深圳基因编辑整合位点方法

2020年9月发布的《细胞zhiliao产品申请临床试验药学研究和申报资料的考虑要点》“生产工艺开发的技术要求”及“质量研究和质量控制中的安全性研究”部分要求提供目的基因在染色体中的整合情况及提供细胞恶性转化（成瘤性和致瘤性）进行安全性研究和评估内容。2020年2月发布的《免疫细胞zhiliao产品临床试验技术指导原则（试行）》中规定：探索性临床试验的安全性和耐受性要考虑"外源基因随机整合到细胞基因组形成插入突变，导致成瘤性和恶性转化等"。迎细胞基因浪潮,整合位点分析方法来助力。深圳基因编辑整合位点方法

上述建议是基于现有科学认识，随着临床研究和应用数据的积累，以及对免疫细胞zhiliao产品了解的深入，可能会对随访时间的建议进行调整。根据临床试验的研究计划和持续时间，长期随访可能作为临床试验的一部分，或者设计为一项单独研究，如果对长期监测有一个单独的研究方案，在受试者参加临床试验前，除获得受试者对干预性临床试验的知情同意外，还应获得其对长期随访研究计划的知情同意。如果长期随访作为临床试验的一部分，随访时间可能超过主要终点或获益风险评估所需要的观察时间，这种情况下，通常无需在开始后续试验或提交上市申请之前完成长期随访。苏州CAR-T整合位点实验室慢病毒载体介导的转基因整合位点研究方法。

免疫细胞zhiliao产品的风险水平与多种因素有关，如细胞来源和类型、体内活性和存活时间、是否有外源基因表达、基因表达使用的载体类型以及是否存在基因组整合等。针对不同风险水平的免疫细胞zhiliao产品，随访持续时间的建议如下：对于没有外源基因表达、且体外操作不改变细胞存活时间及分化潜能的免疫细胞zhiliao产品，长期随访的持续时间不应短于细胞在体内的自然存活时间，建议对受试者进行1年或以上的随访。对于有外源基因表达、但不存在基因整合或基因重组风险，或载体的基因整合或重组风险较低的免疫细胞zhiliao产品，建议对受试者进行不少于5年的随访。对于有外源基因表达、而且表达载体存在基因整合或有基因重组风险的免疫细胞zhiliao产品，建议对受试者观察不少于15年。

应用场景：单克隆抗体药物辅助筛选；致xingbing毒整合位点检测与整合偏好性分析等；WGS不适用于转染之后未经过传代培养和表型筛选的细胞系。丰富的项目经验目前，唯可已与国内外多家免疫zhiliao研究前沿企业开展合作，采用该方法对高度异质性的CAR-T细胞进行整合位点检测与细胞安全性评估，具有较为丰富的项目经验。一般HBV插入到基因组中形成下图结构。使用三代测序，靶向插入区域的测序reads可分为Readsgroup1（HBV插入区域测通）和Readsgroup2（reads部分比对染色体，部分比对HBV插入区域）。基于三代数据比对后bam文件的IGV图，判断变异类型，推断断点类型和插入序列。如何确定慢病毒/逆转录病毒前病毒整合位点？

DDW2020年，全球细胞和基因zhiliao（CGT）市场达到约40亿美元，预计到2030年将增长到约340亿美元。随着较近几项CGT的批准、不断扩充的渠道以及CGT公司的大量资金，这些疗法的商业化步伐正在继续加快。据估计，到2025年，FDA将每年批准10到20种细胞和基因zhiliao产品。然而，CGT产品影响医疗的速度取决于该行业如何应对CGT开发新兴领域的新挑战和风险。因为建立一个标准的、具有成本效益的、专业的研究和制造过程，常面临复杂的情况，并且由于缺乏主题**和受过充分培训的专业人员进行系统/内部研发，这些限制因素将成倍增加。慢病毒载体在人角质形成细胞基因组中的整合位点分析。深圳基因编辑整合位点方法

目前,基因整合位点主要通过PCR方法分离并经测序鉴定。深圳基因编辑整合位点方法

国内外基因zhiliao产品开展的非临床研究、长期随访获得的临床经验以及基因组整合位点分析方法的明显改进，都有助于更好地理解整合性基因zhiliao载体相关风险。通常认为，很多能够介导外源基因转入细胞核的载体（如逆转录病毒载体、转座子元件和基因编辑产品等）有基因组整合潜力，需要通过长期随访观察迟发性不良反应的风险；根据目前的认识和研究数据，质粒、痘病毒、腺病毒和腺相关病毒（AAV）等载体的基因zhiliao产品整合风险较低，国际上开展的临床试验中也表现出较低的迟发性不良反应风险。深圳基因编辑整合位点方法