化肥中不含有机质、腐殖质，因此大量使用化肥，土壤由于有机质和腐殖质的缺乏，土壤团粒结构遭到破坏，造成土壤板结，农植物产量下降。
化肥利用率低，氮肥因为易挥发、流失，利用率只有30%-50%，磷肥的利用率才10%-25%，因为磷酸根化学活性活泼，施入土壤后大部分磷与土壤中的Zn2+、Mg2+、Ca2+、Fe3+、Al3+等阳离子结合形成难溶性磷肥。钾的利用率也只有50%左右。
化肥大量使用使蔬菜瓜果品质**下降。由于作物不仅只需要氮磷钾，同时还需要钙铁锌硒等许多微量元素，而化肥一般成分比较单一，所以长期使用化肥必然导致土壤中所含养分趋于单一，易使作物营养失调，从而导致作物内部转化合成受阻，必然导致作物品质下降，瓜不甜，菜不香。
危害人体健康。大量施用化肥，易使蔬菜中硝酸盐含量超标，而亚硝酸盐与胺类物质结合形成N-亚硝酸基化合物为强致*物质。
化肥的大量使用，还造成土壤的有益菌、蚯蚓的大量死亡。
化肥的长期低效施用，往往造成土壤中某些元素的过分积累和土壤理化性质的变化及环境的污染。
从中国大量使用化肥看，越使用化肥，地力就越下降，就越依赖化肥，由此形成恶性循环。
微生物肥料中有益微生物能产生糖类物质，与植物粘液、矿物胚体和有机胶体结合在一起。贵州质量生物菌肥技术指导
首先，要选择正规厂家的产品。具备农业部微生物肥料登记证，包括：微生物菌剂登记证、生物有机肥登记证，或复合微生物肥料登记证；其次，要核对执行标准。农用微生物菌剂执行的是国家标准，为GB20287-2006，生物有机肥和复合微生物肥执行的是行业标准，分别为NY884---2012和NY/T798-2015；再次，要查看包装袋上菌数的标注。菌剂中的有效活菌数液体含量要≥2亿/克颗粒的要≥1亿/克，生物有机肥和复合微生物肥中的有效活菌数含量要≥2000万/克。在满足以上3个条件的情况下，用户可以根据所需要的功能选择含有特定功能菌种的微生物菌肥。菌肥的质量要看其所含“有效活菌”的数量，活菌越多效果约好，特别说明要是活菌！河南通常生物菌肥价格实惠肥料效果的发挥与微生物菌群繁殖速度、菌群数量关系紧密，菌群生长存在周期。
巨大芽孢杆菌：解磷促钾，提高植物对磷钾的吸收利用，促进肥效。胶冻样芽孢杆菌：解钾，释放出可溶磷钾元素及钙、硫、镁、铁、锌、钼、锰等中微量元素。侧孢芽孢杆菌：促根、杀菌及降解重金属。胶质芽孢杆菌：有溶磷、释钾和固氮功能，分泌多种酶，增强作物对一些病害的抵抗力。泾阳链霉菌：具有增强土壤肥力、刺激作物生长的能力。棕色固氮菌：固定空气中的游离氮，增产。圆褐固氮菌：固氮、提高作物产量。放线菌：拮抗病原菌防病壮菌的作用，分泌细胞分裂素促进作物的生长。光合菌群：合成糖类、氨基酸类、维生素类、氮素化合物、抗病毒物质和生理活性物质等，是肥沃土壤和促进动植物生长的主力**。乳酸菌群：具有很强的杀菌能力，能有效***有害微生物的活动和有机物的急剧**分解，能够分解在常态下不易分解的木质素和纤维素，并使有机物发酵分解。乳酸菌还能够***连作障碍产生的致病菌增殖。
曾经就有个陕西咸阳的果友来咨询我们说，他家的生物菌用下去20天了，但是却没有任何作用，为什么呢？仔细一问才知道，他把生物菌埋进土里头之后，就没有再理会了，在太阳晒得土都能冒的情况下依然没有浇水。这种情况下，生物菌肯定是不能活的了，更不要说繁殖了。这位果友又问，那为什么生物菌在同样没有水和营养了的包装袋里能活呢？这完全是两码事。就像我们前面提到的，生物菌在包装袋里是处于休眠状态的，不需要水分和养分。所以大家一定要注意这些生物菌的正确使用。很多情况下，不是它不管用，而是我们没有用好而已。于各种常用化肥·有机肥配合使用，提高肥料的利用率，增产增收效果.
那么，所有化学肥料都可以与菌肥一起混施吗？不是的！首先，微生物肥料中含有活菌成分，将微生物肥料与杀细菌药剂混合使用且长时间放置，极易影响菌的活性降低并造成部分菌死亡。还有，与化肥混用要注意化肥用量不能过大。高浓度的化学物质对菌肥里的微生物有毒害作用，尤其注意不能与碳酸氢铵等碱性肥料和硝酸钠等生理碱性肥料混用。***，注意千万不要与杀菌剂、杀虫剂、除草剂和含硫化肥，如硫酸钾等以及稻草灰混合用，因为这些药、肥很容易杀死生物菌。在施用时，若施菌肥与防病虫、除草相矛盾时，可先施菌肥，隔48小时后，再打药除草。若拌种，切忌和已拌好杀菌剂的种子混合使用。同时还应防止与未腐熟的农家肥混用，因为农家肥在腐熟的过程中会发酵，这样会直接杀死生物菌。微生物被残留的除草剂物质杀害，土壤中没有足够微生物使菌肥发酵繁衍而形成有效的菌群，阻碍了肥效的发挥。重庆经济型生物菌肥技术指导
微生物与根系、根际土壤一起组成了农作物的‘肠胃’，很多有益微生物与根系形成互补共生关系。贵州质量生物菌肥技术指导
为了获得更高的产量，人类在农田里连续和大量使用了化肥和农药。农田土壤中的有机质匮乏，微生物种类和数量大幅度减少了，其中也包括一些能够压制土传病害的有益微生物，如放线菌、木霉菌、芽胞杆菌等。另一方面，许多危害植物的病菌在病残体中更容易越冬。如果土壤中缺少腐生细菌，植株秸秆不能很快腐烂，病菌也就有了更多的存活机会。也正因为以上原因，近来枯萎病、纹枯病、根腐病、立枯病等日益猖獗。解决土传性的病害的两种策略1继续加强化学或物理的杀灭措施尽可能给作物创造一种无菌的条件。这是比较难的，因为土壤的结构和理化特性比较复杂，有许多因素影响灭菌效果；即便暂时能够做到，但一旦有新的病菌进入，由于缺乏自然压制能力，就会迅速成灾。2增加农田土壤微生物种类和数量创造一个合理、平衡、稳定的微生物区系并依靠他们之间的竞争、占位、重寄生等关系，压制病菌的滋长。实践证明这是持续防治病害的合理策略。压制土传病害一方面需要不断增加土壤有机质，包括农家肥（厩肥、堆肥）、工厂化生产的有机肥、秸秆还田和种植草苜蓿等绿肥作物。有机质不仅蕴涵丰富的营养物质，使土壤形成团粒结构，还是培养各种微生物的基质。贵州质量生物菌肥技术指导
成都盖尔盖司生物科技有限公司是以生物有机肥，菌剂肥，复合微生物肥，有机肥研发、生产、销售、服务为一体的 公司主要从事绿色生物农业资源整合、面源污染、农业废弃物循环治理，生产有机肥、生物有机肥、复合微生物肥，以及其他类新型肥料（水溶肥、滴灌肥、中微量元素肥、灌根肥、**复合肥等）。是一家集科研、生产、销售、售后技术服务咨询于一体的生物科技公司。企业，公司成立于2006-06-14，地址在金堂清江镇新水碾村4组。至创始至今，公司已经颇有规模。公司具有生物有机肥，菌剂肥，复合微生物肥，有机肥等多种产品，根据客户不同的需求，提供不同类型的产品。公司拥有一批热情敬业、经验丰富的服务团队，为客户提供服务。盖尔盖司,美大多,绿盛,通用,美洛迪,赛尔玛,美果菌集中了一批经验丰富的技术及管理专业人才，能为客户提供良好的售前、售中及售后服务，并能根据用户需求，定制产品和配套整体解决方案。成都盖尔盖司生物科技有限公司通过多年的深耕细作，企业已通过农业质量体系认证，确保公司各类产品以高技术、高性能、高精密度服务于广大客户。欢迎各界朋友莅临参观、 指导和业务洽谈。
