重庆BD VDJ单细胞测序

根据烈冰多年单细胞测序服务经验，为什么不建议您一味的追求高细胞数量的捕获：单细胞测序所有的分析都是基于细胞聚类进行，而细胞聚类是在区分cell和non-cell后，获得细胞基因表达谱，通过降维（pca），无监督聚类以及可视化（t-SNE）得到的。进行细胞聚类时需要考虑到每个细胞的基因表达模式，因此即使是相同的数据，在剔除几个细胞的情况下，前后获得的聚类图也会出现明显不同。而当细胞捕获数过多时，无论是假阴性和假阳性数据还是多细胞数据，都会对正常细胞聚类产生影响，造成聚类结果失真。这也是很多文章，特别是很多高分文章，为什么单个样本捕获细胞数在2000-3000的原因了。烈冰建议单个样本捕获细胞数在3000-5000个时，数据量在100G左右时，可以满足分析和文章发表的多重需求。烈冰实验室包含从样本处理到测序下机的全套实验平台。重庆BD VDJ单细胞测序

单细胞获得困难，不同组织要求不尽相同难以搞定？ 烈冰2000+项目消化经验，100+组织类型解离protocol，精心设计不同组织实验的解离、细胞悬浮实验体系，确保单细胞的获得。 冻存样本无法实验，珍贵样本无法使用？ 烈冰采用国际认可的冻存组织复苏技术以及死细胞过滤技术，确保冻存组织使用。 珍贵样本，细胞数量太少，消化背景杂无法做单细胞？ 采用国际认可的10X Genomics，BD Rhapsody双平台模式，根据样本实际情况和用户需求提供客观有效的实验方案,细胞量少，背景杂也能做单细胞。 单细胞RNA分类精度不足，部分细胞无法细分？ 烈冰同时采用单细胞蛋白质组与单细胞转录组测序技术，真正做到从上游到下游的全流程检测，确保超高的细胞分类精度。BD Rhapsody单细胞平台烈冰生物为您提供一站式全流程高通量BD 单细胞测序服务。

多样本数据合并：Fraction of Reads Kept：合并样本时，各样本根据Mapped Barcoded Reads per Cell数量计算出来的数据利用率。如果各样本间该参数值相差很大，需要进行Downsample处理，以数据量少的样本为基准将不同样本中细胞测序深度标化到同一水平，从而避免因测序深度差异导致的基因检测数量、基因表达水平的差异。烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据，深度解读数据分析结果，深入挖掘其背后的生物学意义；从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究，加速科研进程！

烈冰科技作为国内率先同时拥有10X Genomics和BD Rhapsody双分选平台的测序服务商及云计算服务供应商，经过多年实战，拥有丰富的单细胞悬液制备和分选经验，实测BD Rhapsody对能够高效捕获粒细胞。针对不同的分选平台、建库方法，实战总结搭建出不同的数据预处理工作流程；烈冰科技NovelBrain®生物大数据平台能有效支撑生命科学研究、医疗健康等领域对大数据分析的需求。高通量测序实验平台，包括NovaSeq 6000、10X Chromium X、BD FACSMelody、PANNORAMIC数字切片扫描仪等，配合一支来自海内外名校、多学科交叉型的高素质综合团队，为您的科学研究保驾护航。BD Rhapsody平台在细胞捕获过程中没有偏好性，可同样无差别捕获中性粒细胞。

基于测序的数据能够将彰显其强大之处，因为它能够了解同一单细胞的多种生物分析指标。如果说单细胞基因表达提供了一种颜色的详细信息，那么单细胞多组学提供了同一细节的全彩色图谱，为您带来样本的真实视图。烈冰自2019年引进的BD Rhapsody单细胞平台以来，能够从同一单细胞中读取细胞复杂性的多组学特征。与传统方法不同，单细胞多组学简化了您需要开展的实验，也节省了您需要分析的样本，而能获得相同的结果。这不但节省了宝贵的样本，还保证了更高的生物学准确性，因为您不需要匹配拆分样本的数据集并通过计算来推断各个组学之间的关系。截至2022年6月，烈冰助力发表单细胞测序文章30+篇。重庆BD单细胞实验平台

单细胞多组学测序可识别重要的转录因子，进行谱系和发育追踪。重庆BD VDJ单细胞测序

烈冰生物BD Rhapsody平台，采用精简的工作流程助力您的实验成功： 1.制备单细胞悬液：可使用碧迪医疗单细胞多样本分析试剂盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶联抗体( Ab-Oligos)将细胞染色 2.微孔板预充和处理:使用自动移液器进行液体交换 3.单细胞捕获工作流程: (1)细胞上样:上样 575微升细胞悬液；系统未采用微流体通道设计，无需担心通道堵寨；通过重力轻轻沉淀细胞，可捕获脆弱细胞，BD Rhapsody微孔板包含大于220,000个分区，可在低双细胞率下捕获多达40000个细胞 (2)细胞上样扫描：估算捕获的活细胞数量和细胞多态率 (3)磁珠上样：微孔的正六边形几何形状和尺寸可防止磁珠多重分配在微孔中 (4)磁珠上样和磁珠洗涤扫描：估算包含活细胞和磁珠的微孔数量；测定细胞存留率，评估是否发生细胞损失 (5)细胞裂解：使用裂解缓冲液，确保细胞完全裂解 (6)磁珠回收：轻松、高效地磁性回收磁珠并采用Scanner扫描磁珠回收情况重庆BD VDJ单细胞测序

上海烈冰生物医药科技有限公司专注技术创新和产品研发，发展规模团队不断壮大。公司目前拥有较多的高技术人才，以不断增强企业重点竞争力，加快企业技术创新，实现稳健生产经营。上海烈冰生物医药科技有限公司主营业务涵盖单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序，坚持“质量保证、良好服务、顾客满意”的质量方针，赢得广大客户的支持和信赖。公司深耕单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序，正积蓄着更大的能量，向更广阔的空间、更宽泛的领域拓展。