壳/部分衣壳有如下几种危害：1), 影响产品的纯度，2), 增加终产品的免疫原性，3), 与完整衣壳竞争infection细胞上的载体结合受体，抑制完整衣壳的转导，4),增加总体病毒载量。部分衣壳与空衣壳地存在严重地影响了AAV产品的安全性和有效性，因此监管机构强烈建议在整个生产过程中监控空/完整衣壳比（空壳率）。福建高盐核酸酶70921-160鉴于生物制品药物更严格的质量要求，厂家对SAN HQ高盐核酸酶的生产及质控符合更高标准。
由于Triton X-100的降解产物对环境影响很大，自2023年12月22日起，欧盟将禁止使用Triton X-100生产试验性医疗产品等。请注意，含有≤0.1% (w/w) Triton X-100表面活性剂的物质不被视为危险物质，仍然可以进口到欧洲。由于该产品通常不用作生物制品或先进疗法的赋形剂，因此在欧洲以外生产的大多数药物在其开发商考虑在欧盟生产之前不需要生产变更。此外，已经获得许可的药物及其赋形剂不受该规则约束。所有其它希望在欧盟生产生物药物和研究产品的生产商都必须寻求Triton X-100的替代品并验证它们对各自用途的适用性。为了支持客户项目更好在欧盟区域申报上市，ArcticZymes Technologies于2019年推出了Triton X-100 Free的SAN HQ TF高盐核酸酶。与SAN HQ高盐核酸酶相比，SAN HQ TF用Tween-20替代了Triton X-100，酶活性能完全一致。目前，SAN HQ和SAN HQ TF都有项目在临床阶段，相关性能都得到了行业客户的认可。
染色质由组蛋白和DNA组成，——147个碱基对的DNA缠绕在8个组蛋白（由H2A、H2B、H3和H4形成的八聚体）周围，形成基本的染色质单位，即核小体。核小体像珠串一样串连在一起，并被包装成更高阶的染色质结构。DNA带负电荷，富含碱性氨基酸的组蛋白带正电荷，且组蛋白多聚物有很多疏水区段。所有这些特点导致宿主DNA残留（HCD）能吸附很多物质，包括宿主蛋白残留（HCD）、色谱填料、目的病毒颗粒等，因此，HCD的存在增加了工艺流程的复杂度，同时也降低了病毒颗粒的稳定性。ArcticZymes Technologies的研发基于北极海洋区的自然资源。
综合腺相关病毒AAV制备的三个工艺阶段介绍，可以看出下游处理可以占病毒生产总成本的很大一部分，而且难度也是非常大，尤其是纯化过程。原因之一是由于有超过100种不同血清型的变体AAV衣壳，不同血清型的AAV蛋白存在差异。因此，各种血清型的表面特性增加AAV纯化难度。原因之二是：针对工艺和产品相关的杂质（包括宿主细胞物质，DNA和空衣壳），缺乏一个有效和可重复的平台方法，尤其是来从空衣壳中分离出完整的衣壳。为了解决以上问题，国内外大的药企公司都致力于纯化新产品的开发，以期达到：（1）实现病毒颗粒的分离（2）减少产品相关杂质（3）保持效力和产量的目标。使用Benzonase时，不能把载体表面的DNA去除彻底，因而不能阻止纯化的病毒载体聚集。甘肃500mM盐浓度条件高盐核酸酶
鉴于其在高盐条件下的较高活性，SAN HQ高盐核酸酶在不损失载体产量和活性的情况下改善了下游工艺。福建高盐核酸酶70921-160
监管部门对HCD的残留量有明确的规定。美国FDA发布的指导原则中指出生物制品HCD残余限度为 100pg/剂，对于大剂量生物制品如单克隆抗体，根据其残留DNA来源及给药途径，残留量可放宽至 10ng/剂。细胞基因药物终产品的DNA残留有两种来源，分别是宿主细胞DNA（HCD）和转染用的质粒。质粒和HCD的存在形式不同，去除效率也差别很大。其中，质粒是裸露的DNA双链，带强负电荷，通过色谱纯化主要是离子交换能够很高效去除；HCD则是以核小体紧密折叠形成的染色质形式存在，几乎不以裸DNA形式存在，所以很难去除。福建高盐核酸酶70921-160
一般来说，生物生产工艺用的核酸酶以BenzonaseTM（BenzonaseTM是Merck的注册商...
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