广东BD VDJ单细胞实验平台

现有的单细胞测序技术阵营在几个主要领域存在差别。一个是基于微流控通道的细胞与Beads的在通道内的动态结合，通过油相水相不相容的特点将结合了的细胞和Beads进行分隔，在这个空间，单个细胞的内容物释放，转录本或其他生物分析物被标记或添加索引，以便下游识别。BD Rhapsody单细胞测序平台采用静态微孔技术（Cyto-Seq具有类似的技术原理）。通过微孔板的物理分隔，将一个个单个细胞和带有标签的磁珠，一对一的“框”在微反应的物理平台中。这样，每一个细胞都会结合一个磁珠，那么在每一个磁珠中上长满了不同的Cell Barcode和UMI Barcode连接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，这个抓手就会使用oligo dT抓住mRNA构建文库。对于消化背景杂，样本初始数量少，关注粒细胞的项目，推荐您使用烈冰BD 单细胞测序平台。广东BD VDJ单细胞实验平台

针对BD Rhapsody单细胞捕获平台，烈冰生物提供专业的优化试剂和专业知识：BD Rhapsody试剂是转为 Rhapsody 系统设计，旦性能已得到验证的产品，因此研究人员可以专注于解决生物学问题，而不必花费时间应对多组学分析的技术障碍。此外，我们还提基于BD平台的单细胞多组学服务，如Ab-Seq检测试剂盒使用的抗体已在流式细胞分析中得到充分研究，这使得研究人员能够建立真值并迅速加深对生物学系统的理解。作为BD中国单细胞联合实验室的合作伙伴，我们将继续扩展检测试剂盒和试剂产品组合的范围，以支持前沿多组学分析。我们经验丰富的专业客户服务团队可在多组学分析的各个方面为您提供帮助。西安single cell 单细胞平台十二年测序经验，累计服务与5000余项重要科研项目。

据不完全统计，截至2022年6月，烈冰生物助力发表单细胞文章近40篇，从平台应用比例来看，应用10X Genomics和BD Rhapsody两大平台发文比例各占50%左右，研究类型涵盖疾病发展，靶点探索，免疫研究，神经发育，干细胞分化，植物发育，退行病变，糖尿病，COVID-19等等研究；从发表期刊水平来看，烈冰生物联合发表的单细胞文章，CNS一区期刊占比在30%以上，其中包括immunity三篇，Nature子刊3篇（Nature cell biology,Nature Plants，Nature communication）,风湿类领域ARD期刊1篇，CUT 1篇，Advanced Science多篇，IF大于10分以上文章占比高达68.5%，烈冰专属单细胞测序服务团队，将与您携手谱写下一篇“高分”新文章。

针对单细胞测序的细胞数量判断环节：主要是对细胞数量、基因表达量、测序质量进行整体描述。过滤标准：由于细胞破碎后游离RNA会释放到环境或孔中，并且测序中也会存在一些死细胞，导致数据存在background值。因此，我们需要设定一定的标准来过滤掉假细胞或死细胞。以10× Genomics为例，细胞数量判断主要通过分析UMI Counts-Barcode曲线斜率拐点，当存在多个斜率拐点的时候，结合预期UMI=500时的细胞数量进行过滤。当斜率拐点低于UMI=500的时候，选择UMI=500作为细胞的判断的标准；否则，选择和预期细胞数量接近的拐点作为细胞判断的位置。这样我们能够有效获得真实的并且在基因数量上可以分析的数据。BD Rhapsody平台在细胞捕获过程中没有偏好性，可同样无差别捕获中性粒细胞。

根据烈冰多年单细胞测序服务经验，为什么不建议您一味的追求高细胞数量的捕获：单细胞测序所有的分析都是基于细胞聚类进行，而细胞聚类是在区分cell和non-cell后，获得细胞基因表达谱，通过降维（pca），无监督聚类以及可视化（t-SNE）得到的。进行细胞聚类时需要考虑到每个细胞的基因表达模式，因此即使是相同的数据，在剔除几个细胞的情况下，前后获得的聚类图也会出现明显不同。而当细胞捕获数过多时，无论是假阴性和假阳性数据还是多细胞数据，都会对正常细胞聚类产生影响，造成聚类结果失真。这也是很多文章，特别是很多高分文章，为什么单个样本捕获细胞数在2000-3000的原因了。烈冰建议单个样本捕获细胞数在3000-5000个时，数据量在100G左右时，可以满足分析和文章发表的多重需求。烈冰一站式单细胞测序服务：立足科学研究，解码生命本质。北京BD VDJ单细胞测序公司

2019年，烈冰已助力发表了采用BD Rahpsody平台的单细胞风湿类文章。广东BD VDJ单细胞实验平台

针对单细胞测序数据分析时的reads数、基因表达量及细胞数量判定过程中：以捕获5000个细胞、100G的测序量为标准，每个细胞的reads数大约在50k左右；每个细胞的基因中位数取决于样本的细胞类型，例如成熟的B，T，粒细胞数量较多的组织中，由于该类型细胞表达的基因数普遍较少，导致基因中位数下降。而某些疾病组织、或者体外培养的如干细胞等，他们的基因表达数较高，甚至可以超过1W，这就导致该类样本基因中位数非常高。因此，我们对细胞数量以及基因中位数确认时，需要考察实际组织的细胞组成。广东BD VDJ单细胞实验平台

上海烈冰生物医药科技有限公司主要经营范围是医药健康，拥有一支专业技术团队和良好的市场口碑。公司业务涵盖单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序等，价格合理，品质有保证。公司将不断增强企业重点竞争力，努力学习行业知识，遵守行业规范，植根于医药健康行业的发展。烈冰生物秉承“客户为尊、服务为荣、创意为先、技术为实”的经营理念，全力打造公司的重点竞争力。