武汉LV整合位点实验室

2018年CTL019的一项临床试验中，一名B-ALL病人在接受CAR-CD19zhiliao28天后即达到CR，却在6个月后复发，PCR检测没有发现任何的RCL，结合持续性慢病毒插入位点的克隆丰度分析，研究者较终发现一个携带CAR插入位点的CAR-B细胞克隆。进而发现这个B细胞是CAR-T生产过程中的一个CAR-B副产物，而CAR在该B细胞上的顺式插入表达导致CAR靶标表位屏蔽，导致该B细胞克隆的耐药。这个案例也提示除去CAR-Tzhiliao方法本身的潜在风险外，CAR-T在生产工艺也会产生二次成瘤的风险。如何确定慢病毒/逆转录病毒前病毒整合位点？武汉LV整合位点实验室

插入突变风险评估一些整合性载体（如逆转录病毒、慢病毒、转座子）可将外源基因插入整合到细胞基因组中，这可能会导致关键基因突变或jihuo原基因，从而导致恶性liu风险增加。影响插入突变的关键风险因素包括：（1）载体的整合特征，如插入位点的偏好性；（2）载体的设计，如增强子、启动子等构建元件的活性，影响邻近基因的潜力；产生剪接突变体的潜在剪接位点或多聚腺苷酸信号等；（3）细胞载体拷贝数；4）转基因表达产物的功能活性（如与细胞生长调控相关）和表达水平；5）靶细胞群的转化可能性，这可能与细胞的分化状态、增殖潜力、体外培养条件和体内植入环境等有关。江苏整合位点服务目前,基因整合位点主要通过PCR方法分离并经测序鉴定。

应用场景：单克隆抗体药物辅助筛选；致xingbing毒整合位点检测与整合偏好性分析等；WGS不适用于转染之后未经过传代培养和表型筛选的细胞系。丰富的项目经验目前，唯可已与国内外多家免疫zhiliao研究前沿企业开展合作，采用该方法对高度异质性的CAR-T细胞进行整合位点检测与细胞安全性评估，具有较为丰富的项目经验。一般HBV插入到基因组中形成下图结构。使用三代测序，靶向插入区域的测序reads可分为Readsgroup1（HBV插入区域测通）和Readsgroup2（reads部分比对染色体，部分比对HBV插入区域）。基于三代数据比对后bam文件的IGV图，判断变异类型，推断断点类型和插入序列。

使用脚本抓取Readsgroup1类型reads，根据比对结果进行统计，计算染色体断点位置以及HBV序列的断裂信息。唯可公司的整合位点分析服务采用LM-PCR方法，可以有效分析重组细胞外源序列的整合位点，充分评估插入突变的可能性和相关风险，保证重组细胞安全性，从而协助我们的客户顺利完成从课题研究到药品注册申报过程。聚焦基因zhiliao，唯可可以提供基因zhiliao几大主流工具：病毒基因组测序，CRISPR基因编辑后的测序服务。同时我们可以为客户提供高质量的可用于细胞ganran和动物实验的病毒服务。推出AAV-ITR测序方法，能够有效评估AAV质粒中ITR区域的完整性，迅速准确地检测到ITR区域的突变，为后续故障的排除节省时间和精力。下游我们同期推出重组细胞整合位点服务、基因编辑脱靶检测服务，确保重组/编辑细胞安全性。在靶向CD19的CAR-T临床试验中,慢病毒传染的CAR-T整合位点显示出更的抗效力。

CAR-T慢病毒载体整合的潜在安全性隐患包括CAR-Tzhiliao在内的基因编辑性细胞zhiliao方法，采用慢病毒整合性载体将外源基因插入整合到细胞基因组中，某些插入位置可能会导致关键基因突变或jihuo原基因，从而导致恶性liu风险增加。因载体整合导致致瘤性基因变异及新发细胞变称为二次成瘤。在持续性细胞zhiliao过程中，这种潜在的成瘤性不良反应的发生时间往往会有明显的滞后性且很难预测。因此CAR-Tzhiliao需要评估潜在的插入突变风险和致性风险。转基因植物外源基因的检测方法及整合位点分析。北京ISA整合位点企业

传统PCR技术分析整合位点依赖限制性内切酶酶切,存在一定偏好性；武汉LV整合位点实验室

基因编辑产品建议观察15年或至数据表明不再存在任何风险。腺相关病毒载体建议观察5年或至数据表明不再存在任何风险。以上长期随访时间的建议主要基于基因zhiliao的产品类型，具体产品的随访时间取决于产品的特性和体内存在时间、转基因表达时间、迟发性不良反应的预期时间及发生率、受试者适应症和预期生存期、给药途径、以及长期随访的其他观察目的。随着随访数据的积累，研究者和研究申办方可能会根据产品的存在情况、转基因表达和临床表现的持续评估情况，延长或缩短长期随访的持续时间。如果研究申办方认为其基因zhiliao产品安全性风险较低、无需开展长期随访临床研究，或者希望变更随访时间，应合理说明依据或变更理由并与药品监督管理部门进行沟通。武汉LV整合位点实验室