单细胞测序结果动辄上百G数据量,庞大的数据对于分析平台和分析能力有着很高的要求,首先针对下机数据的质控环节:单细胞测序产生数亿的结果序列,不可避免的会出现低质量的测序结果,存在各种情况的序列污染。因此序列过滤及质量评估就会变得极为重要。序列质量主要通过测序质量值Q20/Q30的占比来表征,即碱基测序结果的错误率在1% / 0.1%以下的比例。理想的测序结果reads的碱基质量均高于30。保证数据获得后的处理结果的准确性,为后续细胞类型鉴定和功能分析打下坚实基础。从样本处理到终端数据分析,只要您需要,烈冰提供全流程的无忧服务。四川BD VDJ单细胞多组学测序
单细胞测序技术(Single Cell Sequencing)从一种新兴的研究角度,借助已有的高通量测序手段,帮助研究者在样本中细胞的异质性、免疫微环境、发育学、免疫学以及其他领域中进行单细胞层面的数据解析,解决了Bulk Population Sequencing所无法解决的问题。这样一个新的研究领域必然也需要足够可靠的实验手段来支撑。BD Rhapsody单细胞分选系统为此提供了完善的硬件设备,保证了从单细胞悬液质量评估到单细胞分选标记过程中每一个实验步骤的准确质控。NovelBio单细胞实验团队借助BD Rhapsody单细胞分选系统,在实验实施层面对单细胞测序结果的可靠性提供了强有力的保证。继单细胞悬液制备之后,又在另一道关键关卡提供了可靠的支持,帮助研究者在单细胞测序领域收获更多的成果。成都单细胞服务机构对于消化背景杂,样本初始数量少,关注粒细胞的项目,推荐您使用烈冰BD 单细胞测序平台。
从单细胞测序描述性分析转向复杂样本中不同细胞类型的功能解析,越来越需要一种多组学的细胞生物学视角。通过单细胞多组学——即对不同组学的数据集进行分析和整合——科学家能够从同一个单细胞来源中检测多种细胞特征。这些特征包括全转录组基因表达、细胞表面蛋白表达、免疫组库序列(包括T细胞和B细胞受体)以及用于了解表观基因组调控的开放染色质区域。随着单个实验可提供更多信息丰富的数据,研究人员的获益更多,包括保留珍贵样本、提高生产力、减少因批次效应引起的错误,并节省更多的高科技资源(从资助基金到人员时间)。
所谓的高通量测序技术,又名大规模平行测序,是将 DNA(或者 cDNA)随机片段化、加接头,制备测序文库,通过对文库中数以万计的克隆(colony)进行延伸反应,检测对应的信号,获取序列信息。与传统测序法(Sanger法等)相比,高通量测序技术在处理大规模样品时具有明显的优势,又快(两天)又多(数百万克隆),成为目前组学研究的主要技术。单细胞测序是一个系统的工程,开展项目前您可能会先评估它提供的见解是否与您的研究问题相匹配,如果匹配,实验过程如何规划,实验平台如何选择,样本如何制备,数据如何分析等等,而在这一切开始之前,我们的服务就已经开始了,从销售到实验到专业技术支持,我们开通全线对接渠道,帮助您快速定位项目诉求,提供从实验设计到文章发表的全流程,我们始终是您贴心的科学合作伙伴。个性化制定测序项目方面,满足从检测基因到蛋白的多组学测序要求。
对于稀有样本,或细胞量比较少的稀有组织,样本中每一粒细胞都很珍贵,BD Rhapsody单细胞捕获平台对该种类型的样本能实现友好包容,如果在实际实验中,我们发现因为样本类型和制备单细胞悬液方法的不同,容易出现单细胞悬液中死亡细胞的比例较高的情况。也会和您探讨是否考虑去除单细胞悬液中的死细胞和其他污染物的操作,以获得高质量数据是至关重要的。这是因为,死亡的细胞易裂解导致其中的RNA释放出来。这种cell-free RNA会导致检测的背景噪声,并会影响单细胞数据的质量。因此当样本活性较差时,对细胞悬液中细胞活性检测后,需要进行一般死细胞去除的工作(一般悬液活性小于70%时考虑此操作),以保证较高的上机捕获细胞的质量。单细胞测序平台,烈冰提供高性价比服务方案。青岛BD单细胞测序服务公司
BD 单细胞捕获平台搭配BD Scanner,全流程实时质控,项目质量尽在掌握。四川BD VDJ单细胞多组学测序
单细胞测序庞大的数据烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台,可实现零代码操作、简单方便:单细胞浏览器的操作简单,不需要命令行操作。简单拖拽、设置参数即可运行,即使生信0基础用户也可以运用自如;可视化展示海量结果文件:可视化展示Cluster的基因数,UMI数量、线粒体RNA占比信息;以及不同Cluster对应的细胞数量、基因表达量、RNA表达量、样本细胞分布、线粒体RNA表达量等;3D立体展示,文章动图先人一步:单细胞浏览器针对t-SNE图、UMAP图和pseudotime结果进行三维立体展示,更加直观立体的观察细胞分布和聚类情况。四川BD VDJ单细胞多组学测序
上海烈冰生物医药科技有限公司是一家生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询,市场营销策划,市场信息咨询与调查(不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验),从事货物及技术的进出口业务,计算机、软件及耗材(除专控),软件开发【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】的公司,致力于发展为创新务实、诚实可信的企业。烈冰生物深耕行业多年,始终以客户的需求为向导,为客户提供***的单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序。烈冰生物致力于把技术上的创新展现成对用户产品上的贴心,为用户带来良好体验。烈冰生物始终关注医药健康市场,以敏锐的市场洞察力,实现与客户的成长共赢。