水资源论证工作是项目获得取水许可证的重要依据，其目的是使取水审批更加科学合理，使各级水行政主管部门在审批取水许可时，不只要考虑到建设项目本身取水、用水的需求，而且还要兼顾到对其他用水户权益的保护，降低管理风险。为贯彻落实严格水资源管理制度及取水许可制度，建设节水型社会，根据 “以水定城、以水定地、以水定人、以水定产” 的新思路、体现生态承载力的新理念和水利部、国家计委颁布实施的《建设项目水资源论证管理办法》要求，按照“适当利用地表水、严格控制利用地下水、优先利用矿坑排水、大力开展节约用水、努力实施分质供水”的原则，对建设项目取水方案进行合理性、可行性、可靠性分析论证，以促进区域水资源的优化配置，科学合理的利用和保护水资源，实现水资源可持续利用，避免取水、退水对环境可能造成的不利影响，为相关部门办许可证以及企业用水计划提供科学依据。流域内批准取水的总耗水量不得超过本流域水资源可利用量。云南水资源论证导则
在建设项目水资源论证中，取用水方案的编制是一个重要环节，但也是一个难点问题。取用水方案的编制，必须有充分的资料和可靠的论证依据，要结合水资源现状及发展规划、国民经济和社会发展规划、行业用水定额、产业政策，对建设项目取水水源、用水方式等进行综合分析论证，提出可行的水资源开发利用方案。根据不同情况，取用水方案可分为取水水源选择、取水规模和取水量等。取水方案应当充分考虑水源地、取水口、取水量以及取水工艺等因素，使取水方案具有较高的可行性。取用水方案的编制，必须经过认真论证，使之具有较高的科学性和合理性。为进一步提高取用水方案编制质量，可以采取以下措施：（1）加强论证人员专业培训；（2）加强与用水户沟通和交流；（3）严格执行工作程序；（4）加强技术指导和质量监控。云南水资源论证导则地球上只有2.5%的是淡水。其中约69%被冰雪覆盖0.3%存在于湖泊和河流中。而这些水源又常常集中于某些地区。
水资源论证常见问题及审查重点：1、用水即对项目内部情况进行分析，主要是对用水工艺、用水指标及主要产品产量（用于计算用水定额）进行调查，研究清楚水从取水口至退水口所经过的全部流程。2、退水即对项目排水情况进行分析，主要是调查废水量、废水要经过怎样的处理流程、废水要到哪里去、废水是否会有污染及污染物的含量等情况。3、节水属于新增重点内容，以往对此部分注重不高，但随着主管部门对节水评价的重视，此部分内容在水资源论证中也应有所重视。主要调查项目节水水平，评估节水指标的先进行、节水措施的实效性、节水潜力，核定取用水规模。
农业生产取水的水资源费征收标准应当根据当地水资源条件、农村经济发展状况和促进农业节约用水需要制定。农业生产取水的水资源费征收标准应当低于其他用水的水资源费征收标准，粮食作物的水资源费征收标准应当低于经济作物的水资源费征收标准。农业生产取水的水资源费征收的步骤和范围由省、自治区、直辖市人民zheng府规定。第三十一条 水资源费由取水审批机关负责征收;其中，流域管理机构审批的水资源费由取水口所在地省、自治区、直辖市人民zheng府水行政主管部门代为征收。在建设项目水资源论证中，取用水方案的编制是一个重要环节，但也是一个难点问题。
根据《中华人民共和国水法》，水资源论证工作是建设项目审批的重要组成部分。对不具备水资源论证工作条件的建设项目，应按照国家有关规定和技术标准进行论证，并按规定报批。在特殊情况下，对不具备水资源论证工作条件的建设项目，可以简化手续、缩短审批时限、降低审批费用，并按程序报批。对于不具备水资源论证工作条件的建设项目，如确有必要开展水资源论证工作的，可采取如下措施：（一）根据《关于印发<建设项目取水许可管理办法>的通知》（水利部令第39号）要求，对于不具备水资源论证工作条件的建设项目，应委托有相应资质单位编制水资源论证报告；（二）按照《建设项目取水许可管理办法》规定和技术标准进行论证；水资源论证报告书费用是如何核算的？云南水资源论证导则
以投资核算基价为基础，乘以行业调整系数、论证等级调整系数和水源调整系数确定的。云南水资源论证导则
报告书编制费用核算方法：以建设项目取水水源类别和论证等级为主要因素的报告书编制费用核算方法（简称方法1）：以水源类别和论证等级核算基价基础，乘以行业调整系数和投资规模调整系数确定。其中，以污水再生利用和以矿坑排水为取水水源的报告书编制费用核算方法分别参照以地表水为取水水源的和以地下水为取水水源的报告书编制费用核算方法执行；以混合取水为取水水源的报告书编制费用按混合水源中论证等级高的取水水源报告书编制费用乘以调整系数1.2计算。该方法适用于论证工作量及论证难度等因素与建设项目投资规模关系不密切，报告书编制费用主要取决于水源类别和论证等级的建设项目。云南水资源论证导则
