当你应用像肽图这样的方法时,你可以从Genovis中级方法中获得的信息量就没有那么多了。一个主要的区别是你不能像在肽水平上那样将修改定位到单个氨基酸。然而,中级分析比肽图谱具有快速和简单的巨大优势,因为需要分析的色谱峰要少得多,数据处理任务要简单得多。此外,在中级实验中,手工实验步骤要少得多,FabALACTICA(IdeS)酶切消化方法不需要针对不同的人体IgG1进行优化。一旦在氨基酸水平上进行了PTM表征,我们非常认为中级表征肽图的一种补充方法,可以在更常规的基础上应用。中级分析更适用于高通量或监测类型的方法,并可用于支持肽图分析。IgASAP Sub1+2 是从丹毒梭菌克隆而来的,并在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签,分子量为 131 kDa。江苏GingisKHANIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
Genovis的FabRICATOR是一种半胱氨酸蛋白酶,它对许多不同的物种和IgG亚类都有活性,包括人IgG亚类1-4以及猴子、兔子、大鼠和绵羊IgG的一些亚类。FabRICATOR在铰链下方的单个位点进行消化,生成F(ab’)2和Fc/2子基,可以进一步还原生成Fd’,轻链和F/2子基是必需的。FabRICATOR(IdeS)通过蛋白-蛋白相互作用与目标抗体工作,这说明了它的高特异性。事实上,它在单个位点消化意味着使用FabRICATOR时没有过度消化的风险,其高特异性也意味着相同的消化方案可以作为平台方法应用于许多不同的抗体。FabRICATOR(IdeS)不需要还原条件来获得良好活性,也不需要任何额外的辅助因子,它将在不同生理缓冲中发挥作用。这意味着按照下面的铰链消解,您将生成F(ab’)2和Fc/2片段用于分析或其他应用。天津IdeS蛋白酶蛋白组学Genovis提供IdeS蛋白酶色谱柱,使得抗体消化和亚基生成的自动化使生物反应器的在线监测应用成为可能。
与IdeS不同。Genovis的IgASAPSub1是一种IgA1特异性酶,可在铰链上方的一个特定位点消化人IgA1,产生完整且均质的Fab和Fc片段。IgASAPSub1可水解分泌物和血清IgA1。消化在1小时内完成,并且由于酶的特异性,如果孵育时间延长,则不存在过度消化的风险。该酶在pH值6.5至8.0下具有活性,不需要还原条件或辅助因子即可发挥活性。活性是在37°C下,但也可以在室温下使用增加孵育时间进行消化。IgASAPSub1是从口腔链球菌克隆而来的,并在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为148kDa。IgASAPSub1冻干剂以冻干粉的形式提供,装在1000个单位的小瓶中,用于消化1mgIgA1。
Genovis的FabDELLO在铰链上方的单个位点消化人IgG1,并在两小时内生成均质的Fab和Fc片段(Genovis的IdeS在铰链区下方的单个位点进行消化)。生成的片段可用于结晶和高阶结构(HOS)的NMR研究、结合研究等。突变的铰链区域是zhiliao性候选抗体的常见修饰,以降低效应器功能。这些突变可能会影响具有高底物特异性的酶的抗体消化效率。例如,高度特异性的FabRICATOR(IdeS)消化效率对含有常见LALA突变的抗体产生负面影响。FabDELLO作用于人IgG1铰链上方的单个暴露赖氨酸残基,能够对具有突变铰链区域的抗体进行流行的中级LC-MS分析。例如,用FabDELLO消化市售的IgG1risankizumab,在下铰链区域具有LALA突变,并通过反相LC-MS进行分析。消化产生均匀的Fab和Fc片段。用20mMDTT还原片段,用于中级LC-MS分析,发现产生了均相的Fc/2、轻链(LC)和Fd片段。用FabDELLO消化后观察到的定义峰显示出均匀的片段生成和酶的稳健性能。使用GlySERIAS固定化酶和内切糖苷酶GlycINATOR消化度拉糖肽。
与IdeS不同,Genovis的GlySERIAS是一种独特的酶,可消化柔性富含甘氨酸的融合蛋白连接子,例如Gly4Ser和GlyxSery(GS)以及聚甘氨酸(G)接头。该酶能够分离多功能融合蛋白的各个结构域,以促进表征并增加对这些分子的理解。融合蛋白的中级分析既可以降低整体样品的复杂性,又可以对翻译后修饰进行结构域特异性鉴定和监测。为了改善连接子的去除,Genovis建议使用GlySERIASImmobilized。对于连接子表征,我们推荐GlySERIAS冻干。具有柔性接头的独特酶消化融合蛋白;中级方法可降低融合蛋白表征的复杂性;复杂融合蛋白的可靠且可重复的消化。Genovis的GlySERIAS酶切由甘氨酸或甘氨酸和丝氨酸残基的重复序列组成的柔性连接子。该酶在天然反应条件下具有活性,能够对复杂的融合蛋白进行中级表征。连接子区域同时在多个位点被消化,导致先前连接的组分分离。活性发生在pH7.6下,孵育时间可以根据所需的产物而变化。GlySERIAS是从噬菌体K克隆而来的,在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为18kDa。Genovis的GingisKHAN 可以消化单克隆人 IgG1 抗体和 Fc 融合蛋白。陕西IgGZEROIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
例如氧化、糖基化等翻译后修饰,可以用IdeS酶。江苏GingisKHANIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
为了让所有实验室都能同时快速自动消化多种抗体,Genovis的FabRICATORMagIC的设计具有灵活性,适用于一系列自动化平台。我们在ThermoScientific™KingFisher™纯化系统上优化了FabRICATORMagIC的工作流程,但它可以转移到其他自动化平台,如果没有自动化,在振动台上也能同样出色地工作。消解后,将含有处理样品的深孔板直接转移到LC-MS的自动进样器中进行快速色谱分析,或转移到其他分析方法进行分析。FabRICATORMagIC与在消解缓冲液中添加0.05%聚山梨醇酯20兼容,以极大限度地减少自动化系统中可能发生的纯粹压力。使用KingFisher仪器处理样品时,样品制备非常简单。将样品、树脂和缓冲液移液到指定的孔或板中,然后将板放入仪器中。设计用于FabRICATORMagIC的BindIt™协议将控制每个步骤的孵育温度和时间。江苏GingisKHANIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
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