认为一种产品中菌的种类越多、菌种数量越大越好复合菌剂的使用效果会受到不同菌种生长习性的影响，盲目的复合，极易造成菌种间的拮抗，影响效果发挥。产品使用后起作用的只有活菌，因此菌衡量的标准为“有效活菌数（CFU）”，有效活菌数量越大效果越好。此外，菌的纯度也至关重要，当产品中霉菌杂菌数及杂菌率超标时也会影响应用。市场上少数不合格产品中含有致病菌，不仅修复不了土壤，还会导致病害发生。不能与农药混用。化肥农药大面积混在一起的时候很可能会把菌杀死，施了生物菌肥以后，接着倒上杀菌药，土壤功能退化及污染加剧，作物生长不良、病害加重、品质下降及产量降低甚至绝收等问题日益严重。安徽生物菌肥品质保障
生物菌肥对阳光中的紫外线十分敏感。存放或使用时尽量避免强光直接照射，因此生产上一般不采用地表撒施，可以在阴天或清晨、傍晚于土壤中施用。喷雾时只要在植物的叶片背面均匀喷布即可。混合使用：生物菌肥可以单独施用，但是不能完全代替化肥或有机肥，事实是与后两者混合使用的效果要好于它们的单独使用。要谨慎不要将菌肥与杀菌剂、杀虫剂、除草剂和含硫的化肥(如硫酸钾等)以及草木灰混合用，因为这些药、肥，很容易杀死生物菌。或者先施菌肥，隔48小时后，再打药除草。若拌种，切忌和已拌好杀菌剂的种子混合使用。还应防止与未腐熟的农家肥混合施用。施用时期：要注重生物菌肥不是***肥，一般做底肥，如果追施，在作物的营养临界期和营养大量吸收期前一周施用，效果好。而在蔬菜等经济作物上，微生物菌剂应采用蘸根、灌根的方式进行集中施用，微生物菌剂的施用量不能过大。因为生物菌肥施入土壤后有一个菌群繁殖、壮大的过程。因此，要先于作物需肥期10-15天施用，此后生物菌肥可以长期、均匀、持续地供给作物养分。湖北功能性生物菌肥制造商微生物被残留的除草剂物质杀害，土壤中没有足够微生物使菌肥发酵繁衍而形成有效的菌群，阻碍了肥效的发挥。
另一方面要增加有益微生物的种类和数量，也就是施用一定数量的菌肥。菌肥也称生物肥料、细菌肥料。确切地说，它们是菌而不是肥，主要成分不是营养元素，而是大量的微生物。它的功效在于通过微生物的活动，改善作物的营养条件并分解土壤中的有机质，使他们变成能够被植物吸收的营养，这就如同人吃的饭菜必须经过消化才能被吸收一样。秸秆还田后如果没有微生物的帮助，不仅不能被植物利用，还可能助长病菌的滋生；另一方面，再好、再多的菌肥撒在贫瘠的土壤中也不可能凭空转换出营养元素，有益微生物也会饿死。只有当有机物与有益微生物同时存在时，才能起到增肥防病的效果。一种按适当比例在大量有机物质中植入有益微生物的生物菌肥，其生物菌肥包括能够增加或转化营养的固氮菌、硝酸菌、溶磷菌、光合菌；能够分解有机质的酵母菌；能够分泌植物生长刺刺激药素和压制病菌的哈刺木霉、绿粘帚霉、放线菌以及一些芽胞杆菌和假单胞菌。生物菌肥种具有长效、快速见效、增产防病的优点，值得推广。它的优劣主要看植入的有益微生物种类和数量。在这里也提醒大家注意，生物菌肥和多效有机肥不宜长时间存放，要避免高温，一般也不能和杀菌剂混用“这是俺自制的生物菌肥,用了它之后。
数量不能说明全部，不但要看菌数量(菌肥粉剂类有效活菌数不低于2亿/克)，还要看有效活菌的数量，使用后起作用的只有活菌，有益活菌数量越大效果会表现越好。三、功能菌种齐全经多年研究微生物菌肥发现复合无拮种施入土壤中所发挥的效果的比单一菌种，效果相对要好。四、所选用的菌在土壤中的定植能力要强生产厂家要有强大的技术研发背景，筛选出抗逆性强，适应环境的能力强、抗性稳定不反复的菌种（如枯草芽孢杆菌、绿色木霉、淡紫拟青霉等）。在蔬菜栽培钟，有机质**主要的来源是有机肥，微生物菌剂与有机肥是一对好搭档。
菌肥中的菌赖以生存的条件是有机质。而80%以上的果园都在施用无机化肥，土壤板结透气性差，使得一些厌气菌大量繁殖，如镰刀菌、齐整小核菌等，菌种的繁殖跟扩散需要有机质跟湿度合理搭配。更严重的是有机肥极度缺乏破坏了土壤的团粒结构，降低了土壤的保肥保水能力。果农施商品有机菌肥一般每亩都在40公斤左右，有机质很快被分解利用，有机肥中的菌种失去赖以生存的条件不能繁衍生存，大部分死亡。这就是果农在施用商品有机菌肥中发现的地厚施有机菌肥有作用而地薄无作用的道理。这些菌种能够与作物根系共生，形成良好的生态环境，提供多种有益物质和生长因子，促进作物的生长和发育。安徽生物菌肥品质保障
那么包装袋上显示的是“XX亿活菌”字样的生物菌呢？毋庸置疑，它是完全具备增殖能力的。安徽生物菌肥品质保障
种类混乱，分不清使用的是菌剂还是菌肥农用微生物菌剂是指目标微生物（有益菌）经过工业化生产扩繁后制成的活菌制剂；微生物菌肥包含复合微生物肥料和生物有机肥，分别指目的微生物经工业化生产增殖后与营养物质和主要动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理的有机物料复合而成的活菌制品。菌剂、菌肥比较大的区别在于产品中营养物质及有机物料的含量，使用中需结合实际需求选择对路产品。避免光照直射。光照直射的情况下，一些菌都会杀死。安徽生物菌肥品质保障
