天津10X单细胞测序平台

单细胞RNA-seq、RNA-seq和逆转录qPCR（RT-qPCR）都采用一个共同过程，即分离RNA并将其转化为cDNA进行分析。不过，每种分析在开展方式和获得的数据上有所不同。RNA-seq和RT-qPCR都是先从大量细胞中分离RNA，然后将其转化为cDNA。RNA-seq是使用cDNA来构建新一代测序文库，从而测定整个转录组的基因表达。RT-qPCR则是从cDNA中扩增特定靶点，并通过荧光测定表达水平。RT-qPCR限于已知靶点，而RNA-seq可实现无偏倚的全转录组基因表达分析。然而，这两者只能提供细胞群体内基因表达的平均情况。单细胞RNA-seq则在分离RNA之前将单细胞分离到微孔或单个微反应容器中。然后用细胞特异性的条形码标记RNA，确保来自每个细胞的cDNA可以追溯到起源细胞。与RNA-seq相似，带有条形码的cDNA也被用于构建新一代测序文库，从而能够对每个细胞的整个转录组进行基因表达测定。烈冰全线实验平台满足超深度、大规模发现和复杂疾病研究的测序。天津10X单细胞测序平台

细胞中基因的表达是严格按照时间和空间顺序发生，因此细胞类型和基因表达具有时间特异性和空间特异性。时间特异性可以通过收集不同时间点的样本进行单细胞转录组测序来分析。但是单细胞转录组测序（scRNA-Seq）在单细胞悬液制备的过程中破坏了细胞的空间结构，无法给出固态异质化组织中细胞空间排布信息。而空间转录组可以解决这个问题，其以点阵形式记录组织切片细胞的空间信息，在保留组织形态结构的基础上，获得细胞/基因的空间表达特异性。上海二代测序单细胞测序平台烈冰测序服务已助力300余篇国际期刊研究文章发表。

相对于Smart-Seq技术在细胞数量上的问题，10X平台普遍提供的细胞数量都在1000-20000不等的测序细胞量，这个量级的测序细胞量已经可以说能够完全覆盖绝大部分组织的Single Cell群体类型。因此，这两种技术对于基于基因表达进行准确细胞分型上，无论是从细胞数量上来说还是表达检测可靠性来说，都会更实用。同时依托Random Cell Label技术，使得其对于NovaSeq、HiSeq X Ten、Hiseq 4000等设备存在的Index hooping现象，相对于Smart-Seq数据来说，影响几乎可以忽略不计（10X Genomics官方网站曾给出hooping测试结果，显示无影响。

烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据，深度解读数据分析结果，深入挖掘其背后的生物学意义；从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究，加速科研进程！此外，烈冰生信团队根据丰富的实战经验为用户量身打造了一款单细胞测序结果解读的神兵利器——单细胞浏览器（Single Cell Browser），不但可以将海量复杂的结果文件可视化，还是可以实现三维立体化展示的软件。专业的生信代码交给专业的烈冰，专业的生物学意义交给专业的您，详情请咨询烈冰生物。截至2021年10月，烈冰助力发表单细胞测序文章近20篇。

关于10X Genomics单细胞平台的样本类型和样本制备 ：10X平台在上机前需要注意细胞消化后的细胞团块，获得分离良好的细胞悬液、无细胞随便、极少的细胞团块，且细胞活力高（＞70%）；此外，了解您所研究细胞的大小范围也很重要。细胞大小通常与细胞表达的转录本数量有关。各种尺寸不同的细胞（一般直径不大于50μm）均可与我们基因表达解决方案中使用的10X Genomics平台兼容。一般来说，细胞制备方案将根据组织来源和细胞类型而变化。每种组织类型都是独特的，因此，必须在开始任何单细胞实验之前优化样本制备，烈冰多年样本解离消化经验，累积10+物种、50+组织的消化protocol，若您的样本为组织，且尚未成功将组织样本消化成单细胞悬液，烈冰将尽可能提供技术及实验上的帮助。单细胞测序技术的迅速发展和应用推广，为从多维度揭示疾病发展提供了强有力的工具。济南单细胞测序多组学测序

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基于10X Next GEM技术，单细胞测序一次实验可以同时检测近万个细胞，可在一个样本中同时获3'端mRNA表达谱、如需和免疫组库（TCR和BCR）的数据进行联合时，即某些研究还需结合基因的表达谱和V(D)J数据进行复杂组织样本的是影响免疫应答分析，监测免疫疗法的效果，研究疾病发生、发展的分子机制，可进行单细胞免疫组库测序： 烈冰单细胞免疫组库平台具备：1000+项目经验，一次实验可同时获取1000-20000个细胞的文库构建，获得转录组和免疫组数据； 具备完善的免疫组库测序和实验质控流程，获取V(D)J全长序列的配对信息；丰富的免疫组库测序和数据分析经验，实现专属个性化数据分析服务，搭配单细胞分析云平台，一键导出交互性的动态结果报告。天津10X单细胞测序平台

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