广州BD Rhapsody单细胞测序服务

机体为响应各种应激，其细胞会从一种功能“状态”转变为另一种功能“状态”；当细胞在不同状态之间转变时，往往会经历转录重组，导致一些基因被沉默，一些基因被重新“唤醒”，但纯化这些瞬态细胞进行研究是很困难或不可能的；scRNA-seq拟时序分析可以让我们在不需要纯化的情况下查看这些细胞状态。拟时序分析，即根据不同细胞亚群基因表达量随时间的变化情况，构建细胞谱系发育，但这里的时间并不是真时间，而是一个虚拟的时间，是指的细胞与细胞之间的转化和演替的顺序和轨迹。即使在同一个样本中，也会存在多种不同的细胞形态。因此，不论测定了多少样本，我们都可以采用拟时序分析对样本中的细胞转化和变化进行描述。烈冰科技已建立了多种国际和国内主流的高通量测序实验平台和自主研发国产化实验平台。广州BD Rhapsody单细胞测序服务

针对单细胞测序的细胞数量判断环节：主要是对细胞数量、基因表达量、测序质量进行整体描述。过滤标准：由于细胞破碎后游离RNA会释放到环境或孔中，并且测序中也会存在一些死细胞，导致数据存在background值。因此，我们需要设定一定的标准来过滤掉假细胞或死细胞。以10× Genomics为例，细胞数量判断主要通过分析UMI Counts-Barcode曲线斜率拐点，当存在多个斜率拐点的时候，结合预期UMI=500时的细胞数量进行过滤。当斜率拐点低于UMI=500的时候，选择UMI=500作为细胞的判断的标准；否则，选择和预期细胞数量接近的拐点作为细胞判断的位置。这样我们能够有效获得真实的并且在基因数量上可以分析的数据。重庆BD单细胞实验服务丰富的测序和数据分析经验，烈冰配套全程个性化、定制化地数据分析服务。

针对单细胞测序的细胞上样数，为什么不建议捕获到的细胞数量越高越好？一味地追求高数量的细胞捕获可能会存在一些问题。例如在上机细胞悬液浓度固定时，如果目标细胞捕获数增加到8000甚至10000，上样细胞悬液体积势必增加，在细胞悬液质量不是很理想（细胞活性<90%、碎片率>5%、结团率均>5%）的情况下，引入的背景信号会增加，分析结果不理想的直接体现包括：cell、non-cell无法有效区分和Fraction reads in cells偏低。当cell和non-cell无法有效区分时，会使得数据出现假阳性和假阴性结果！当目标细胞捕获数很大时，多细胞率会增加，数据分析时，此部分“cell”表现为基因检测数和UMI检测数是正常cell的N倍（N是一个GEM包裹的细胞数），导致所有细胞的统计数据（单个细胞基因检测中位数、单个细胞UMI检测中位数）虚高。此部分“cell”虽然可以通过设置数据分析阈值进行过滤，但是容易会有此类数据的残留和正常高基因检测细胞的人为去除！

针对单细胞测序数据分析时的reads数、基因表达量及细胞数量判定过程中：以捕获5000个细胞、100G的测序量为标准，每个细胞的reads数大约在50k左右；每个细胞的基因中位数取决于样本的细胞类型，例如成熟的B，T，粒细胞数量较多的组织中，由于该类型细胞表达的基因数普遍较少，导致基因中位数下降。而某些疾病组织、或者体外培养的如干细胞等，他们的基因表达数较高，甚至可以超过1W，这就导致该类样本基因中位数非常高。因此，我们对细胞数量以及基因中位数确认时，需要考察实际组织的细胞组成。附加流式分选细胞表面Marker，对于较低分辨率的标志物也能有效鉴定，助力高要求测序项目。

您的珍贵样本，还可以放心依赖烈冰生物BD Rhapsody单细胞捕获系统，BD RhapsodyTM单细胞捕获系统采用微孔技术，对细胞的捕获没有偏好性，实现高达80%的微孔板捕获率，由于单个微孔板中容纳了22万+个微孔，而现阶段单细胞测序实验技术通常要求单个样本捕获3000-5000，至高达10000个细胞，即可满足科研探索需求，因此这种“泊松分布”的原理类似于上样细胞的无限稀释过程，但22万+微孔的存在，也对大体量细胞数目的科学研究有很好的包容性，细胞通量分为可扩展至100-40000个细胞的捕获（单个微孔板），满足您的多重需求。烈冰专注单细胞多组学测序领域。济南scRNA单细胞测序

个性化制定测序项目方面，满足从检测基因到蛋白的多组学测序要求。广州BD Rhapsody单细胞测序服务

为什么需要单细胞分辨率？ 生物学就像宇宙一样。它非常复杂，有许多独特的单体，也就是细胞。这些细胞相互作用并扮演不同的角色，在更大的体系中构建并驱动多个过程。就像伽利略探索宇宙的努力一样，发现和定义这些细胞也需要高分辨率的工具，才能解开促成生物学复杂性的基因表达异质性。单细胞测序能够在以一个细胞为功能单位中开展生物学研究，阐明具体细节，构建出一幅更大、更精细的图谱，说明导致产生某种外在表型的不同类型的分子和细胞之间是如何相互作用的：患者为什么会复发？是什么让这种疫苗能够有效防止传染等等诸多问题。广州BD Rhapsody单细胞测序服务

上海烈冰生物医药科技有限公司专注技术创新和产品研发，发展规模团队不断壮大。一批专业的技术团队，是实现企业战略目标的基础，是企业持续发展的动力。上海烈冰生物医药科技有限公司主营业务涵盖单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序，坚持“质量保证、良好服务、顾客满意”的质量方针，赢得广大客户的支持和信赖。一直以来公司坚持以客户为中心、单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序市场为导向，重信誉，保质量，想客户之所想，急用户之所急，全力以赴满足客户的一切需要。