若宿主细胞残留 DNA 检测扩增效率未达标，建议分阶排查。第一步查数据：调取标曲扩增图，核对是否呈标准 S 型、整体荧光值是否过低、复孔信号是否重叠、通道选择是否恰当、是否存在离群孔及程序参数是否准确。第二步查耗材设备：验证 EP 管是否无菌低吸附，移液器与 PCR 仪是否在校验期内，仪器与耗材规格是否匹配。第三步查人员试剂：对比是否只有个别操作者结果异常，确认试剂储存温度及冻融次数是否合规，并定位异常是否自某时点集中爆发。完成三轮筛查后，细审操作：梯度稀释是否充分涡旋且时长足够，吸液前是否预润吸头，移液速度是否一致，MIX 是否适度颠倒或短时涡旋，上机前是否再次离心混匀，分析时基线区间与阈值设定是否得当，ROX 修正步骤是否执行到位。
MDCK 细胞作为宿主工程用细胞，其宿主细胞DNA残留会给机体带来安全风险。虽然 MDCK 细胞基质流感疫苗生产中，已采用超滤、核酸酶处理、层析、β- 丙内酯灭活等工艺去除残留 DNA，但疫苗产品里仍可能残留宿主细胞DNA 及其片段。所以，为把控疫苗质量，需对疫苗中的 MDCK 宿主细胞残留 DNA 及其片段开展检测与分析。湖州申科生物推出 MDCK 残留 DNA 检测试剂盒与 MDCK DNA 残留片段分析检测试剂盒，帮助相关疫苗企业对 MDCK 流感疫苗的 HCD 实施全过程监控。针对基因治疗产品质量控制，为避免致瘤性等风险，需检测 HEK293 细胞等宿主细胞残留 DNA 及质粒 DNA。
宿主细胞残留 DNA 检测的方法验证主要分为三类。完整验证适用于新开发的分析方法、文献记载的方法以及商业化试剂盒的研发过程；部分验证则应用于已完成完整验证的生物分析方法发生修改的场景，例如方法转移（如实验室间转移）、检测手段变更（如更换仪器）、样品基质改变、同一基质不同种属转换（rat - mouse）、线性浓度范围调整、前处理方式变动等情况；交叉验证适用于当使用不同方法从一项或多项试验中获取数据，或同一方法从不同试验地点得到数据，需要对这些数据进行对比分析的场景。通过不同类型的验证适配多样化的检测需求，确保检测方法的可靠性与有效性。生物制品生产需全程控质，宿主细胞残留 DNA 是过程安全指标，结合产品与方法可稳工艺及质量。云南CHO宿主细胞残留DNA检测常用知识
宿主细胞残留 DNA 检测应结合样品基质特性，选适配提取方法（如磁珠法），去除杂质与抑制物。辽宁E.coli宿主细胞残留DNA检测方案
