宏基因组是指环境中所有微生物的基因组总和。它包含了数以亿计的微生物基因，这些基因编码了各种生物化学过程和功能。通过研究宏基因组，我们可以更好地了解微生物在生态系统中的作用，以及它们对环境变化的响应。是研究宏基因组的重要手段。它通过对环境样品中的 DNA 进行高通量测序，获得大量的微生物基因组序列信息。这些序列可以用于构建微生物群落的基因组草图，分析微生物的物种组成和遗传多样性。宏基因组研究的一个重要方向是挖掘新的生物活性物质。微生物产生的许多天然产物具有重要的生物活性，如、抗药物等。通过宏基因组测序，可以发现新的微生物物种和基因，为药物研发提供新的线索。宏基因组测序技术将促进微生物研究领域的进步，为生态环境的保护和人类健康提供更多的可能性。片剂微生物限度
1991年提出环境基因组学（environmentalgenomics）的概念，同年构建了个通过克隆环境样品中DNA的噬菌体文库。1998年美国国立环境卫生科学研究所启动了环境基因组计划（environmentalgenomeproject，EGP），开展有关人体遗传变异与环境胁迫相互关系的研究。环境基因组学次提出特定生态条件下，全部生物基因组总体概念，这是基因组学的重要进展。1998年提出生命研究对象应是生物环境中全部微小生物的基因组，提出针对特定环境样品中细菌和的基因组总和进行研究的这一宏基因组(metagenome)概念2007年3月，美国国家科学院以“环境基因组学新科学——揭示微生物世界的奥秘”为题发表咨询报告，指出宏基因组学为探索微生物世界的奥秘提供新的方法，这是继发明显微镜以来研究微生物方法的重要进展。 功能基因筛选宏基因组测序摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制。
在研究海洋生态系统时，可以结合使用宏基因组测序和环境 DNA 测序。宏基因组测序可以提供海洋微生物群落的整体信息，包括物种多样性和功能基因；而环境 DNA 测序可以用于特定海洋生物的监测，如濒危物种或入侵物种的检测。这样的综合应用可以更地了解海洋生态系统的健康状况和变化趋势。此外，随着测序技术的不断发展和改进，宏基因组测序和环境 DNA 测序的优缺点也在不断变化和优化。未来，我们可以期待这些技术在灵敏度、准确性和成本等方面的进一步提升，为微生物学研究和环境保护提供更有力的支持。
微生物的定义：微生物是指那些肉眼难以看清、需要借助显微镜才能观察到的微小生物，包括细菌、古菌、、病毒等。环境的范围：环境可以是土壤、水体、空气、生物体表面等各种生态位，其中都存在着大量的微生物。基因组的概念：基因组是指一个生物个体或一个物种的所有遗传信息的总和，包括染色体上的 DNA 以及线粒体、叶绿体等细胞器中的 DNA。总和的含义：“宏基因组是指环境中所有微生物的基因组总和”这句话的意思是，将环境中所有微生物的基因组相加，得到的就是宏基因组。通过宏基因组测序技术，可以对环境中的微生物进行高通量测序。
宏基因组学还可以用于研究微生物的代谢途径和生态功能。宏基因组测序技术的发展也带来了一些挑战。例如，如何从大量的测序数据中准确地识别和注释微生物基因，如何分析微生物群落的复杂性和动态变化等。为了解决这些问题，需要发展新的数据分析方法和算法。为了促进宏基因组学的发展，国际上已经建立了一些大型的宏基因组研究项目和数据库。例如，美国国立卫生研究院的人类微生物组计划（Human Microbiome Project）旨在研究人类体内的微生物群落，以及它们与健康和疾病的关系。宏基因组的研究可以帮助科学家了解微生物在生态系统中扮演的角色和功能。全基因组高通量测序
在鉴定低丰度的微生物群落、挖掘更多基因资源方面具有很大优势。片剂微生物限度
宏基因组测序数据分析的基本流程包括以下步骤：数据预处理：对测序得到的原始数据进行质量控制，去除低质量的reads、接头序列和污染等。组装：将预处理后的数据进行组装，得到微生物基因组的草图。基因预测：在组装的基因组草图上预测基因的位置和功能。物种注释：对预测的基因进行物种注释，确定它们所属的微生物物种。功能注释：对基因进行功能注释，预测它们的生物学功能。群落分析：分析微生物群落的组成和结构，包括物种丰度、多样性指数等。比较分析：比较不同样品或处理组之间微生物群落的差异，找出差异的物种和功能。数据可视化：将分析结果以图表或图形的形式展示出来，便于理解和解释。结果解读：根据数据分析结果，得出关于微生物群落的结论，并结合生物学背景进行解释。 片剂微生物限度
