EndoS,即糖苷内切酶S(Endo-S),是一种具有高度特异性的酶,它在生物化学研究中有着重要应用,尤其是在糖蛋白和抗体药物偶联物(ADCs)的研究中。以下是EndoS的一些关键特点:1.**特异性**:EndoS能够特异性地识别并切割N-连接糖链的壳二糖结构,即在N-乙酰葡糖胺(GlcNAc)和天冬酰胺之间的连接处进行切割。2.**应用**:在制备糖链定点ADC化合物中,EndoS被用于将小分子细胞毒药物“一步”定点连接到抗体糖基化位点,提供了一种重要的技术方法。3.**兼容性**:EndoS对多样化的LacNAc修饰显示出良好的兼容性,可以接受不同生物正交基团、荧光基团等衍生物作为底物,实现抗体糖基化修饰。4.**活性**:EndoS的活性对多肽没有严格的要求,可以接受蛋白质、肽、天门冬酰胺或游离聚糖作为底物。但是,对于具有三、四个支链的唾液酸化及去唾液酸化的聚糖,EndoS没有活性。5.**产品形式**:EndoS通常以带有His标签的形式存在,便于从反应中去除,这在实验操作中提供了便利。6.**研究进展**:EndoS在去糖基化方法研究中是一个重要的工具,特别是在研究糖蛋白的多肽部分和多糖部分的结构和功能时。
在进行IdeSProtease的分子改造时,平衡酶的活性和稳定性是一个关键的挑战。以下是一些策略,这些策略可以帮助研究者在提高酶稳定性的同时保持或甚至提高其催化活性:1.**定向进化**:使用定向进化技术进行多轮的突变和筛选,以获得在所需条件下具有改进稳定性的酶变体,同时监测其催化活性,确保改造后的酶保持高效催化能力。2.**结构基础的理性设计**:基于IdeSProtease的三维结构信息,识别可能影响稳定性和活性的关键氨基酸残基,通过点突变或小肽插入来优化这些区域。3.**计算模拟**:利用分子动力学模拟和计算化学方法预测突变对酶稳定性和活性的影响,以指导理性设计。4.**糖基化修饰**:通过糖基化可以增加酶的溶解性和稳定性,但需注意不要干扰酶的活性位点或底物结合位点。5.**活性位点附近的柔性区域改造**:通过刚化柔性区域的策略提高酶的热稳定性,同时保持活性位点的柔性以维持催化活性。6.**长距离相互作用分析**:研究蛋白质内部的长距离相互作用,识别影响稳定性和活性的远程突变,通过这些突变优化酶的性能。7.**酶活性和稳定性的权衡分析**:通过实验数据,分析酶活性和稳定性之间的关系,找到比较好平衡点。Recombinant Cynomolgus NCAM-1/CD56 Protein,His Tag将MAGE-A3基因序列克隆到一个表达载体中,该载体通常包含有抗生物质抗性基因、启动子、核糖体结合位点。
EndoS糖苷内切酶S在抗体药物偶联物(ADCs)研究中的应用主要体现在糖链定点偶联技术上。通过上海药物所的研究,开发了一种新颖的糖链定点ADC制备策略,利用EndoS2这种糖苷内切酶,可以将小分子细胞毒药物“一步”定点连接到抗体的糖基化位点,实现了糖链定点ADC化合物的制备。定点偶联技术相比传统的随机偶联具有更好的方法指数,能够提高ADC的均一性和稳定性,是当前ADC领域的研究热点之一。在抗体的Fc结构域N297位,这是一个保守的糖基化位点,通过在该位点引入细胞物质,可以形成具有优势的糖链定点ADC化合物(glycosite-specificADCs,gsADCs)。此外,EndoS2对多样化的LacNAc修饰显示出良好的兼容性,能够高效获得功能修饰的糖工程抗体,并且可以用于抗体的内吞成像研究及糖链延伸等功能化研究。研究人员通过这种“一步”制备策略得到的糖链定点ADC化合物,在结构均一性、亲水性、体外稳定性以及体外活性方面表现良好,并且在体内瘤抑制活性方面,相比阳性对照ADC化合物,在低载药量的情况下具有更强的抑制效果。EndoS酶的这些应用,不仅展示了其在简化ADC制备流程中的潜力,还有助于推动定点ADC药物的深入发展,为未来的生物药物开发提供了新的思路和方法。
使用PreScissionProtease进行蛋白质切割时,为保证高纯度和高活性,需要考虑以下关键因素:1.**特异性切割位点**:确保融合蛋白中包含PreScissionProtease特异性识别的序列,以实现精确切割。2.**酶与底物的比例**:适当比例的酶量对于高效切割至关重要,过多或过少的酶都可能影响切割效率和纯度。3.**反应条件**:包括温度、pH和反应时间等,这些条件需要优化以确保酶的活性和选择性。通常,PreScissionProtease在4°C下进行酶切。4.**缓冲液兼容性**:使用与PreScissionProtease兼容的缓冲液,避免使用可能抑制酶活性的离子或化学物质。5.**蛋白浓度**:确保融合蛋白有足够的浓度,以提高切割效率和减少样品损失。6.**酶切后的分离**:切割后,需要有效分离目的蛋白和切割下来的标签,通常利用亲和层析等方法。7.**避免蛋白降解**:在实验过程中添加蛋白酶抑制剂,以防止蛋白降解酶对目的蛋白的降解。8.**避免蛋白质聚集**:在切割过程中,应避免条件导致蛋白质聚集或沉淀,这可能会影响纯度和活性。9.**避免氧化**:在蛋白质处理过程中,添加抗氧化剂如DTT或TCEP,以防止半胱氨酸残基的氧化。10.**清洁的实验环境**:确保实验器材和环境的清洁,避免微生物污染和核酸污染。在cDNA末端快速扩增(RACE)技术中,Ultra-Long Master Mix 可以用来扩增5'和3'末端的长片段cDNA。
酵母重组表达的N-糖苷酶F(PNGaseF)在实际应用中具有以下优势:1.**高比活性**:具有高达750,000U/mL的比活性,这表明该酶在催化反应中具有很高的效率。2.**快速反应**:新型的FastPNGaseF能在数分钟内完成彻底且无偏好性的去糖基化,缩短了实验时间。3.适用性:PNGaseF可以用于天然或变性条件下的糖蛋白或糖多肽的去N-糖基化修饰。4.**无其他糖苷酶活性**:该酶专一性高,无其他糖苷酶活性,确保了实验结果的准确性。5.**His标签**:带有His标签,便于通过亲和层析进行纯化和检测。6.**稳定性和储存条件**:在含有50%甘油的储存缓冲液中,-15~-25℃保存,有效期长达1年。7.**简化的实验流程**:FastPNGaseF简化了实验流程,减少了实验时间,同时保持了灵敏度和重复性。8.**兼容性好**:去糖基化后的产物可以直接用于下游的色谱或质谱分析,无需额外的纯化步骤。9.**无偏好性**:能够迅速且无偏好性地去除所有的N-糖链,确保了获得的糖链分布能够表示抗体的正确组成。Phusion DNA Polymerase 应在后面加入反应体系中,以避免其3'-5'外切酶活性降解引物。Recombinant Human SKP1 Protein,His,Avi Tag
Uracil-DNA Glycosylase (UDG) 是一种在DNA修复过程中起作用的酶,其主要功能是识别并去除DNA中的尿嘧啶碱基。Recombinant Mouse Leptin Protein,hFc Tag
PreScissionProtease(PSP)在去除融合蛋白标签时,对目的蛋白的纯度和活性的影响通常是积极的,具体表现在以下几个方面:1.**小化污染**:由于PSP具有高度的特异性,它在特定的肽键处切割,从而减少了非特异性切割可能导致的蛋白质片段,这有助于保持目的蛋白的纯度。2.**减少蛋白质修饰**:PSP的特异性切割有助于避免在切割过程中对目的蛋白引入额外的修饰,如磷酸化或糖基化,这些修饰可能会影响蛋白质的活性和稳定性。3.**保持活性**:如果融合蛋白标签的设计和切割位点选择得当,PSP切割后的目的蛋白通常能够保持其原有的生物活性。切割位点通常位于标签和目的蛋白之间,这样切割后不会在目的蛋白上留下额外的氨基酸,从而减少了对蛋白质结构和功能的影响。4.**提高纯度**:PSP切割后,可以通过亲和层析等方法将标签、PSP以及未切割的融合蛋白分离,从而获得高纯度的目的蛋白。5.**便于后续分析**:去除标签后的目的蛋白更易于进行后续的质谱分析、晶体学研究或其他生物化学分析,因为去除了可能干扰分析的标签部分。6.**稳定性**:在某些情况下,融合蛋白的标签可能有助于稳定目的蛋白的构象,因此在去除标签后,需要适当处理以维持目的蛋白的稳定性。Recombinant Mouse Leptin Protein,hFc Tag
磁珠法DNA凝胶回收试剂盒是一种用于从DNA琼脂糖凝胶中回收特定DNA片段的实验室工具。与传统的柱纯化方法相比,磁珠法具有多个优势:1.**操作简便快捷**:磁珠法DNA凝胶回收试剂盒的操作步骤通常包括凝胶的融化、DNA的结合、磁珠的洗涤和DNA的洗脱,整个过程可以在20分钟内完成。2.**高纯度和高回收率**:磁珠法能够稳定、高效地从凝胶中回收DNA,纯化所得的DNA可直接用于酶切、连接、转化细菌、测序、PCR、杂交等后续操作。通常回收率达到60-80%,对于200bp以下小片段和10kb以上大片段的回收率有所下降。3.**适用性广**:适用于100bp以上DNA片段的纯化,对达到10kb片...