DNaseI是一种使用的酶,它能够水解单链或双链DNA,产生5'端为磷酸基团的二核苷酸、三核苷酸或更短的寡核苷酸片段。这种酶的活性依赖于钙离子,并且可以被镁离子或二价锰离子启动。在镁离子存在的情况下,DNaseI可以随机剪切双链DNA的任意位点;而在二价锰离子存在时,它可以在同一位点剪切DNA双链,形成平末端或1-2个核苷酸突出的粘末端。DNaseI的一个特点是它不含RNase活性,因此可以用于处理各种RNA样品,而不会对RNA造成降解。DNaseI的应用非常广,包括但不限于:-制备不含DNA的RNA样品;-在RT-PCR反应前去除RNA样品中可能的DNA污染;-体外RNA聚合酶催化的RNA转录后去除DNA模板;-进行DNaseI足迹实验研究DNA-蛋白质相互作用;-缺口平移(nicktranslation);-产生DNA随机片段文库;-在细胞凋亡TUNEL检测中部分剪切基因组DNA作为阳性对照。DNaseI通常从牛胰腺中纯化得到,其分子量约为32kDa(单体)。活性定义为在37℃、10分钟内,能够完全降解1μgpBR322质粒DNA所需的酶量。在实验中,DNaseI的活性单位通常以Kunitz单位来表示,该单位是基于特定条件下酶降解DNA的能力来定义的。牛痘DNA拓扑异构酶I是一种来源于牛痘病毒的酶,有多种作用于DNA分子的能力。Purified Protein A
dNTPMix(脱氧核苷酸三磷酸混合溶液)的"特异性"一词在不同的上下文中可能有不同的含义。在分子生物学领域,特异性通常指的是分子识别和相互作用的精确性。对于dNTPMix,特异性可以指以下几个方面:1.**碱基特异性**:dNTPMix包含四种dNTPs(dATP、dCTP、dGTP、dTTP),每种对应DNA中的一个特定碱基。在DNA合成过程中,DNA聚合酶确保只有正确的互补dNTP与模板链上的碱基配对,这体现了碱基配对的特异性。2.**酶特异性**:某些DNA聚合酶具有校正(proofreading)功能,它们可以识别并修正配对错误,提高DNA合成的特异性。3.**应用特异性**:dNTPMix可以为特定的DNA合成应用提供所需的所有四种核苷酸,例如PCR、cDNA合成、DNA测序等。不同的应用可能需要特定的dNTP浓度或配方。4.**质量控制特异性**:dNTPMix在生产过程中会进行质量控制,以确保没有杂质、DNase和RNase污染,保证产品在实验中的特异性表现。5.**稳定性和纯度特异性**:dNTPMix的稳定性和纯度(通常≥99%)对于实验的成功至关重要,高纯度的dNTPMix可以减少非特异性反应的发生。6.**反应条件特异性**:使用dNTPMix时,需要考虑反应条件的特异性,如Mg2+浓度、pH值、温度等,这些条件都会影响DNA合成的特异性。Recombinant Human PSMP Protein,hFc Tag由于Pfu DNA Polymerase 对引物的质量要求较高,使用纯度高的引物可以减少由于引物错误导致的非目标突变。
1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)主要用于从RNA模板合成链cDNA,而不是直接用于线性RNA的放大。然而,合成的cDNA可以作为模板用于后续的线性RNA放大过程,这通常涉及以下几个步骤:1.**cDNA合成**:使用1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)按照试剂盒的说明进行操作,从线性RNA模板合成链cDNA。2.**第二链cDNA合成**:在某些情况下,可能需要合成双链cDNA。这可以通过使用DNA聚合酶和第二链合成试剂来完成,从而获得完整的双链cDNA。3.**线性RNA放大**:一旦获得了cDNA,可以使用体外转录(IVT,InVitroTranscription)技术来放大RNA。这通常涉及以下步骤:-使用含有RNA聚合酶启动子序列的特定引物对cDNA进行PCR扩增。-使用含有RNA聚合酶识别位点的引物进行体外转录反应,以合成大量RNA拷贝。4.**RNA纯化**:体外转录产生的RNA需要通过适当的方法(如柱层析或沉淀)进行纯化,以去除DNA模板、未反应的核苷酸和其他杂质。5.**RNA质量检测**:使用凝胶电泳或生物分析仪检测RNA的质量和大小,确保RNA的完整性和纯度。
Lambda核酸外切酶(LambdaExonuclease)高度特异性地作用于5'端磷酸化的双链DNA主要通过以下几个方面实现:1.**结构特异性识别**:Lambda核酸外切酶具有识别特定DNA结构的能力,特别是5'端磷酸化的双链DNA。这种识别能力通常由酶的活性位点结构决定,能够与5'-磷酸基团形成特定的相互作用。2.**酶活性位点**:酶的活性位点含有氨基酸残基,这些残基能够与5'-磷酸基团形成氢键或其他非共价相互作用,从而稳定酶与DNA的结合。3.**切割机制**:Lambda核酸外切酶通过水解5'-磷酸二酯键来降解DNA链。它从5'端开始,逐个移除核苷酸,直到遇到非5'-磷酸化的末端或遇到结构上的障碍。4.**低活性对非特异性底物**:对于5'-羟基(OH)末端的DNA或单链DNA,Lambda核酸外切酶的活性降低,因为这些底物缺乏与酶活性位点结合所需的特异性相互作用。5.**酶动力学**:Lambda核酸外切酶对5'-磷酸化双链DNA的酶动力学参数(如Km和Vmax)与对非特异性底物的参数有差异,这反映了其对特异性底物的高亲和力和高催化效率。6.**过程性(Processivity)**:一旦Lambda核酸外切酶结合到特异性底物上,它可以连续移除多个核苷酸,而不需要频繁地与底物解离和重新结合,这增加了酶的效率。Cas9 NLS可用于体外实验中筛选能够高效引导Cas9蛋白进行DNA剪切的gRNA序列 。
T4UvsX重组酶在生产时由大肠杆菌表达和纯化,指的是利用分子生物学技术将T4UvsX重组酶的基因克隆到大肠杆菌(Escherichiacoli)中,然后通过大肠杆菌的生物合成机制来生产这种酶。具体过程如下:1.**基因克隆**:首先,科学家们会从T4噬菌体中分离出编码T4UvsX重组酶的基因。2.**载体构建**:将这个基因插入到一个质粒(一种小型、圆形的DNA分子)中,这个质粒可以作为载体,将目标基因导入大肠杆菌。3.**转化**:将含有T4UvsX基因的质粒转化到大肠杆菌细胞中。转化是指将外源DNA引入到细胞内的过程。4.**表达**:一旦质粒进入大肠杆菌细胞,它将开始表达T4UvsX基因,即利用大肠杆菌的核糖体和其他细胞机制来合成T4UvsX重组酶的蛋白质。5.**培养**:将转化后的大肠杆菌在适宜的培养基中培养,使其繁殖,从而增加T4UvsX重组酶的产量。6.**纯化**:培养一段时间后,收集大肠杆菌细胞,通过一系列生化方法(如离心、过滤、层析等)从细胞裂解物中提取并纯化T4UvsX重组酶。TBE (Thymine base editor):这是一种新型的碱基编辑工具,不依赖脱氨酶,能够通过人源化尿嘧啶DNA-糖基化酶。Recombinant Mouse P4HB Protein,His Tag
Pfu DNA Polymerase 适合扩增较长的DNA片段,有助于在基因编辑中处理大的基因区域或复杂的基因结构。Purified Protein A
pA-Tn5转座酶的产品组分通常包括以下几个部分:1.**pA-Tn5转座酶蛋白**:一种高活性的Tn5转座酶突变体与ProteinA的融合蛋白,它是产品的主要组分,用于实现DNA片段化和接头连接的功能。2.**储存溶液**:碧云天的BeyoNGS™pA-Tn5转座酶产品含有特定的储存溶液,其组成为50mMHEPES(pH7.2),100mMNaCl,0.1mMEDTA,1mMDTT,0.1%TritonX-100,50%(v/v)Glycerol,这种溶液有助于保持酶的稳定性和活性。3.**测序接头(Adapters)**:用于与pA-Tn5转座酶组装形成pA-Tn5转座体(pA-Tn5Transposome),这是进行CUT&Tag实验的必需组分。4.**反应缓冲液**:部分产品包含用于转座酶反应的缓冲液,例如5×TagmentBuffer,这种缓冲液含有Mg2+,对转座酶的活性至关重要。5.**附件**:某些产品可能还包括附件,如说明书,提供产品使用和保存的详细信息。6.**其他组分**:根据产品的不同,可能还包括CouplingBuffer、AnnealingBuffer等其他辅助组分,这些组分有助于转座酶与DNA的结合和反应的进行。7.**包装规格**:pA-Tn5转座酶的包装规格可能有所不同,例如碧云天提供的BeyoNGS™pA-Tn5转座酶有800pmol和4000pmol两种包装规格。Purified Protein A
ExoIII(ExonucleaseIII)和Lambda核酸外切酶(λExonuclease)在DNA末端处理上的主要不同点如下:1.**作用方向**:-**ExoIII**:具有3'→5'外切脱氧核糖核酸酶活性,它从DNA链的3'-OH末端逐步切去单核苷酸。-**Lambda核酸外切酶**:是一种5'→3'核酸外切酶,能选择性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的双链DNA。2.**底物特异性**:-**ExoIII**:适底物是平末端或5'末端突出的DNA,但也可以作用于双链DNA切刻位点产生单链缺口。由于对单链DNA无活性,因此难以切割3'突出末端。-**Lambda核酸外切酶**:适底...