病毒宏基因组学中包含兆级的短序列片段(Reads)。通过不同的序列拼接软件将Reads拼接较长的DNA序列片断(Contigs)。数据组装可通过K-mer分析评估各个样品的测序深度,通过对SOAPdenovo设置不同K值,筛选较好组装结果,对较好组装结果进行校正,并统计Reads利用率。接着利用已测序生物体的DNA序列构建数据库,将拼接后... 【查看详情】
在探普生物进行宏病毒基因组测序的流程非常简单,简而言之,客户只需要说清楚样品情况,准备样品即可,其他事宜都由探普来进行安排。大致流程如下:1)与销售人员沟通项目需求和样本情况;2)探普生物工作人员拟定项目合同,双方协商合同内容后签字盖章;3)按样本准备指南准备好样本,填写信息单后通知销售人员预订干冰,安排样本寄运输;4)客户支付项目启动款... 【查看详情】
宏基因组是1998年提出的新名词,其定义为“thegenomesofthetotalmicrobiotafoundinnature”,即生境中全部微小生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因,目前主要指环境样品中的细菌和的基因组总和。而所谓宏基因组学(或元基因组学,metagenomics)就是一种以环境样品中的微生物... 【查看详情】
宏病毒组是病毒的宏基因组,该技术是随着高通量测序技术的兴起而发展起来的。该技术主要是使用大量微生物群体样本的测序数据和生物信息学分析手段,以多种数据库为基础,进行群体的种类和功能分析。因此,它主要的应用场景在于微生物群体研究,如肠道微生物、皮肤微生物、口腔微生物、水体微生物、土壤微生物等。一直以来宏基因组技术都是在细菌领域使用,病毒的样本... 【查看详情】
宏基因组概念:宏基因组有广义和狭义两种概念。广义的概念是指所有可能与人的生活密切相关的微生物的基因组,包括长期共生在体内的微生物,也包括可以进入体内,对人类的生活造成不同形式的影响的微生物。而狭义的宏基因组是只指长期共生在体内的微生物。宏基因组测序分析技术:单是共生在人体内的微生物就有1000多种,特别是胃肠道内的微生物为丰富。宏基因组除... 【查看详情】
微生物检测相关知识:微生物检测涉及多行业和领域,在实验室检测中有着重要的地位。将微生物接到适于它生长繁殖的人工培养基上或活的生物体内的过程叫做接种。划线接种这是常用的接种方法。即在固体培养基表面作来回直线形的移动,就可达到接种的作用。常用的接种工具有接种环,接种针等。在斜面接种和平板划线中就常用此法。三点接种是在研究霉菌形态时常用此法。此... 【查看详情】
微生物怎么进行检测?通过显微镜直接观察。一般来说,在一定的培养条件下(相同的培养基、温度以及培养时间),同种微生物表现出稳定的菌落特征。这些特征包括菌落的形状、大小、隆起程度和颜色等方面。因此可以通过显微镜观察菌落特征对微生物种类进行判断。使用选择培养基培养微生物或人为提供有利于目的菌株生长的条件。选择培养基,顾名思义其作用是允许特定... 【查看详情】
未知病原微生物鉴定中未知病毒是指未被发现或证实的某种病毒,个体微小,无完整细胞结构,含单一核酸(DNA或RNA)型,必须在活细胞内寄生并复制的非细胞型微生物。基因芯片病毒检测系统是新发明的一种精确检测病原体的检测系统。每种病原体都有其特定的基因组成,即DNA。基因芯片技术就是针对病原体的这一特性,将被检测的病原体的DNA固化在电子芯片上,... 【查看详情】
微生物鉴定:微生物鉴定能采用不同微生物对周围环境的资源的利用度有所不同的特性来区别。比如说微生物能否以二氧化碳作为微生物自身生长的碳源以及对糖类等物质的需求程度来区分。亦或者说对不同类型生长因子的需求也是重点。其实我们还可以通过控制微生物的生长环境来判断微生物的种属类型。比如说该微生物生长需氧,以及适合在什么温度进行生长繁殖,什么温度微生... 【查看详情】
随着100多年来人们对病毒认识不断深入,以及生物技术的发展,人类积累了多种病毒性疾病的鉴别诊断能力,掌握了部分病毒的致病机制及流行规律,研制出一些病毒的特异性疫苗,并设计生产了各种抗病毒化学制品,极大地降低了病毒性疾病的危害性。病原微生物检测方法-高通量测序技术之检验检疫中的应用作为近些年出现的新技术,高通量测序技术经过不断地发展,已... 【查看详情】
微生物快速检测技术相对于传统检测方法,快速检测方法是指从样品制备到出具检测结果的整个检测过程能够在短时间内完成的检测方法,包括在样品制备、实验准备、操作过程中和自动化上加以简化的方法。目前,国际上对“短时间”的共识主要在于三个方面:1)理化指标的检测分析在2h内完成。2)应用于现场检查的能够在30min内完成。3)与传统方法相比,能够缩短... 【查看详情】