数字PCR基本参数
  • 品牌
  • 臻准、锐讯生物
  • 型号
  • DropDx-2044数字PCR系统、 AccuONE系列
  • 类型
  • pcr仪
数字PCR企业商机

ThermoFisherQuantStudio3D是另一个经典的芯片式数字PCR平台,其基本的检测流程是:将反应液加入到涂布器中,通过涂布器将反应液均匀涂布在有20000个微孔的芯片上,将芯片放在PCR仪上扩增,将芯片放入读取仪中采取拍照的方式读取荧光信号。操作较为复杂,整个过程在封闭的芯片中进行,污染的风险较低。STILLANaica是一个较新的数字PCR平台,基本的检测流程是:将反应液加入芯片,将芯片放入微滴生成扩增系统,生成30,000个微滴单层平铺于芯片中,PCR扩增在芯片上完成。然后将扩增后的芯片转移至微滴阅读分析系统,采取拍照的方式读取荧光信号。由于整个过程在封闭的芯片中进行,污染的风险较低。国产dPCR企业在上述应用领域不断与伯乐、赛默飞、罗氏、凯杰、因美納等头部企业展开竞争,抢占市场份额。美国双螺旋生物仪器数字PCR品牌

了解泊松分布,我们先要从二项式分布说起,二项式分布是一个离散概率分布,它给出了m次试验中k次成功的可能性,每次试验的概率为p,例如当掷骰子时,二项分布给出了在10次试验中恰好有7次掷出4的概率。在数字PCR的情况中,投掷骰子类似于将一个目标实体随机“投掷”到一组分区中,当目标落在选定的分区中时,就是成功。如果有n个分区,并且分区过程是完全随机的,则目标出现在所选分区中的概率为1/n。该试验重复m次,样品中的每个分子一次。如下所示的二项式分布给出了k个成功的概率,即所选分区恰好包含k个分子的概率。数字PCR通常采用大量分区。当n很大,并且尝试成功的概率(1/n)很小时,二项分布可以近似为泊松分布。法国一体化数字PCR技术我国数字PCR市场的整体规模、公司影响力、行业话语权等也将迎来进一步提升,从而助推行业高质量创新发展。

由于现有的商业化数字PCR设备在物理上只设置了2个检测通道,所以存在一个明显的短板:不能同时进行多个位点的检测。在样品多位点的检测中,就需要更多的起始样品,但临床上组织的样品非常有限。相比之下荧光定量PCR仪上就很容易实现多重检测。为了考察利用数字PCR实现多重检测的可能性,英国TheInstituteofCancerResearch的研究人员以非小细胞肺相关的KRAS基因为检测对象,在Bio-Rad的数字PCR系统上通过3个三重ddPCR检测体系来实现9个KRAS突变位点的检测。

dPCR在使用过程中需要特别注意体积误差造成的结果偏差。体积误差对于测量拷贝数浓度会产生偏差。目前dPCR中体积优化方法以光学显微镜观测为主。分散体积的差异会增加拷贝数结果的不确定性,Emslie等使用光学显微镜纵向拍照比较图片边缘的微小差异,考察了数字PCR系统中每个微孔内和孔与孔间的体积差异对实验结果的影响程度。Corbisier等使用微滴数字PCR对6种不同质量分数棉籽粉质粒DNA标准物质[ERM-AD623a-f,浓度范围(10~10)copies/ul]进行分析,优化了液滴体积得到相应校正因子,并使用该校正因子发现并校准了运行软件中液滴体积不变的假设而引起的数据偏离,数据结果的一致性有明显提高。全自动数字PCR平台,让数字PCR真正迈入新时代,助推数字PCR普及应用。

数字PCR的引物和探针设计规则同荧光定量PCR是类似的,具体规则如下:1、查找和选择目标序列设计引物和探针的第一步是得到感兴趣基因的核酸序列。找到基因保守区域:基因的保守区域是指来自同一属/种/亚型的、在某个基因上碱基序列差别很小或没有差别的区域。根据需要,使用ClustalX或ClustalW等软件对齐属于同一属/种/亚型的基因的一组序列,在对齐序列的保守区域设计引物,并确保引物结合位点处的保守序列与其它非待检测的属/种/亚型的碱基序列具有较大的差异。扩增产物长度(AmpliconLength):可在75-200bp之间(产物长度=下游引物位置-上游引物位置+1)。数字PCR主要采用当前分析化学热门研究领域的微流控或微滴化方法。苏州臻准数字PCR分析应用

数字PCR在检测珍贵样品和样品核酸存在降解时具有明显的优势。美国双螺旋生物仪器数字PCR品牌

目前dPCR主要有两种形式,芯片式和液滴式,但基本原理都是将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或微滴中,每个反应器的核酸模板数少于或者等于1个。这样经过PCR循环之后,有一个核酸分子模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器就没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,就可以推算出原始溶液的核酸浓度。可以使用几种不同的方法来分配样品,包括微孔板,毛细管,油乳剂和带有核酸结合表面的小型化腔室阵列。样品的分配使人们可以通过假设分子种群遵循泊松分布来估计不同分子的数量,根据泊松分布的原理,反应体系中目标分子的拷贝数可以通过公式A=-ln[(N-X)/N]*N计算,从而解决了多个目标分子存在于单个液滴中的可能性。美国双螺旋生物仪器数字PCR品牌

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