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PNGaseF去糖基化酶基本参数

品牌
Genovis
型号
L1-F02-025

PNGaseF去糖基化酶企业商机

上海倍笃生物科技有限公司（简称“倍笃生物”），由中国科学院及生物医药产业界人士，于2018年1月共同创立。公司代理多个品牌的仪器、试剂及耗材（如Genovis的IdeS酶），遵守相关法规要求，如cGMP规范、ISO13485质量管理体系认证等，致力于为诊断领域如分子诊断及病原微生物检测研发等，药物研发领域如细胞基因药物、核酸药物、抗体药物、干细胞及外泌体研究等客户提供合规、高质量物料及专业服务，以期与客户共同协作，加快研发及生产进度，为客户提供更多价值。ImpaRATOR处理的依那西普显示出与相应的去唾液酸化OpeRATOR处理样品略有不同的消化模式。山东PNGaseF去糖基化酶疾病机理研究

genvois的OpeRATOR 是一种内切蛋白酶，可催化直接靠近 O-聚糖的天然粘蛋白型 O-糖基化蛋白的肽键的水解。内切蛋白酶具有高特异性，可消化丝氨酸或苏氨酸残基的O-聚糖N端的蛋白质。 OpeRATOR 活性需要粘蛋白型的 O-聚糖，并且该酶不会用 N-连接聚糖消化糖蛋白。该酶对具有亚洲化he心1 O-聚糖的位点z活跃。它还消化唾液酸化的he心 1 和he心 3，但程度要低得多。为了获得z佳性能，需要去除唾液酸，因此，SialEXO冻干（唾液酸酶混合物）包含在购买中。山西固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis将OglyZOR酶与依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或没有 SialEXO 孵育 1 小时。

使用Genovis的OpeRATOR图谱O-聚糖位点对依那西普进行LC-MS分析：依那西普是一种 Fc 融合蛋白，具有高度 O-糖基化的铰链区域。将依那西普与OpeRAT一起孵育，并使用LC-MS/MS分析所得糖肽。促红xibao生成素（EPO）是一种具有单个 O-糖基化位点的 ~30 kDa 糖蛋白。在PNGase F去除N-糖并使用SialEXO进行去唾液酸化后，用OpeRAT消化天然蛋白，并通过反相LC-MS分析所得蛋白质片段。O-糖基化的位点可以通过识别OeRATOR消化位点直接推断出来。为了获得良好性能，需要去除唾液酸助剂，因此购买中包括2000个单位（如果SialEXO冻干）。1. 用于方法开发的灵活产品形式；2. 可以结合酶以提高效率；3. 适用于自动化工作流程；4. 即用型 - 只需加水即可。O-聚糖是OpeRATOR活性所必需的，而该酶在N-聚糖上没有活性。OpeRATOR和SialEXO处理后，O-糖基化蛋白被消化成携带O-聚糖的肽。消化发生在O-糖基化位点的N端。

OglyZOR 来源于口腔链球菌，在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签，分子量为 227 kDa。SialEXO来源于Akkermansia muciniphila，在大肠杆菌中表达。SialEXO酶含有His标签，组分的分子量分别为42 kDa和66 kDa。1.高效O-糖苷酶；2. 降低样品异质性，揭示潜在的关键蛋白质修饰；3. 完全、稳健地去除 O-糖he心 1 二糖。Genovis的冻干酶，用于水解糖蛋白上的he心1 O-聚糖。OglyZOR 冻干剂以冻干粉的形式提供，装在 2000 个单位的小瓶中，用于在 2 mg 糖蛋白上水解he心 1 O-聚糖。它需要去除唾液酸助剂才能发挥作用，因此与2000单位的SialEXO冻干一起提供。用SialEXO处理血清，上样于GlycOCATCH，洗涤，洗脱O-糖基化蛋白。Swiss Prot 数据库鉴定蛋白质列表。

Genovis的SialEXO固定化用于复杂糖蛋白的去唾液酸化：在设置反应条件时，需要在所需的反应时间和完成反应所需的酶量之间进行权衡。较高的酶量可保证在更短的时间内完成周转，但会使下游分析复杂化。为了避免此类问题，我们以离心柱形式固定了活性SialEXO。这允许以更短的孵育时间孵育具有明显更高量的唾液酸酶的糖蛋白底物。Genovis测试了 SialEXO 冻干和 SialEXO 固定化在人 C1 抑制剂上的性能。这种糖蛋白是一种具有挑战性的底物，具有 6 个 N- 和多达 26 个 O-聚糖，由 α2,3 和 α2,6 连接的唾液酸修饰。对游离的N-聚糖的分析表明，SialEXO在溶液中完全脱唾液酸化，SialEXO固定化。用于糖蛋白上β1-3,4-连接半乳糖的水解，而不会用酶污染z终制剂。湖北固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶蛋白质组学研究

而不会用酶污染z终制剂，可用于水解 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白。山东PNGaseF去糖基化酶疾病机理研究

Genovis的ImpaRATOR™ 可用于多种 O-聚糖：依那西普是一种融合蛋白，由TNF受体的胞外结构域与人IgG1的Fc部分相连。该蛋白质在Fc区域上方含有多达13个O-糖基化的Ser/Thr残基簇，使其成为一种非常难以在结构上表征的生物制药。为了证明ImpaRATOR的聚糖特异性，制备了三种具有不同聚糖组成的依那西普样品：（i）携带单唾液酸和二唾液酸化he心1结构混合物的未经处理的糖蛋白，（ii）用SialEXO处理的糖蛋白去除唾液酸并产生裸核1结构，以及（iii）用SialEXO和GalactEXO处理的糖蛋白产生单个GalNAc残基，也称为Tn抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一锅反应中处理三个样品（图1）。作为比较，SialEXO处理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR处理。将所得肽还原、烷基化并用HILIC-MS进行分析。FabRICATOR被包括在反应中，以将Fc区与大多数C端糖肽分离，以促进其表征。山东PNGaseF去糖基化酶疾病机理研究

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