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naica®六通道微滴芯片数字PCR系统,源于crystal微滴芯片数字PCR技术,自动化微滴生成和扩增,每个样本孔可实现6荧光通道的检测,智能化识别微滴并进行质控,3小时内即可获得至少6个靶标基因的一定程度上拷贝数浓度,融合传统微滴式和芯片式优势,被称为下一代数字PCR技术。只需一步移液操作,将PCR反应液加载于创新型微流控芯片,naica®六通道微滴芯片数字PCR系统即可自动生成单层平铺的2D微滴阵列,随后对每个微滴进行温度均匀一致的PCR扩增后,进行六通道荧光信号采集,计数阴阳性微滴,通过泊松分布计算获得靶标基因一定程度上拷贝数浓度。数字PCR的两大应用场景在于基因检测、无创出生缺陷筛查。上海双螺旋生物仪器数字PCR油滴制造
基于微滴的QX100dPCR仪,利用油包水技术,将样品平均分配到20000个微滴油包水中,利用微滴分析仪对微滴进行分析。2012年RainDance公司推出了RainDropdPCR仪,在高压气体驱动下,将每个标准反应体系分割成包含100万至1000万个皮升级别微滴的反应乳液。数字PCR就形成了2大派别,芯片式和微滴式。不论是哪种数字PCR,其原理都是有限稀释,终点PCR和泊松分布。将含有核酸模板的标准PCR反应体系,平均分配成几万个PCR反应,分配到芯片或微滴中,使每个反应中尽可能含有一个模板分子,进行单分子模板PCR反应,通过读取荧光信号的有或无进行计数,经过统计学泊松分布的校准进行定量。深圳锐讯数字PCR系统数字PCR是通过将一个样本分成几十到几万份,分配到不同的反应单元,每个单元至少包含一个拷贝的目标分子 。
对于检测需要高灵敏度以及技术确认的情况下,数字PCR技术也可以发挥重要作用。技术数据表明,数字PCR技术对的比较低检测下限可到2copies/ml,比qPCR灵敏度提升了100倍。经测试,数字PCR在检测和诊断的某些方面优于金标准qPCR,尤其是在低病毒载量样本中,相比起qPCR,数字PCR特异性、灵敏度、重现性和检测限受影响更小。因此,未来预计数字PCR技术也将在类疾病中得到更加广的应用。数字PCR的应用甚广,除了可应用于进行突变的检测以外,也可运用于基因扩增的检测。通过数字PCR技术可建立多重荧光体系,用于同时检测比如非小细胞肺中常见的MET和HER2耐药扩增。有研究报道,使用数字PCR技术对436例非小细胞肺样品进行检测,并挑选样本验证了数字PCR与RNA fish的检测一致性。结果表明,该数字PCR技术在保证了基因扩增检测准确性的同时,还节约了检测时间。
相比于qPCR,dPCR在转基因检测中具有以下优势:(1)检测灵敏度高:理论上dPCR的灵敏度可达1个拷贝,而实际应用中dPCR的小检出限和比较低定量限数值非常接近,所以dPCR可以在非常低的目标拷贝数下得到精确的结果;通常转基因比参考基因(内源基因)浓度低很多;(2)前处理简单且受基质成分干扰较小:dPCR反应效率和精密度受到食品基质成分干扰影响较小,可应用于混合基质样品中低丰度DNA的检测;(3)dPCR对抑制剂的敏感性较低:由于dPCR结果表示为“有荧光“或“无荧光”,即使存在抑制剂降低了荧光强度仍可以表示为“有荧光;(4)适合多重转基因检测:食品或饲料提取的DNA中可能包含多种转基因片段,可以进行多重dPCR检测,提高分析效率。同时,dPCR可以直接溯源至SI国际单位制摩尔,适合单一、双重及多重转基因标准物质研究,一次可识别不同的转基因区域。下面详细进行说明。数字PCR通常采用大量分区。
微滴数字PCR主要是将两种互不相溶的液体,以其中一种作为连续相(油),另一种作为分散相(水),在水/油两相表面张力和剪切共同作用下分散相以微小体积单元的形式存在于连续中,从而成液滴。这种液滴式的反应腔室具有体积小、样品间无扩散等优势。在ddPCR中,利用微滴发生器可以一次生成数万乃至百万个纳升甚至皮升级别的单个油包水微滴,作为数字PCR的样品分散载体。这里,液滴中包裹了单拷贝DNA模板和PCR反应液,然后将液滴收集在PCR反应管中进行扩增。PCR反应结束后检测每个微滴的荧光信号。目前Bio-Rad公司的QX100系统、QX200系统均为采用液滴技术的数字PCR系统。图6.Bio-Rad的液滴数字PCR系统三重ddPCR检测体系存在的问题:不同位点检测体系之间的cross-reactivity。广州医疗系统认证数字PCR性能特点
通过“仪器+试剂”相互配合的方式,打出了数字PCR检测的“组合拳”。上海双螺旋生物仪器数字PCR油滴制造
PCR常使用目标序列的拷贝数或某一给定样品中转基因的百分比来体现方法灵敏度。由于qPCR和dPCR实验过程所用试剂的兼容性较好,在使用dPCR进行转基因检测时,通常直接参照qPCR的方法。使用不同技术对相同样品检测时,两种方法的灵敏度是否具有可比性成为关注的问题。Burns等21]使用Fluidigm公司的12.765(12板,每板765个微单元)芯片数字PCR分析仪测定标准物质ERM-AD413检测转基因玉米MON810。该小组应用dPCR技术评估在qPCR定义下的灵敏度数值,在拷贝数200-700之间,dPCR与qPCR的测量结果具有一致性。但与qPCR的灵敏度相比,dPCR在低于拷贝数200时有被低估的风险,在高于拷贝数1000时有被高估的风险。dPCR在同一阵列上同时测量转基因和内源性靶点时,需要稀释内源性靶点和转基因靶点在合理拷贝数范围内以保证dPCR测量结果的准确性。上海双螺旋生物仪器数字PCR油滴制造
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