慢病毒大规模纯化的捕获步骤包括：膜过滤澄清，随后切向流过滤/超滤或者体积排阻色谱浓缩。此外，需用核酸酶（benzonase或M-SAN HQ中盐核酸酶）来去除细胞残留的、质粒来源的DNA污染。这两个步骤顺序可以调整，依据项目工艺而定。两种工艺路线各有优缺点：先用核酸酶消化的优点是可去除大的DNA片段，且后续步骤可以去除残留核酸酶；但所用的核酸酶的量也非常大。与此相反，将核酸酶步骤后置的优点是大幅降低核酸酶的量(成本降低)；但后面的步骤必须有将核酸酶去除的能力。此外，后期用核酸酶的缺点是核酸污染可能会结合慢病毒颗粒形成沉淀，进而导致慢病毒在纯化中流失，从而影响得率。生理盐浓度下，M-SAN HQ中盐核酸酶性能优于常用核酸酶。湖北等渗条件中盐核酸酶
大规模生产阶段，AAV/LV载体生产流程跟抗体、疫苗类药物的生产类似，主要包含上游培养、下游纯化及制剂部分。上游培养分为质粒开发、细胞扩增、三质粒共转染及病毒载体生产等步骤。下游纯化分为细胞裂解释放AAV病毒颗粒（可以通过去污剂、机械作用、高渗或冻融操作等）or收获细胞上清液得到含LV病毒原液、加入核酸酶以减少宿主细胞核酸污染、澄清是通过离心或过滤等方法去除细胞碎片和杂质等、超滤浓缩以减少后续色谱纯化体系、亲合及离子交换等纯化得到高纯度病毒载体。制剂部分主要是超滤更换缓冲液、过滤除菌及制剂灌装等。广东生理盐条件中盐核酸酶70950M-SAN HQ中盐核酸酶生产符合ISO 13485:2016规范，提供相关文件用于申报。
一般来说，生物生产工艺用的核酸酶以BenzonaseTM（BenzonaseTM是Merck的注册商标）为主，能高效降解任何形式（双链、单链、线状、环状）的DNA和RNA。该酶来自于大自然界普遍存在的S.Marcescen，通过E.coli发酵生产得到。该酶的适宜反应条件是低盐浓度范围（<100mM盐浓度），且酶活随着盐浓度上升而下降，在300mM盐浓度时酶活几乎丧失。对于细胞基因药物常用的两种病毒载体LV和AAV，LV由于含有脂包膜结构一般都在生理盐条件下存在，而AAV在高盐条件下不易团聚、更稳定。而在生理盐浓度及更高浓度条件下，Benzonase活性受到抑制。
对于含包膜的病毒载体，如慢病毒LV、逆转录病毒RV等，在细胞培养上清液中收获。而M-SAN HQ中盐核酸酶，作为市场上更适合生理盐条件的核酸酶，所以，M-SAN HQ成了包膜病毒载体生产的更好选择。优势在于：1. M-SAN HQ兼容多种细胞培养体系，在细胞培养盐浓度条件下具有更优活性；2. M-SAN HQ酶活更高、酶切速度更快，缩短孵育时间；3. M-SAN HQ能够高效剪切染色质到更小片段，简化下游工艺流程；4. 相比Benzonase，M-SAN HQ用量减少1/2-2/3，降低了酶用量及生产成本。相比全能核酸酶，M-SAN HQ中盐核酸酶能将HCD酶切成更小片段，破坏核小体结构。
染色质由组蛋白和DNA组成，——147个碱基对的DNA缠绕在8个组蛋白（由H2A、H2B、H3和H4形成的八聚体）周围，形成基本的染色质单位，即核小体。核小体像珠串一样串连在一起，并被包装成更高阶的染色质结构。DNA带负电荷，富含碱性氨基酸的组蛋白带正电荷，且组蛋白多聚物有很多疏水区段。所有这些特点导致宿主DNA残留（HCD）能吸附很多物质，包括宿主蛋白残留（HCD）、色谱填料、目的病毒颗粒等，因此，HCD的存在增加了工艺流程的复杂度，同时也降低了病毒颗粒的稳定性。琼脂糖胶结果显示，M-SAN HQ中盐核酸酶能将HCD消化成小于8nt的片段。重庆培养基条件中盐核酸酶70950-150
在150mM NaCl条件下，M-SAN HQ中盐核酸酶的酶切活性达到常规核酸酶的5倍左右。湖北等渗条件中盐核酸酶
在生物工艺流程中，需要使用核酸酶去除终产品中的核酸污染，而核酸酶作为外源成份，也需要在生产流程中去除。核酸酶去除工艺包括热灭活法、酶抑制剂、离子交换和亲合层析法等。慢病毒LV的pI在6.0-6.5左右，包装了完整基因组DNA后的AAV病毒颗粒PI大致为5.9，来自于S.marcescens的全能核酸酶pI 6.85左右，M-SAN HQ中盐核酸酶pI 8.7左右。因此，在同样的条件下，从LV/AAV溶液中去除M-SAN HQ中盐核酸酶比去除Benzonase全能核酸酶更容易、更彻底。湖北等渗条件中盐核酸酶
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