单细胞测序结果动辄上百G数据量,庞大的数据对于分析平台和分析能力有着很高的要求,首先针对下机数据的质控环节:单细胞测序产生数亿的结果序列,不可避免的会出现低质量的测序结果,存在各种情况的序列污染。因此序列过滤及质量评估就会变得极为重要。序列质量主要通过测序质量值Q20/Q30的占比来表征,即碱基测序结果的错误率在1% / 0.1%以下的比例。理想的测序结果reads的碱基质量均高于30。保证数据获得后的处理结果的准确性,为后续细胞类型鉴定和功能分析打下坚实基础。烈冰对于一个细胞群体中的每个细胞单独进行建库测序分析。天津BD单细胞测序公司
您的珍贵样本,还可以放心依赖烈冰生物BD Rhapsody单细胞捕获系统,BD RhapsodyTM单细胞捕获系统采用微孔技术,对细胞的捕获没有偏好性,实现高达80%的微孔板捕获率,由于单个微孔板中容纳了22万+个微孔,而现阶段单细胞测序实验技术通常要求单个样本捕获3000-5000,至高达10000个细胞,即可满足科研探索需求,因此这种“泊松分布”的原理类似于上样细胞的无限稀释过程,但22万+微孔的存在,也对大体量细胞数目的科学研究有很好的包容性,细胞通量分为可扩展至100-40000个细胞的捕获(单个微孔板),满足您的多重需求。陕西BD VDJ单细胞平台ATCG碱基的排列组合构成了测序的庞大世界。
烈冰与国内高校、研究所、医院和药企单位开展深度合作,服务于600+临床与研究机构,1000+客户和5000+重要科研项目,助力并联合发表300+篇CNS等国际学术期刊(不完全统计),在单细胞领域,烈冰助力用户发表单细胞文献30+篇,总IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、Nature Cell Biology、Nature Plants 、Advanced Science等生物领域国际主流学术期刊,已发表文章研究领域涵盖包括COVID-19研究、疾病发生转移机制,免疫研究、脑神经、白血病、胚胎发育、糖尿病、退行性疾病和植物领域研究等。
相对于Smart-Seq技术在细胞数量上的问题,BD平台普遍提供的细胞数量都在1000-10000不等的测序细胞量,特殊研究需求的项目,可提供上限40000个细胞的捕获量(单个样本)。这个量级的测序细胞量已经可以说能够完全覆盖绝大部分组织的Single Cell群体类型。因此,对于基于基因表达进行准确细胞分型上,无论是从细胞数量上来说还是表达检测可靠性来说,都会更实用。此外针对特殊项目研究,如需要捕获和分析脆弱的细胞,如粒细胞、中性粒细胞、CAR-T细胞、干细胞、移植瘤细胞、骨髓瘤细胞等,烈冰生BD平台也有更好的捕获效能,满足您的实际需求。丰富的测序和数据分析经验,烈冰配套全程个性化、定制化地数据分析服务。
基于测序的数据能够将彰显其强大之处,因为它能够了解同一单细胞的多种生物分析指标。如果说单细胞基因表达提供了一种颜色的详细信息,那么单细胞多组学提供了同一细节的全彩色图谱,为您带来样本的真实视图。烈冰自2019年引进的BD Rhapsody单细胞平台以来,能够从同一单细胞中读取细胞复杂性的多组学特征。与传统方法不同,单细胞多组学简化了您需要开展的实验,也节省了您需要分析的样本,而能获得相同的结果。这不但节省了宝贵的样本,还保证了更高的生物学准确性,因为您不需要匹配拆分样本的数据集并通过计算来推断各个组学之间的关系。烈冰生物作为BD 中国联合成立单细胞测序实验室,为推动单细胞测序技术发展贡献中国力量。青岛single cell RNA单细胞测序
截至2022年6月,烈冰助力发表单细胞测序文章30+篇。天津BD单细胞测序公司
烈冰生物BD Rhapsody平台,采用精简的工作流程助力您的实验成功: 1.制备单细胞悬液:可使用碧迪医疗单细胞多样本分析试剂盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶联抗体( Ab-Oligos)将细胞染色 2.微孔板预充和处理:使用自动移液器进行液体交换 3.单细胞捕获工作流程: (1)细胞上样:上样 575微升细胞悬液;系统未采用微流体通道设计,无需担心通道堵寨;通过重力轻轻沉淀细胞,可捕获脆弱细胞,BD Rhapsody微孔板包含大于220,000个分区,可在低双细胞率下捕获多达40000个细胞 (2)细胞上样扫描:估算捕获的活细胞数量和细胞多态率 (3)磁珠上样:微孔的正六边形几何形状和尺寸可防止磁珠多重分配在微孔中 (4)磁珠上样和磁珠洗涤扫描:估算包含活细胞和磁珠的微孔数量;测定细胞存留率,评估是否发生细胞损失 (5)细胞裂解:使用裂解缓冲液,确保细胞完全裂解 (6)磁珠回收:轻松、高效地磁性回收磁珠并采用Scanner扫描磁珠回收情况天津BD单细胞测序公司
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