沉积物类诺卡氏菌

施氏芽孢杆菌（Bacillus smithii）是芽孢杆菌属中少见的“高温工匠”，标准菌株 JCM 9076 更早从堆肥深处分离，可在 30–65 ℃、pH 4.5–9.0 范围内旺盛生长，更适温度 55 ℃，芽孢耐 100 ℃沸水 2 h 仍存活，是验证高压蒸汽灭菌的指示菌之一。其耐热关键在于芽孢内高浓度吡啶二羧酸钙（DPA-Ca）结合低水分状态，配合小分子热休克蛋白，使酶与 DNA 在高温下依旧稳定。2024 年，中国团队从湖南镉污染稻田筛选到解磷菌株 M2（保藏号 CCTCC M2024167），鉴定为 B. smithii。该菌可在 50 mg L⁻¹ Cd²⁺、6 % NaCl 条件下正常分泌有机酸，将难溶磷酸钙转化为磷，盆栽玉米根际有效磷提高 42 %，籽粒镉含量下降 35 %，实现“增磷减镉”同步完成。在工业酶方向，施氏芽孢杆菌是“高温酶工厂”。其耐碱性 α-淀粉酶更适温度 70 ℃，在淀粉液化、纺织退浆中可省去降温环节，节能 15 %；耐热蛋白酶在 60 ℃、30 % 乙醇中仍保持 80 % 活性，为生物炼制提供新型催化剂。农业应用上，M2 菌株与秸秆堆肥复配，可使堆体 24 h 升至 65 ℃，纤维素降解率提高 30 %，堆肥周期缩短 7 d；作为功能性菌剂，每亩基施 200 g 菌粉，冬小麦越冬前磷吸收量提高 18 %，分蘖数增加 1.2 个，对后期倒伏有明显缓解作用。浸麻类芽孢杆菌是一种革兰氏阳性菌，它在麻类植物纤维加工中发挥着独特的作用。沉积物类诺卡氏菌

假坚强芽孢杆菌（Bacillus pseudofirmus）是芽孢杆菌属中“外柔内刚”的。菌落洁白、边缘整齐，杆状细胞可形成椭圆芽孢，且具周身鞭毛，能运动；它耐碱、耐盐、耐干燥，可在pH 9–11、8 % NaCl的极端环境中旺盛生长，故得名“假坚强”。首要本领是“生物降碱”。菌株OF4从肯尼亚盐碱湖分离，基因组携带多拷贝Na⁺/H⁺逆向转运蛋白基因，可在高盐高碱条件下维持胞内pH 7.5，同时分泌苹果酸、乳酸等有机酸，2 d内将周围pH由10降至8，为后定植作物营造“微酸绿洲”。盆栽试验中，用10⁷ CFU/g菌液拌土，碱蓬根际交换性钠下降35 %，燕麦出苗率提高50 %，产量增加18 %。第二板斧是“防病促生”。菌株BRCB16可产生环脂肽与几丁质酶，抑制番茄立枯、棉花黄萎等病原菌，抑菌带宽达25 mm；同时分泌IAA 15 mg/L，诱导玉米侧根增加30 %，吸磷量提升20 %。新疆盐碱棉田每亩滴灌200 g菌粉，黄萎病指降低42 %，皮棉增产8.6 %。工业端，假坚强芽孢杆菌是“碱性酶工厂”。其耐碱木聚糖酶更适pH 10，90 ℃半衰期2 h，用于纸浆漂白可减少氯用量30 %；耐碱蛋白酶已列入洗涤剂助剂，低温下仍能有效分解血渍、奶渍，节能20 %。橙色红曲霉鼠伤寒沙门菌经胃入肠，在肠道内增殖，粘附于肠黏膜上皮细胞，进而侵入固有层，释放有毒物质，导致其充血。

吉氏芽孢杆菌（Bacillus gibsonii）是芽孢杆菌属中“耐热兼耐碱”的新锐成员，2004年由德国学者从堆肥超温区分离，命名源自菌种保藏家 Gibson 的姓氏。菌株呈杆状、革兰氏阳性，可形成椭圆芽孢，只适生长温度 50–55 ℃，pH 8.5–9.5，能在 10 % Na₂CO₃ 和 1 % 过氧化氢条件下存活，被视作“碱性酶工厂”的理想候选。一、耐热耐碱机制基因组编码多拷贝 Na⁺/H⁺ 逆向转运蛋白（nhaA、nhaC）与碳酸酐酶，可将胞内多余 Na⁺ 排出并维持 pH 稳态；芽孢富含钙-吡啶二羧酸复合物，赋予其 100 ℃、30 min 的耐热能力，为高温高碱工业环境提供稳定催化剂。二、工业酶宝库其耐碱普鲁兰酶只适 pH 9、70 ℃，可高效切割 α-1,6 糖苷键，用于淀粉糖化“一步法”，节省中和酸用量 20 %；耐碱木聚糖酶在 pH 10、65 ℃仍保持 85 % 活性，已用于纸浆漂白，减少氯用量 30 %，降低 AOX 排放；碱性蛋白酶则在 40 ℃、pH 11 条件下对血渍、奶渍去污力提升 35 %，为无磷洗涤剂增添绿色助剂。三、农业与环境菌株 TP-1 可产 IAA 12 mg·L⁻¹ 并溶磷 2.8 mg·L⁻¹，使玉米根系增 25 %，吸磷量提 18 %；与秸秆复配堆肥，24 h 堆温升至 65 ℃，纤维素降解率提高 28 %，堆肥周期缩短 6 d，杀灭病原菌和杂草种子效果明显。

纺锤形赖氨酸芽孢杆菌（Lysinibacillus fusiformis）是土壤里的“多面小钢炮”。菌体直杆、常成链排列，革兰氏阳性，周生鞭毛，可形成椭圆芽孢，耐干燥、耐酸碱，正面黄色、湿润小菌落，易挑取，是实验室常见模式菌株。一、绿色防控菌株CGMCC No.28950对南方根结线虫防效突出，盆栽试验虫口密度降70 %；同步产蛋白酶、几丁质酶，破坏虫卵壁，为蔬菜连作障碍提供化学杀线剂的替代方案。二、促生提质该菌溶磷量达277 mg kg⁻¹，解钾能力明显，可分泌IAA，使玉米、番茄根系增30 %，吸磷量提棚试验每亩滴灌200 g菌粉，番茄Vc含量提高12 %，糖酸比更协调，货架期延长5天。三、环境修复贵州大学团队利用菌株GZU-Lys01转化煤矸石中难溶磷钾为植物可吸收养分，制备微生物肥料；还能矿化固定垃圾焚烧底灰和尾矿中的Cd、Pb，吸附量分别达50 mg g⁻¹与35 mg g⁻¹，为矿区复垦提供低成本方案。四、工业酶潜力该菌产果胶酶活性高，可在25 ℃、pH 8条件下水解果胶，为果汁澄清、麻类脱胶提供低温酶源；耐碱蛋白酶已在洗涤剂中试用，10 ℃下去污力提升30 %，节能20 %。青铜小单孢菌是一种属于Micromonospora属的生物，Micromonospora属的生物是生物活性次级代谢物的丰富来源。

克劳氏芽孢杆菌（Bacillus clausii）是芽孢杆菌属中的“耐碱”，1915年由意大利克劳氏从碱性土壤中分离，菌体杆状、周生鞭毛，可在 pH 8–10.5、盐 0–12 % 的条件下旺盛生长，芽孢能耐受 100 ℃ 沸水 30 min，是研究极端碱适应的模式菌之一。一、耐碱机制基因组编码多拷贝 Na⁺/H⁺ 逆向转运蛋白（nhaC、mnh）与碳酸酐酶，可将胞内多余 Na⁺ 泵出并维持 pH 稳态；细胞壁肽聚糖富含 meso-二氨基庚二酸，膜脂分支化程度高，为高温高碱酶的高效表达提供稳定平台。二、工业酶宝库其耐碱蛋白酶在 pH 11、40 ℃ 仍保持 90 % 活性，已用于无磷洗涤剂，血渍、奶渍去污力提升 30 %；耐碱淀粉酶更适 pH 9、90 ℃，可在纺织退浆中省略中和步骤，节能 15 %；耐碱木聚糖酶用于纸浆漂白，氯用量减少 30 %，降低可吸附有机卤化物（AOX）排放。三、农业与环境菌株 SIN 可产 IAA 15 mg·L⁻¹ 并溶磷 2.6 mg·L⁻¹，使玉米根系增 28 %，吸磷量提 18 %；与秸秆复配堆肥，24 h 堆温升至 65 ℃，纤维素降解率提高 30 %，堆肥周期缩短 6 d。耐碱特性使其在 pH 9 的苏打盐碱土中仍能定殖，水稻产量增加 10 %。除了在环境修复中的应用，土地鞘氨醇盒菌在生态系统中也扮演着重要角色。香味类香味菌

海胆棕色小单孢菌）是一种属于Micromonospora属的微生物，主要用途为分类学研究，具体用途为模式菌株 。沉积物类诺卡氏菌

包姜氏液体培养基基础（BGA Broth Base）是为培养姜苗根茎共生促生菌而设计的富氮液体培养基，由包头师范学院与姜科作物团队共同优化，故得“包姜”之名。其配方以酪蛋白胨与大豆木瓜酶消化物提供与缓释氨基酸，酵母粉补充B族维生素和微量元素，可溶性淀粉作碳源，既避免葡萄糖过量产酸，又模拟根茎分泌物成分；特别添加0.3% K₂HPO₄与0.2% MgSO₄，缓冲能力强，可中和菌体代谢酸，维持pH 6.8–7.0，满足假单胞菌、芽孢杆菌及稀有放线菌的同步增殖。实际应用中，1 L培养基接种5 mL姜块研磨液，28℃、160 r/min振荡培养24 h，菌浓即可达2×10⁹ CFU/mL，菌液呈淡棕、微粘，带新鲜生姜清香；继续补糖发酵可产胞外多糖1.2 g/L，对番茄、辣椒具明显促根活性。若需固体分离，补加1.2%琼脂即得BGA平板，可直观观察菌落形态：有效菌株多呈乳白、边缘波状，48 h后在365 nm紫外下可见蓝绿色荧光，与16S rDNA序列联用，可在72 h内完成“功能—种属”双重鉴定。质量控制上，BGA培养基需用去离子水配制，高压灭菌后若出现轻微沉淀，为镁—磷复合物，50℃水浴摇匀即可；储存过程若液体变黄，提示淀粉水解过度，应废弃。沉积物类诺卡氏菌